Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G383700.1
Synonym Sb02g040000, DPE1
Functional annotation 4-alpha-glucanotransferase, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6QFS0
Pfam PF02446
Panther DB PTHR32438 PTHR32438:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00705; 4-alpha-glucanotransferase
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:00041344-alpha-glucanotransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G64860 : disproportionating enzyme
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g43390.1 : 4-alpha-glucanotransferase, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048828
Brachypodium KQK15119
Barley HORVU2Hr1G028940.3 , HORVU2Hr1G028940.2 , HORVU2Hr1G028940.4 , HORVU2Hr1G028940.20 , HORVU2Hr1G028940.9 , HORVU2Hr1G028940.8 , HORVU2Hr1G028940.1 , HORVU2Hr1G028940.7 , HORVU2Hr1G028940.6 , HORVU2Hr1G028940.5 , HORVU2Hr1G028940.19 , HORVU2Hr1G028940.18 , HORVU2Hr1G028940.13 , HORVU2Hr1G028940.12 , HORVU2Hr1G028940.11 , HORVU2Hr1G028940.10 , HORVU2Hr1G028940.17 , HORVU2Hr1G028940.16 , HORVU2Hr1G028940.15 , HORVU2Hr1G028940.14
Wheat TraesCS2A02G159300 , TraesCS2D02G166600 , TraesCS2B02G184900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G383700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G086600 indole-3-glycerol phosphate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K01609: indole-3-glycerol phosphate synthase


Gene co-expression network
sample Sobic002G383700 Sobic002G383700 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic002G383700--Sobic003G275400 Sobic001G499500 Sobic001G499500 Sobic002G383700--Sobic001G499500 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic002G383700--Sobic009G163400 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic002G383700--Sobic008G141900 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic002G383700--Sobic001G376501 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic002G383700--Sobic001G485500 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic002G383700--Sobic009G168200 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic002G383700--Sobic008G121501 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic002G383700--Sobic001G053350 Sobic003G275400--Sobic009G168200 Sobic003G275400--Sobic009G163400 Sobic003G275400--Sobic001G376501 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic003G275400--Sobic002G064800 Sobic003G275400--Sobic008G141900 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic003G275400--Sobic008G191700 Sobic003G275400--Sobic008G121501 Sobic003G275400--Sobic001G485500 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic003G275400--Sobic005G206100 Sobic010G062900 Sobic010G062900 Sobic001G499500--Sobic010G062900 Sobic006G050100 Sobic006G050100 Sobic001G499500--Sobic006G050100 Sobic004G215200 Sobic004G215200 Sobic001G499500--Sobic004G215200 Sobic008G141100 Sobic008G141100 Sobic001G499500--Sobic008G141100 Sobic001G499500--Sobic002G383700 Sobic007G086600 Sobic007G086600 Sobic001G499500--Sobic007G086600 Sobic003G022000 Sobic003G022000 Sobic001G499500--Sobic003G022000 Sobic001G499500--Sobic001G053350 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic001G499500--Sobic010G255400 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic001G376501--Sobic002G064800 Sobic001G376501--Sobic009G163400 Sobic001G376501--Sobic008G141900 Sobic001G376501--Sobic001G257650 Sobic001G376501--Sobic008G121501 Sobic001G376501--Sobic005G212201 Sobic001G376501--Sobic001G010500 Sobic001G376501--Sobic004G276000 Sobic001G376501--Sobic003G275400 Sobic001G485500--Sobic001G053350 Sobic001G485500--Sobic004G215200 Sobic001G485500--Sobic003G275400 Sobic001G485500--Sobic010G255400 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic001G485500--Sobic010G036901 Sobic001G485500--Sobic009G168200 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic001G485500--Sobic005G201200 Sobic001G485500--Sobic009G163400 Sobic001G485500--Sobic010G062900 Sobic009G168200--Sobic003G275400 Sobic009G168200--Sobic008G141900 Sobic009G168200--Sobic009G163400 Sobic009G168200--Sobic001G376501 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic009G168200--Sobic002G286632 Sobic009G168200--Sobic001G010500 Sobic006G081700 Sobic006G081700 Sobic009G168200--Sobic006G081700 Sobic009G168200--Sobic002G064800 Sobic009G168200--Sobic005G212201 Sobic008G121501--Sobic001G376501 Sobic008G121501--Sobic009G163400 Sobic003G009000 Sobic003G009000 Sobic008G121501--Sobic003G009000 Sobic008G121501--Sobic001G257650 Sobic008G121501--Sobic002G309100 Sobic008G121501--Sobic001G010500 Sobic001G130600 Sobic001G130600 Sobic008G121501--Sobic001G130600 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic008G121501--Sobic009G098700 Sobic001G485700 Sobic001G485700 Sobic008G121501--Sobic001G485700 Sobic001G053350--Sobic001G485500 Sobic001G053350--Sobic004G215200 Sobic001G053350--Sobic010G255400 Sobic001G053350--Sobic005G201200 Sobic001G053350--Sobic008G121501 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic001G053350--Sobic008G007800 Sobic001G075200 Sobic001G075200 Sobic001G053350--Sobic001G075200 Sobic009G050800 Sobic009G050800 Sobic001G053350--Sobic009G050800 Sobic001G053350--Sobic010G036901
Octagon: transcription factors


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