Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G051800.3,Sobic.009G051800.1,Sobic.009G051800.4,Sobic.009G051800.2
Synonym Sb09g004390
Functional annotation OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6P6L8
Pfam PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF74
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G27050 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g18560.1 : OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1B02G317600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G051800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G213400 ATP8, putative, expressed -
2 Sobic.010G024000 transketolase, chloroplast precursor, putative, expressed K00615: E2.2.1.1, tktA, transketolase
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9 Sobic.009G084800 - -
10 Sobic.010G257500 expressed protein -
11 Sobic.003G183466 - -
12 Sobic.010G165800 - -
13 Sobic.007G154350 - -
14 Sobic.001G475000 expressed protein -
15 Sobic.003G216600 BAH domain containing protein, expressed -
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17 Sobic.007G102300 formin, putative, expressed -
18 Sobic.002G286632 - -
19 Sobic.010G036901 - -
20 Sobic.001G248400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G051800 Sobic009G051800 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic009G051800--Sobic004G213400 Sobic010G024000 Sobic010G024000 Sobic009G051800--Sobic010G024000 Sobic009G084700 Sobic009G084700 Sobic009G051800--Sobic009G084700 Sobic010G009700 Sobic010G009700 Sobic009G051800--Sobic010G009700 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic009G051800--Sobic002G173400 Sobic010G038200 Sobic010G038200 Sobic009G051800--Sobic010G038200 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic009G051800--Sobic003G005500 Sobic005G060100 Sobic005G060100 Sobic009G051800--Sobic005G060100 Sobic009G084800 Sobic009G084800 Sobic009G051800--Sobic009G084800 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic004G213400--Sobic002G239400 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic004G213400--Sobic005G110547 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic004G213400--Sobic004G298600 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic004G213400--Sobic003G293400 Sobic001G248400 Sobic001G248400 Sobic004G213400--Sobic001G248400 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic004G213400--Sobic001G131900 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic004G213400--Sobic009G220700 Sobic002G308000 Sobic002G308000 Sobic004G213400--Sobic002G308000 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic004G213400--Sobic007G105700 Sobic010G222800 Sobic010G222800 Sobic010G024000--Sobic010G222800 Sobic008G131900 Sobic008G131900 Sobic010G024000--Sobic008G131900 Sobic007G076200 Sobic007G076200 Sobic010G024000--Sobic007G076200 Sobic003G411700 Sobic003G411700 Sobic010G024000--Sobic003G411700 Sobic002G271400 Sobic002G271400 Sobic010G024000--Sobic002G271400 Sobic010G024000--Sobic002G173400 Sobic006G193100 Sobic006G193100 Sobic010G024000--Sobic006G193100 Sobic003G343200 Sobic003G343200 Sobic010G024000--Sobic003G343200 Sobic002G052800 Sobic002G052800 Sobic010G024000--Sobic002G052800 Sobic009G084700--Sobic009G084800 Sobic009G084700--Sobic010G009700 Sobic002G322700 Sobic002G322700 Sobic009G084700--Sobic002G322700 Sobic002G151500 Sobic002G151500 Sobic009G084700--Sobic002G151500 Sobic008G140600 Sobic008G140600 Sobic009G084700--Sobic008G140600 Sobic009G084700--Sobic010G038200 Sobic007G146200 Sobic007G146200 Sobic009G084700--Sobic007G146200 Sobic008G188800 Sobic008G188800 Sobic009G084700--Sobic008G188800 Sobic009G084700--Sobic001G131900 Sobic010G009700--Sobic004G298600 Sobic010G009700--Sobic001G131900 Sobic010G009700--Sobic010G038200 Sobic006G189000 Sobic006G189000 Sobic010G009700--Sobic006G189000 Sobic010G009700--Sobic005G060100 Sobic009G054400 Sobic009G054400 Sobic010G009700--Sobic009G054400 Sobic010G009700--Sobic002G322700 Sobic010G009700--Sobic002G151500 Sobic007G102300 Sobic007G102300 Sobic010G009700--Sobic007G102300 Sobic002G173400--Sobic008G131900 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic002G173400--Sobic009G120400 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic002G173400--Sobic003G194800 Sobic008G047500 Sobic008G047500 Sobic002G173400--Sobic008G047500 Sobic002G173400--Sobic002G052800 Sobic002G173400--Sobic010G038200 Sobic010G143600 Sobic010G143600 Sobic002G173400--Sobic010G143600 Sobic004G000400 Sobic004G000400 Sobic002G173400--Sobic004G000400 Sobic002G173400--Sobic005G060100 Sobic009G136000 Sobic009G136000 Sobic010G038200--Sobic009G136000 Sobic010G030000 Sobic010G030000 Sobic010G038200--Sobic010G030000 Sobic010G038200--Sobic010G009700 Sobic010G038200--Sobic008G131900 Sobic010G038200--Sobic001G248400 Sobic010G038200--Sobic005G060100 Sobic009G214500 Sobic009G214500 Sobic010G038200--Sobic009G214500 Sobic003G216600 Sobic003G216600 Sobic010G038200--Sobic003G216600 Sobic010G038200--Sobic002G052800 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic003G005500--Sobic001G010500 Sobic003G005500--Sobic007G102300 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic003G005500--Sobic009G163400 Sobic003G005500--Sobic009G214500 Sobic002G339666 Sobic002G339666 Sobic003G005500--Sobic002G339666 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic003G005500--Sobic008G141900 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic003G005500--Sobic007G122700 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic003G005500--Sobic002G286632 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic003G005500--Sobic002G309100 Sobic005G060100--Sobic007G105700 Sobic005G060100--Sobic007G102300 Sobic001G385300 Sobic001G385300 Sobic005G060100--Sobic001G385300 Sobic005G060100--Sobic003G216600 Sobic001G433600 Sobic001G433600 Sobic005G060100--Sobic001G433600 Sobic005G060100--Sobic004G298600 Sobic001G117900 Sobic001G117900 Sobic005G060100--Sobic001G117900 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic005G060100--Sobic003G352900 Sobic005G060100--Sobic001G131900 Sobic009G084800--Sobic009G084700 Sobic004G313400 Sobic004G313400 Sobic009G084800--Sobic004G313400 Sobic009G084800--Sobic001G131900 Sobic009G084800--Sobic002G151500 Sobic009G084800--Sobic002G322700 Sobic009G084800--Sobic008G140600 Sobic003G396500 Sobic003G396500 Sobic009G084800--Sobic003G396500 Sobic007G141600 Sobic007G141600 Sobic009G084800--Sobic007G141600 Sobic009G066600 Sobic009G066600 Sobic009G084800--Sobic009G066600
Octagon: transcription factors


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