Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G046000.2,Sobic.008G046000.4,Sobic.008G046000.5
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PC16 , A0A1Z5R5Q3
Pfam -
Panther DB PTHR33304 PTHR33304:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g03180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.005G212201 - -
3 Sobic.002G064800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
4 Sobic.004G276000 - -
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7 Sobic.003G045450 - -
8 Sobic.008G191700 - -
9 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G222150 - -
11 Sobic.004G298000 transporter, major facilitator family, putative, expressed K13783: MFS transporter, OPA family, solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1/2
12 Sobic.005G206100 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.009G241900 oleosin, putative, expressed -
14 Sobic.003G275400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G122700 expressed protein -
16 Sobic.004G033200 expressed protein -
17 Sobic.005G092301 - -
18 Sobic.002G383700 4-alpha-glucanotransferase, chloroplast precursor, putative, expressed K00705: 4-alpha-glucanotransferase
19 Sobic.003G427000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
20 Sobic.001G257650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G046000 Sobic008G046000 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic008G046000--Sobic008G141900 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic008G046000--Sobic005G212201 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic008G046000--Sobic002G064800 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic008G046000--Sobic004G276000 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic008G046000--Sobic001G376501 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic008G046000--Sobic010G211200 Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic008G046000--Sobic003G045450 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic008G046000--Sobic008G191700 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic008G046000--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic005G212201--Sobic002G064800 Sobic005G212201--Sobic008G191700 Sobic005G212201--Sobic001G376501 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic005G212201--Sobic005G206100 Sobic005G212201--Sobic010G211200 Sobic005G212201--Sobic008G141900 Sobic005G212201--Sobic004G276000 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic005G212201--Sobic009G241900 Sobic004G222150 Sobic004G222150 Sobic005G212201--Sobic004G222150 Sobic002G064800--Sobic005G212201 Sobic002G064800--Sobic001G376501 Sobic002G064800--Sobic008G191700 Sobic002G064800--Sobic005G206100 Sobic002G064800--Sobic004G276000 Sobic002G064800--Sobic008G141900 Sobic002G064800--Sobic009G163400 Sobic002G064800--Sobic010G211200 Sobic002G064800--Sobic003G275400 Sobic004G276000--Sobic002G064800 Sobic004G276000--Sobic005G212201 Sobic004G276000--Sobic001G376501 Sobic004G276000--Sobic008G141900 Sobic004G276000--Sobic009G163400 Sobic004G276000--Sobic008G191700 Sobic004G276000--Sobic005G206100 Sobic004G276000--Sobic004G222150 Sobic004G276000--Sobic010G211200 Sobic001G376501--Sobic002G064800 Sobic001G376501--Sobic009G163400 Sobic001G376501--Sobic008G141900 Sobic001G376501--Sobic001G257650 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic001G010500 Sobic001G376501--Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic003G275400 Sobic010G211200--Sobic004G222150 Sobic010G211200--Sobic009G241900 Sobic010G211200--Sobic008G191700 Sobic003G427000 Sobic003G427000 Sobic010G211200--Sobic003G427000 Sobic010G211200--Sobic005G212201 Sobic010G211200--Sobic002G064800 Sobic010G211200--Sobic005G206100 Sobic003G285900 Sobic003G285900 Sobic010G211200--Sobic003G285900 Sobic001G393101 Sobic001G393101 Sobic010G211200--Sobic001G393101 Sobic003G045450--Sobic008G141900 Sobic003G045450--Sobic001G376501 Sobic003G204100 Sobic003G204100 Sobic003G045450--Sobic003G204100 Sobic003G045450--Sobic005G212201 Sobic003G045450--Sobic009G163400 Sobic003G045450--Sobic004G276000 Sobic003G045450--Sobic002G064800 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic003G045450--Sobic007G122700 Sobic003G045450--Sobic001G010500 Sobic008G191700--Sobic009G241900 Sobic008G191700--Sobic002G064800 Sobic008G191700--Sobic010G211200 Sobic008G191700--Sobic003G427000 Sobic008G191700--Sobic005G206100 Sobic008G191700--Sobic005G212201 Sobic008G191700--Sobic004G222150 Sobic008G191700--Sobic004G276000 Sobic008G191700--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic009G168200
Octagon: transcription factors


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