Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G101100.2,Sobic.002G101100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QA94
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G165900 - -
2 Sobic.001G318100 - -
3 Sobic.010G165700 expressed protein K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
4 Sobic.005G115350 - -
5 Sobic.005G108225 - -
6 Sobic.008G127550 - -
7 Sobic.008G090100 - -
8 Sobic.010G165800 - -
9 Sobic.008G127250 - -
10 Sobic.010G168000 - -
11 Sobic.008G120132 - -
12 Sobic.005G098900 - -
13 Sobic.006G127200 kelch repeat protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G070250 - -
15 Sobic.010G197200 peroxiredoxin, putative, expressed -
16 Sobic.010G248500 disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
17 Sobic.010G156200 - -
18 Sobic.005G127900 - -
19 Sobic.009G146250 - -
20 Sobic.002G288100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic002G101100--Sobic010G165900 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic002G101100--Sobic001G318100 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic002G101100--Sobic010G165700 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic002G101100--Sobic005G115350 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic002G101100--Sobic005G108225 Sobic008G127550 Sobic008G127550 Sobic002G101100--Sobic008G127550 Sobic008G090100 Sobic008G090100 Sobic002G101100--Sobic008G090100 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic002G101100--Sobic010G165800 Sobic008G127250 Sobic008G127250 Sobic002G101100--Sobic008G127250 Sobic010G165900--Sobic010G165700 Sobic010G165900--Sobic002G101100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic010G165900--Sobic005G098900 Sobic010G248500 Sobic010G248500 Sobic010G165900--Sobic010G248500 Sobic010G165900--Sobic001G318100 Sobic003G401800 Sobic003G401800 Sobic010G165900--Sobic003G401800 Sobic010G165900--Sobic010G165800 Sobic010G165900--Sobic008G090100 Sobic010G165900--Sobic008G127550 Sobic001G318100--Sobic010G165700 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic001G318100--Sobic010G143000 Sobic001G318100--Sobic002G101100 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic001G318100--Sobic008G120132 Sobic001G318100--Sobic010G165900 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic001G318100--Sobic005G075500 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic001G318100--Sobic009G070250 Sobic001G318100--Sobic005G108225 Sobic001G318100--Sobic008G127250 Sobic010G165700--Sobic001G318100 Sobic010G165700--Sobic010G165900 Sobic010G165700--Sobic002G101100 Sobic010G165700--Sobic005G098900 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic010G165700--Sobic005G110547 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic009G070250 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic010G165700--Sobic005G102350 Sobic010G165700--Sobic010G165800 Sobic005G115350--Sobic005G110547 Sobic005G115350--Sobic002G101100 Sobic002G240500 Sobic002G240500 Sobic005G115350--Sobic002G240500 Sobic005G115350--Sobic010G165800 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic005G115350--Sobic004G291200 Sobic005G115350--Sobic005G102350 Sobic010G257500 Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic009G070250 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic005G115350--Sobic009G178500 Sobic005G108225--Sobic005G098900 Sobic010G168000 Sobic010G168000 Sobic005G108225--Sobic010G168000 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G108225--Sobic005G127900 Sobic008G047200 Sobic008G047200 Sobic005G108225--Sobic008G047200 Sobic005G108225--Sobic010G248500 Sobic005G108225--Sobic002G101100 Sobic005G108225--Sobic001G318100 Sobic005G108225--Sobic010G165900 Sobic005G108225--Sobic008G120132 Sobic003G420300 Sobic003G420300 Sobic008G127550--Sobic003G420300 Sobic002G320600 Sobic002G320600 Sobic008G127550--Sobic002G320600 Sobic003G226700 Sobic003G226700 Sobic008G127550--Sobic003G226700 Sobic006G281400 Sobic006G281400 Sobic008G127550--Sobic006G281400 Sobic003G292700 Sobic003G292700 Sobic008G127550--Sobic003G292700 Sobic001G051300 Sobic001G051300 Sobic008G127550--Sobic001G051300 Sobic004G243900 Sobic004G243900 Sobic008G127550--Sobic004G243900 Sobic007G139500 Sobic007G139500 Sobic008G127550--Sobic007G139500 Sobic009G052100 Sobic009G052100 Sobic008G127550--Sobic009G052100 Sobic008G090100--Sobic005G098900 Sobic008G090100--Sobic010G165900 Sobic008G090100--Sobic007G139500 Sobic008G090100--Sobic008G127550 Sobic008G090100--Sobic002G101100 Sobic005G230400 Sobic005G230400 Sobic008G090100--Sobic005G230400 Sobic008G090100--Sobic005G108225 Sobic005G140100 Sobic005G140100 Sobic008G090100--Sobic005G140100 Sobic001G196000 Sobic001G196000 Sobic008G090100--Sobic001G196000 Sobic009G081800 Sobic009G081800 Sobic010G165800--Sobic009G081800 Sobic010G165800--Sobic010G165900 Sobic007G112100 Sobic007G112100 Sobic010G165800--Sobic007G112100 Sobic001G530100 Sobic001G530100 Sobic010G165800--Sobic001G530100 Sobic006G095300 Sobic006G095300 Sobic010G165800--Sobic006G095300 Sobic010G165800--Sobic004G291200 Sobic001G506300 Sobic001G506300 Sobic010G165800--Sobic001G506300 Sobic001G532800 Sobic001G532800 Sobic010G165800--Sobic001G532800 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic010G165800--Sobic002G286632 Sobic008G127250--Sobic001G318100 Sobic008G127250--Sobic010G165900 Sobic008G127250--Sobic005G108225 Sobic008G127250--Sobic002G101100 Sobic008G127250--Sobic005G098900 Sobic008G127250--Sobic010G165700 Sobic008G127250--Sobic009G070250 Sobic008G127250--Sobic010G165800 Sobic008G127250--Sobic008G047200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.