Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G045450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVS9
Pfam -
Panther DB PTHR21235 PTHR21235:SF23
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G36230 : Aldolase-type TIM barrel family protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002894 , Zm00025a043629
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1D02G250600 , TraesCS1B02G261600 , TraesCS1A02G251000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.001G376501 - -
3 Sobic.003G204100 expressed protein -
4 Sobic.005G212201 - -
5 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G276000 - -
7 Sobic.002G064800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
8 Sobic.007G122700 expressed protein -
9 Sobic.001G010500 frigida, putative, expressed -
10 Sobic.003G005500 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G046000 expressed protein -
12 Sobic.004G222150 - -
13 Sobic.010G211200 ZOS6-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
14 Sobic.001G530100 hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative, expressed K01641: hydroxymethylglutaryl-CoA synthase
15 Sobic.001G257650 - -
16 Sobic.004G298000 transporter, major facilitator family, putative, expressed K13783: MFS transporter, OPA family, solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1/2
17 Sobic.002G339666 - K04718: sphingosine kinase
18 Sobic.010G252200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G309100 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G210500 - K10901: BLM, RECQL3, bloom syndrome protein


Gene co-expression network
sample Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic003G045450--Sobic008G141900 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic003G045450--Sobic001G376501 Sobic003G204100 Sobic003G204100 Sobic003G045450--Sobic003G204100 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic003G045450--Sobic005G212201 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic003G045450--Sobic009G163400 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic003G045450--Sobic004G276000 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic003G045450--Sobic002G064800 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic003G045450--Sobic007G122700 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic003G045450--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic001G376501--Sobic002G064800 Sobic001G376501--Sobic009G163400 Sobic001G376501--Sobic008G141900 Sobic001G376501--Sobic001G257650 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic001G010500 Sobic001G376501--Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic003G275400 Sobic008G047500 Sobic008G047500 Sobic003G204100--Sobic008G047500 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic003G204100--Sobic003G194800 Sobic003G204100--Sobic003G045450 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic003G204100--Sobic004G298600 Sobic008G085950 Sobic008G085950 Sobic003G204100--Sobic008G085950 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic003G204100--Sobic002G173400 Sobic010G143600 Sobic010G143600 Sobic003G204100--Sobic010G143600 Sobic001G117900 Sobic001G117900 Sobic003G204100--Sobic001G117900 Sobic007G102000 Sobic007G102000 Sobic003G204100--Sobic007G102000 Sobic005G212201--Sobic002G064800 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic005G212201--Sobic008G191700 Sobic005G212201--Sobic001G376501 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic005G212201--Sobic005G206100 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic005G212201--Sobic010G211200 Sobic005G212201--Sobic008G141900 Sobic005G212201--Sobic004G276000 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic005G212201--Sobic009G241900 Sobic004G222150 Sobic004G222150 Sobic005G212201--Sobic004G222150 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic009G168200 Sobic004G276000--Sobic002G064800 Sobic004G276000--Sobic005G212201 Sobic004G276000--Sobic001G376501 Sobic004G276000--Sobic008G141900 Sobic004G276000--Sobic009G163400 Sobic004G276000--Sobic008G191700 Sobic004G276000--Sobic005G206100 Sobic004G276000--Sobic004G222150 Sobic004G276000--Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic005G212201 Sobic002G064800--Sobic001G376501 Sobic002G064800--Sobic008G191700 Sobic002G064800--Sobic005G206100 Sobic002G064800--Sobic004G276000 Sobic002G064800--Sobic008G141900 Sobic002G064800--Sobic009G163400 Sobic002G064800--Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic003G275400 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic007G122700--Sobic003G005500 Sobic007G122700--Sobic009G163400 Sobic007G122700--Sobic008G141900 Sobic007G122700--Sobic003G045450 Sobic007G122700--Sobic001G010500 Sobic007G122700--Sobic004G276000 Sobic007G122700--Sobic001G376501 Sobic008G046200 Sobic008G046200 Sobic007G122700--Sobic008G046200 Sobic006G119900 Sobic006G119900 Sobic007G122700--Sobic006G119900 Sobic001G010500--Sobic009G163400 Sobic001G010500--Sobic002G309100 Sobic001G010500--Sobic001G376501 Sobic001G010500--Sobic008G141900 Sobic001G010500--Sobic001G257650 Sobic003G009000 Sobic003G009000 Sobic001G010500--Sobic003G009000 Sobic001G130600 Sobic001G130600 Sobic001G010500--Sobic001G130600 Sobic001G010500--Sobic008G121501 Sobic001G010500--Sobic003G005500
Octagon: transcription factors


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