Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G475000.4,Sobic.001G475000.3,Sobic.001G475000.2,Sobic.001G475000.5,Sobic.001G475000.1
Synonym Sb01g044505
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QQ19 , A0A1Z5SB39 , A0A1B6QQ01 , A0A1B6QPZ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G023200 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K10870: RAD51L2, RAD51-like protein 2
2 Sobic.006G192332 - -
3 Sobic.001G475200 expressed protein -
4 Sobic.003G388000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03350: APC3, anaphase-promoting complex subunit 3
5 Sobic.007G154350 - -
6 Sobic.010G002800 AGAP000326-PA, putative, expressed K18163: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 6
7 Sobic.003G166500 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G076500 protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
9 Sobic.001G097900 expressed protein -
10 Sobic.002G426100 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed -
11 Sobic.001G091200 - -
12 Sobic.009G051800 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G229300 expressed protein -
14 Sobic.004G213400 ATP8, putative, expressed -
15 Sobic.001G537100 dehydrogenase-phosphopantetheinyltransferase, putative, expressed K06133: LYS5, 4'-phosphopantetheinyl transferase
16 Sobic.007G122700 expressed protein -
17 Sobic.004G030400 expressed protein -
18 Sobic.008G072500 SAM-dependent methyltransferase, putative, expressed K18162: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 5
19 Sobic.003G256800 RNA polymerase III subunit RPC82 family protein, putative, expressed K03023: RPC3, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3
20 Sobic.002G193500 malonyl-CoA decarboxylase, mitochondrial precursor, putative, expressed K01578: malonyl-CoA decarboxylase


Gene co-expression network
sample Sobic001G475000 Sobic001G475000 Sobic003G023200 Sobic003G023200 Sobic001G475000--Sobic003G023200 Sobic006G192332 Sobic006G192332 Sobic001G475000--Sobic006G192332 Sobic001G475200 Sobic001G475200 Sobic001G475000--Sobic001G475200 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic001G475000--Sobic003G388000 Sobic007G154350 Sobic007G154350 Sobic001G475000--Sobic007G154350 Sobic010G002800 Sobic010G002800 Sobic001G475000--Sobic010G002800 Sobic003G166500 Sobic003G166500 Sobic001G475000--Sobic003G166500 Sobic002G076500 Sobic002G076500 Sobic001G475000--Sobic002G076500 Sobic001G097900 Sobic001G097900 Sobic001G475000--Sobic001G097900 Sobic002G066800 Sobic002G066800 Sobic003G023200--Sobic002G066800 Sobic006G212900 Sobic006G212900 Sobic003G023200--Sobic006G212900 Sobic010G250000 Sobic010G250000 Sobic003G023200--Sobic010G250000 Sobic003G256800 Sobic003G256800 Sobic003G023200--Sobic003G256800 Sobic003G023200--Sobic001G097900 Sobic005G087300 Sobic005G087300 Sobic003G023200--Sobic005G087300 Sobic002G426100 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Octagon: transcription factors


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