Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G165800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YJN8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G081800 helicase, putative, expressed K11273: DDX11, CHL1, chromosome transmission fidelity protein 1
2 Sobic.010G165900 - -
3 Sobic.007G112100 enoyl-acyl-carrier-protein reductase NADH, chloroplast precursor, expressed K00208: enoyl-[acyl-carrier protein] reductase I
4 Sobic.001G530100 hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative, expressed K01641: hydroxymethylglutaryl-CoA synthase
5 Sobic.006G095300 expressed protein -
6 Sobic.004G291200 - -
7 Sobic.001G506300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@xyloglucan galactosyltransferase KATAMARI1, putative, expressed -
8 Sobic.001G532800 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12893: splicing factor, arginine/serine-rich 4/5/6
9 Sobic.002G286632 - -
10 Sobic.001G486600 RFC4 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 4, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
11 Sobic.005G115350 - -
12 Sobic.006G126800 expressed protein K10730: ATP-dependent DNA helicase Q4
13 Sobic.002G131100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@N-rich protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G102350 - -
15 Sobic.002G101100 - -
16 Sobic.010G250400 OsSub52 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
17 Sobic.003G045450 - -
18 Sobic.001G139900 CBS domain containing protein, expressed K16302: metal transporter CNNM
19 Sobic.005G162800 expressed protein -
20 Sobic.006G127200 kelch repeat protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic009G081800 Sobic009G081800 Sobic010G165800--Sobic009G081800 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic010G165800--Sobic010G165900 Sobic007G112100 Sobic007G112100 Sobic010G165800--Sobic007G112100 Sobic001G530100 Sobic001G530100 Sobic010G165800--Sobic001G530100 Sobic006G095300 Sobic006G095300 Sobic010G165800--Sobic006G095300 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic010G165800--Sobic004G291200 Sobic001G506300 Sobic001G506300 Sobic010G165800--Sobic001G506300 Sobic001G532800 Sobic001G532800 Sobic010G165800--Sobic001G532800 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic010G165800--Sobic002G286632 Sobic006G126800 Sobic006G126800 Sobic009G081800--Sobic006G126800 Sobic010G252200 Sobic010G252200 Sobic009G081800--Sobic010G252200 Sobic003G041400 Sobic003G041400 Sobic009G081800--Sobic003G041400 Sobic006G127200 Sobic006G127200 Sobic009G081800--Sobic006G127200 Sobic009G081800--Sobic001G530100 Sobic001G239900 Sobic001G239900 Sobic009G081800--Sobic001G239900 Sobic010G269800 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Octagon: transcription factors


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