Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G326500.1
Synonym ARP
Functional annotation apurinic endonuclease-redox protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q6M5
Pfam PF02037 PF03372
Panther DB PTHR22748 PTHR22748:SF8
NCBI CDD KOG1294; Apurinic/apyrimidinic endonuclease and related enzymes
KEGG Orthology K01142; E3.1.11.2, exodeoxyribonuclease III
Gene Ontology GO:0006281; DNA repair GO:0004518nuclease activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G41460 : apurinic endonuclease-redox protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g58680.1 : apurinic endonuclease-redox protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034375
Brachypodium PNT73043
Barley HORVU6Hr1G068190.12 , HORVU6Hr1G068190.10 , HORVU6Hr1G068190.11 , HORVU6Hr1G068190.8 , HORVU6Hr1G068190.9 , HORVU6Hr1G068190.2 , HORVU6Hr1G068190.3 , HORVU6Hr1G068190.5 , HORVU6Hr1G068190.6 , HORVU6Hr1G068190.7 , HORVU3Hr1G078490.5 , HORVU3Hr1G078490.4 , HORVU3Hr1G078490.7 , HORVU3Hr1G078490.6 , HORVU3Hr1G078490.1 , HORVU3Hr1G078490.3 , HORVU3Hr1G078490.2
Wheat TraesCS3A02G330300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic003G326500 Sobic003G326500 Sobic003G183466 Sobic003G183466 Sobic003G326500--Sobic003G183466 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic003G326500--Sobic009G178500 Sobic002G095300 Sobic002G095300 Sobic003G326500--Sobic002G095300 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic003G326500--Sobic008G141900 Sobic007G082000 Sobic007G082000 Sobic003G326500--Sobic007G082000 Sobic002G383700 Sobic002G383700 Sobic003G326500--Sobic002G383700 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic003G326500--Sobic004G291200 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic003G326500--Sobic002G286632 Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic003G326500--Sobic003G045450 Sobic003G183466--Sobic003G326500 Sobic010G143600 Sobic010G143600 Sobic003G183466--Sobic010G143600 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic003G183466--Sobic002G173400 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic003G183466--Sobic003G129500 Sobic004G278900 Sobic004G278900 Sobic003G183466--Sobic004G278900 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic003G183466--Sobic009G120400 Sobic003G183466--Sobic002G095300 Sobic003G183466--Sobic002G286632 Sobic008G046200 Sobic008G046200 Sobic003G183466--Sobic008G046200 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic009G178500--Sobic003G275400 Sobic004G215200 Sobic004G215200 Sobic009G178500--Sobic004G215200 Sobic009G178500--Sobic003G326500 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic009G178500--Sobic009G168200 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic009G178500--Sobic009G163400 Sobic009G178500--Sobic008G141900 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic009G178500--Sobic001G485500 Sobic003G379900 Sobic003G379900 Sobic009G178500--Sobic003G379900 Sobic009G178500--Sobic002G286632 Sobic002G187600 Sobic002G187600 Sobic002G095300--Sobic002G187600 Sobic010G087100 Sobic010G087100 Sobic002G095300--Sobic010G087100 Sobic002G021200 Sobic002G021200 Sobic002G095300--Sobic002G021200 Sobic002G123600 Sobic002G123600 Sobic002G095300--Sobic002G123600 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic002G095300--Sobic007G187700 Sobic008G118100 Sobic008G118100 Sobic002G095300--Sobic008G118100 Sobic008G090400 Sobic008G090400 Sobic002G095300--Sobic008G090400 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic002G095300--Sobic002G168000 Sobic006G126800 Sobic006G126800 Sobic002G095300--Sobic006G126800 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic009G224300 Sobic009G224300 Sobic007G082000--Sobic009G224300 Sobic007G082000--Sobic003G326500 Sobic010G214800 Sobic010G214800 Sobic007G082000--Sobic010G214800 Sobic004G200700 Sobic004G200700 Sobic007G082000--Sobic004G200700 Sobic006G262501 Sobic006G262501 Sobic007G082000--Sobic006G262501 Sobic007G050900 Sobic007G050900 Sobic007G082000--Sobic007G050900 Sobic002G367200 Sobic002G367200 Sobic007G082000--Sobic002G367200 Sobic003G184666 Sobic003G184666 Sobic007G082000--Sobic003G184666 Sobic002G266300 Sobic002G266300 Sobic007G082000--Sobic002G266300 Sobic002G383700--Sobic003G275400 Sobic001G499500 Sobic001G499500 Sobic002G383700--Sobic001G499500 Sobic002G383700--Sobic009G163400 Sobic002G383700--Sobic008G141900 Sobic002G383700--Sobic001G376501 Sobic002G383700--Sobic001G485500 Sobic002G383700--Sobic009G168200 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic002G383700--Sobic008G121501 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic002G383700--Sobic001G053350 Sobic004G123200 Sobic004G123200 Sobic004G291200--Sobic004G123200 Sobic009G012500 Sobic009G012500 Sobic004G291200--Sobic009G012500 Sobic010G024600 Sobic010G024600 Sobic004G291200--Sobic010G024600 Sobic004G291200--Sobic002G266300 Sobic006G217800 Sobic006G217800 Sobic004G291200--Sobic006G217800 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic004G291200--Sobic009G241900 Sobic005G078132 Sobic005G078132 Sobic004G291200--Sobic005G078132 Sobic005G021000 Sobic005G021000 Sobic004G291200--Sobic005G021000 Sobic003G427200 Sobic003G427200 Sobic004G291200--Sobic003G427200 Sobic002G286632--Sobic009G168200 Sobic006G081700 Sobic006G081700 Sobic002G286632--Sobic006G081700 Sobic002G286632--Sobic009G163400 Sobic005G034200 Sobic005G034200 Sobic002G286632--Sobic005G034200 Sobic002G286632--Sobic008G141900 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic002G286632--Sobic003G005500 Sobic002G286632--Sobic001G010500 Sobic002G286632--Sobic002G173400 Sobic008G180200 Sobic008G180200 Sobic002G286632--Sobic008G180200 Sobic003G045450--Sobic008G141900 Sobic003G045450--Sobic001G376501 Sobic003G204100 Sobic003G204100 Sobic003G045450--Sobic003G204100 Sobic003G045450--Sobic005G212201 Sobic003G045450--Sobic009G163400 Sobic003G045450--Sobic004G276000 Sobic003G045450--Sobic002G064800 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic003G045450--Sobic007G122700 Sobic003G045450--Sobic001G010500
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