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Transcriptome id Sobic.010G156200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YJG4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G098900 - -
2 Sobic.001G507000 expressed protein -
3 Sobic.002G101100 - -
4 Sobic.010G165900 - -
5 Sobic.008G090100 - -
6 Sobic.007G139500 phosphofructokinase, putative, expressed K00850: pfkA, 6-phosphofructokinase 1
7 Sobic.002G351700 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
8 Sobic.004G321400 BRUSHY 1, putative, expressed -
9 Sobic.004G095200 Peptidase family C50, putative, expressed K02365: separase
10 Sobic.006G127200 kelch repeat protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G087000 MCM6 - Putative minichromosome maintenance MCM complex subunit 6, expressed K02542: DNA replication licensing factor MCM6
12 Sobic.008G127550 - -
13 Sobic.003G289800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
14 Sobic.006G144700 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed K10683: BRCA1-associated RING domain protein 1
15 Sobic.004G243900 E2F family transcription factor protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G118300 auxin-independent growth promoter protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G116500 decarboxylase, putative, expressed K01592: tyrosine decarboxylase
18 Sobic.005G143100 expressed protein -
19 Sobic.003G226700 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10393: KIF2_24, kinesin family member 2/24
20 Sobic.006G195500 DNA-binding protein, putative, expressed K10742: DNA replication ATP-dependent helicase Dna2


Gene co-expression network
sample Sobic010G156200 Sobic010G156200 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic010G156200--Sobic005G098900 Sobic001G507000 Sobic001G507000 Sobic010G156200--Sobic001G507000 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic010G156200--Sobic002G101100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic010G156200--Sobic010G165900 Sobic008G090100 Sobic008G090100 Sobic010G156200--Sobic008G090100 Sobic007G139500 Sobic007G139500 Sobic010G156200--Sobic007G139500 Sobic002G351700 Sobic002G351700 Sobic010G156200--Sobic002G351700 Sobic004G321400 Sobic004G321400 Sobic010G156200--Sobic004G321400 Sobic004G095200 Sobic004G095200 Sobic010G156200--Sobic004G095200 Sobic005G098900--Sobic010G165900 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic005G098900--Sobic005G108225 Sobic005G098900--Sobic008G090100 Sobic003G401800 Sobic003G401800 Sobic005G098900--Sobic003G401800 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic005G098900--Sobic010G165700 Sobic005G098900--Sobic010G156200 Sobic001G025900 Sobic001G025900 Sobic005G098900--Sobic001G025900 Sobic010G248500 Sobic010G248500 Sobic005G098900--Sobic010G248500 Sobic004G328300 Sobic004G328300 Sobic005G098900--Sobic004G328300 Sobic005G068800 Sobic005G068800 Sobic001G507000--Sobic005G068800 Sobic001G507000--Sobic004G321400 Sobic003G183700 Sobic003G183700 Sobic001G507000--Sobic003G183700 Sobic001G146900 Sobic001G146900 Sobic001G507000--Sobic001G146900 Sobic006G120600 Sobic006G120600 Sobic001G507000--Sobic006G120600 Sobic004G156200 Sobic004G156200 Sobic001G507000--Sobic004G156200 Sobic006G195500 Sobic006G195500 Sobic001G507000--Sobic006G195500 Sobic001G507000--Sobic004G095200 Sobic009G087000 Sobic009G087000 Sobic001G507000--Sobic009G087000 Sobic002G101100--Sobic010G165900 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic002G101100--Sobic001G318100 Sobic002G101100--Sobic010G165700 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic002G101100--Sobic005G115350 Sobic002G101100--Sobic005G108225 Sobic008G127550 Sobic008G127550 Sobic002G101100--Sobic008G127550 Sobic002G101100--Sobic008G090100 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic002G101100--Sobic010G165800 Sobic008G127250 Sobic008G127250 Sobic002G101100--Sobic008G127250 Sobic010G165900--Sobic010G165700 Sobic010G165900--Sobic002G101100 Sobic010G165900--Sobic005G098900 Sobic010G165900--Sobic010G248500 Sobic010G165900--Sobic001G318100 Sobic010G165900--Sobic003G401800 Sobic010G165900--Sobic010G165800 Sobic010G165900--Sobic008G090100 Sobic010G165900--Sobic008G127550 Sobic008G090100--Sobic005G098900 Sobic008G090100--Sobic010G165900 Sobic008G090100--Sobic007G139500 Sobic008G090100--Sobic008G127550 Sobic008G090100--Sobic002G101100 Sobic005G230400 Sobic005G230400 Sobic008G090100--Sobic005G230400 Sobic008G090100--Sobic005G108225 Sobic005G140100 Sobic005G140100 Sobic008G090100--Sobic005G140100 Sobic001G196000 Sobic001G196000 Sobic008G090100--Sobic001G196000 Sobic007G139500--Sobic001G196000 Sobic001G051300 Sobic001G051300 Sobic007G139500--Sobic001G051300 Sobic009G206500 Sobic009G206500 Sobic007G139500--Sobic009G206500 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic007G139500--Sobic001G437500 Sobic003G179500 Sobic003G179500 Sobic007G139500--Sobic003G179500 Sobic001G103000 Sobic001G103000 Sobic007G139500--Sobic001G103000 Sobic003G017500 Sobic003G017500 Sobic007G139500--Sobic003G017500 Sobic002G191000 Sobic002G191000 Sobic007G139500--Sobic002G191000 Sobic009G214100 Sobic009G214100 Sobic007G139500--Sobic009G214100 Sobic003G226700 Sobic003G226700 Sobic002G351700--Sobic003G226700 Sobic002G351700--Sobic004G321400 Sobic003G289800 Sobic003G289800 Sobic002G351700--Sobic003G289800 Sobic002G351700--Sobic001G051300 Sobic001G123100 Sobic001G123100 Sobic002G351700--Sobic001G123100 Sobic003G412800 Sobic003G412800 Sobic002G351700--Sobic003G412800 Sobic003G292700 Sobic003G292700 Sobic002G351700--Sobic003G292700 Sobic003G420300 Sobic003G420300 Sobic002G351700--Sobic003G420300 Sobic002G383100 Sobic002G383100 Sobic002G351700--Sobic002G383100 Sobic004G321400--Sobic003G183700 Sobic004G321400--Sobic009G087000 Sobic005G110535 Sobic005G110535 Sobic004G321400--Sobic005G110535 Sobic002G290000 Sobic002G290000 Sobic004G321400--Sobic002G290000 Sobic003G369200 Sobic003G369200 Sobic004G321400--Sobic003G369200 Sobic008G129200 Sobic008G129200 Sobic004G321400--Sobic008G129200 Sobic004G321400--Sobic004G095200 Sobic009G172950 Sobic009G172950 Sobic004G321400--Sobic009G172950 Sobic004G331600 Sobic004G331600 Sobic004G321400--Sobic004G331600 Sobic004G095200--Sobic004G321400 Sobic004G095200--Sobic005G110535 Sobic004G095200--Sobic004G156200 Sobic004G095200--Sobic002G290000 Sobic004G095200--Sobic005G068800 Sobic002G113400 Sobic002G113400 Sobic004G095200--Sobic002G113400 Sobic003G118100 Sobic003G118100 Sobic004G095200--Sobic003G118100 Sobic004G095200--Sobic009G087000 Sobic003G315700 Sobic003G315700 Sobic004G095200--Sobic003G315700
Octagon: transcription factors


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