Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G053350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5WX33
Pfam PF16487 PF16488 PF08699 PF02170
Panther DB PTHR22891 PTHR22891:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G48410 : Stabilizer of iron transporter SufD / Polynucleotidyl transferase
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g58600.1 : PAZ domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057453 , Zm00025a016559
Brachypodium PNT73963 , PNT73966 , PNT73965 , PNT73964 , PNT73819 , PNT73818 , PNT73817 , KQK12183 , KQK12181
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G485500 - -
2 Sobic.004G215200 expressed protein -
3 Sobic.010G255400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@histone acetyltransferase HAC1, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
4 Sobic.005G201200 - -
5 Sobic.008G121501 - -
6 Sobic.008G007800 - -
7 Sobic.001G075200 - -
8 Sobic.009G050800 - -
9 Sobic.010G036901 - -
10 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
11 Sobic.001G499500 la domain containing protein, putative, expressed K18757: la-related protein 1
12 Sobic.010G062900 expressed protein -
13 Sobic.008G041300 - K14777: DDX47, ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
14 Sobic.002G016000 OsFBL32 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.002G309100 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G275400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G485700 DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
18 Sobic.009G168200 expressed protein -
19 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G392700 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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