Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G288100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QDZ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G291200 - -
2 Sobic.008G175400 U-box domain-containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G187600 expressed protein -
4 Sobic.005G102800 OsSCP48 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
5 Sobic.009G031800 - -
6 Sobic.004G253500 auxin-independent growth promoter protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G226000 expressed protein -
8 Sobic.008G178566 - -
9 Sobic.002G168000 expressed protein -
10 Sobic.003G102700 exostosin family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G187700 retinoblastoma-related protein-like, putative, expressed K04681: retinoblastoma-like protein 1
12 Sobic.002G240500 disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
13 Sobic.004G123200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
14 Sobic.004G222200 - -
15 Sobic.003G001800 expressed protein -
16 Sobic.008G059900 2-oxo acid dehydrogenases acyltransferase domain containing protein, expressed K00627: DLAT, aceF, pyruvate dehydrogenase E2 component (dihydrolipoamide acetyltransferase)
17 Sobic.009G119800 GASR5 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
18 Sobic.004G269100 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
19 Sobic.002G055800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
20 Sobic.010G165800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G288100 Sobic002G288100 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic002G288100--Sobic004G291200 Sobic008G175400 Sobic008G175400 Sobic002G288100--Sobic008G175400 Sobic002G187600 Sobic002G187600 Sobic002G288100--Sobic002G187600 Sobic005G102800 Sobic005G102800 Sobic002G288100--Sobic005G102800 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic002G288100--Sobic009G031800 Sobic004G253500 Sobic004G253500 Sobic002G288100--Sobic004G253500 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic002G288100--Sobic006G226000 Sobic008G178566 Sobic008G178566 Sobic002G288100--Sobic008G178566 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic002G288100--Sobic002G168000 Sobic004G123200 Sobic004G123200 Sobic004G291200--Sobic004G123200 Sobic009G012500 Sobic009G012500 Sobic004G291200--Sobic009G012500 Sobic010G024600 Sobic010G024600 Sobic004G291200--Sobic010G024600 Sobic002G266300 Sobic002G266300 Sobic004G291200--Sobic002G266300 Sobic006G217800 Sobic006G217800 Sobic004G291200--Sobic006G217800 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic004G291200--Sobic009G241900 Sobic005G078132 Sobic005G078132 Sobic004G291200--Sobic005G078132 Sobic005G021000 Sobic005G021000 Sobic004G291200--Sobic005G021000 Sobic003G427200 Sobic003G427200 Sobic004G291200--Sobic003G427200 Sobic007G192200 Sobic007G192200 Sobic008G175400--Sobic007G192200 Sobic008G175400--Sobic002G168000 Sobic008G175400--Sobic004G291200 Sobic003G326500 Sobic003G326500 Sobic008G175400--Sobic003G326500 Sobic003G102700 Sobic003G102700 Sobic008G175400--Sobic003G102700 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic008G175400--Sobic005G153000 Sobic009G225700 Sobic009G225700 Sobic008G175400--Sobic009G225700 Sobic008G175400--Sobic008G178566 Sobic010G257000 Sobic010G257000 Sobic008G175400--Sobic010G257000 Sobic002G095300 Sobic002G095300 Sobic002G187600--Sobic002G095300 Sobic008G118100 Sobic008G118100 Sobic002G187600--Sobic008G118100 Sobic007G050800 Sobic007G050800 Sobic002G187600--Sobic007G050800 Sobic002G187600--Sobic003G102700 Sobic004G286200 Sobic004G286200 Sobic002G187600--Sobic004G286200 Sobic008G090400 Sobic008G090400 Sobic002G187600--Sobic008G090400 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic002G187600--Sobic007G187700 Sobic001G199500 Sobic001G199500 Sobic002G187600--Sobic001G199500 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic002G187600--Sobic003G290400 Sobic005G102800--Sobic003G102700 Sobic005G102800--Sobic007G192200 Sobic004G269100 Sobic004G269100 Sobic005G102800--Sobic004G269100 Sobic005G102800--Sobic006G226000 Sobic009G119800 Sobic009G119800 Sobic005G102800--Sobic009G119800 Sobic003G140800 Sobic003G140800 Sobic005G102800--Sobic003G140800 Sobic001G381000 Sobic001G381000 Sobic005G102800--Sobic001G381000 Sobic004G244200 Sobic004G244200 Sobic005G102800--Sobic004G244200 Sobic005G102800--Sobic009G031800 Sobic009G031800--Sobic006G226000 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic009G031800--Sobic007G160400 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic009G031800--Sobic010G037901 Sobic009G031800--Sobic009G012500 Sobic005G126701 Sobic005G126701 Sobic009G031800--Sobic005G126701 Sobic001G254700 Sobic001G254700 Sobic009G031800--Sobic001G254700 Sobic006G083900 Sobic006G083900 Sobic009G031800--Sobic006G083900 Sobic007G025600 Sobic007G025600 Sobic009G031800--Sobic007G025600 Sobic001G534200 Sobic001G534200 Sobic009G031800--Sobic001G534200 Sobic003G078300 Sobic003G078300 Sobic004G253500--Sobic003G078300 Sobic001G461800 Sobic001G461800 Sobic004G253500--Sobic001G461800 Sobic003G250000 Sobic003G250000 Sobic004G253500--Sobic003G250000 Sobic003G259500 Sobic003G259500 Sobic004G253500--Sobic003G259500 Sobic008G059900 Sobic008G059900 Sobic004G253500--Sobic008G059900 Sobic003G024000 Sobic003G024000 Sobic004G253500--Sobic003G024000 Sobic009G002900 Sobic009G002900 Sobic004G253500--Sobic009G002900 Sobic004G253500--Sobic001G199500 Sobic004G253500--Sobic003G102700 Sobic006G226000--Sobic009G031800 Sobic006G226000--Sobic007G160400 Sobic006G226000--Sobic010G037901 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic006G226000--Sobic002G055800 Sobic002G256900 Sobic002G256900 Sobic006G226000--Sobic002G256900 Sobic006G226000--Sobic004G123200 Sobic003G086800 Sobic003G086800 Sobic006G226000--Sobic003G086800 Sobic002G240000 Sobic002G240000 Sobic006G226000--Sobic002G240000 Sobic001G136400 Sobic001G136400 Sobic006G226000--Sobic001G136400 Sobic008G178533 Sobic008G178533 Sobic008G178566--Sobic008G178533 Sobic008G178566--Sobic009G012500 Sobic008G178566--Sobic007G160400 Sobic008G178566--Sobic006G226000 Sobic008G178566--Sobic004G291200 Sobic008G178566--Sobic004G123200 Sobic010G179300 Sobic010G179300 Sobic008G178566--Sobic010G179300 Sobic008G178566--Sobic006G083900 Sobic008G178566--Sobic001G534200 Sobic002G168000--Sobic007G187700 Sobic002G168000--Sobic005G153000 Sobic002G021200 Sobic002G021200 Sobic002G168000--Sobic002G021200 Sobic006G281900 Sobic006G281900 Sobic002G168000--Sobic006G281900 Sobic006G275500 Sobic006G275500 Sobic002G168000--Sobic006G275500 Sobic009G188900 Sobic009G188900 Sobic002G168000--Sobic009G188900 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic002G168000--Sobic009G077300 Sobic006G016700 Sobic006G016700 Sobic002G168000--Sobic006G016700 Sobic001G104500 Sobic001G104500 Sobic002G168000--Sobic001G104500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.