Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G175400.2,Sobic.008G175400.5,Sobic.008G175400.4,Sobic.008G175400.1,Sobic.008G175400.3
Synonym
Functional annotation U-box domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PEA4 , A0A1B6PEA0 , A0A1Z5R7B2 , A0A1Z5R7A5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g30470.1 : U-box domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G192200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LTPL80 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
2 Sobic.002G168000 expressed protein -
3 Sobic.004G291200 - -
4 Sobic.003G326500 apurinic endonuclease-redox protein, putative, expressed K01142: E3.1.11.2, exodeoxyribonuclease III
5 Sobic.003G102700 exostosin family protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G153000 agenet domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G225700 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K00264: glutamate synthase (NADH)
8 Sobic.008G178566 - -
9 Sobic.010G257000 two-component response regulator, putative, expressed -
10 Sobic.009G177200 glycosyl transferase, family 8, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
11 Sobic.005G102800 OsSCP48 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
12 Sobic.002G288100 - -
13 Sobic.002G095300 deoxynucleoside kinase family, putative, expressed K00893: deoxycitidine kinase
14 Sobic.004G269100 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
15 Sobic.003G140800 expressed protein -
16 Sobic.003G129500 argonaute, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
17 Sobic.002G187600 expressed protein -
18 Sobic.010G143600 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G097500 DNA polymerase lambda, putative, expressed K03512: DNA polymerase lambda
20 Sobic.005G036200 protein of unknown function containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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