Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G007800.3,Sobic.008G007800.1,Sobic.008G007800.2,Sobic.008G007800.4
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5F4 , A0A1B6PBG3 , A0A1Z5R4B6 , A0A1B6PAK4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g10120.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
2 Sobic.005G201200 - -
3 Sobic.009G048700 expressed protein -
4 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
5 Sobic.009G006700 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K02155: ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
6 Sobic.009G145000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
7 Sobic.010G255400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@histone acetyltransferase HAC1, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
8 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
9 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
10 Sobic.003G005700 AGC_PVPK_like_kin82y.4 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
11 Sobic.010G061600 - -
12 Sobic.007G219601 - -
13 Sobic.008G155700 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
14 Sobic.010G198400 expressed protein -
15 Sobic.007G109301 - -
16 Sobic.007G094700 - -
17 Sobic.004G020200 expressed protein -
18 Sobic.004G203150 - -
19 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
20 Sobic.005G220250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic008G007800--Sobic004G064800 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic008G007800--Sobic005G201200 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic008G007800--Sobic009G048700 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic008G007800--Sobic006G199500 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic008G007800--Sobic009G006700 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic008G007800--Sobic009G145000 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic008G007800--Sobic010G255400 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic008G007800--Sobic002G243400 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic008G007800--Sobic009G008000 Sobic004G064800--Sobic008G007800 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic004G064800--Sobic002G304500 Sobic004G064800--Sobic005G201200 Sobic004G064800--Sobic010G255400 Sobic004G064800--Sobic006G199500 Sobic004G064800--Sobic009G048700 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic004G064800--Sobic008G007700 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic004G064800--Sobic002G016000 Sobic004G064800--Sobic009G006700 Sobic005G201200--Sobic002G016000 Sobic005G201200--Sobic008G007800 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic005G201200--Sobic006G038700 Sobic005G201200--Sobic004G064800 Sobic005G201200--Sobic009G006700 Sobic005G201200--Sobic010G255400 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic005G201200--Sobic002G066700 Sobic005G201200--Sobic002G304500 Sobic002G147400 Sobic002G147400 Sobic005G201200--Sobic002G147400 Sobic009G048700--Sobic009G008000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic009G048700--Sobic001G417700 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic009G145000 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic009G048700--Sobic007G094700 Sobic009G048700--Sobic006G199500 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic004G203150 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic009G048700--Sobic002G418300 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic009G048700--Sobic007G219601 Sobic006G199500--Sobic009G048700 Sobic006G199500--Sobic009G008000 Sobic002G097200 Sobic002G097200 Sobic006G199500--Sobic002G097200 Sobic006G199500--Sobic001G417700 Sobic006G199500--Sobic009G145000 Sobic006G199500--Sobic002G243400 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic006G199500--Sobic004G020200 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic006G199500--Sobic001G136000 Sobic006G199500--Sobic008G155700 Sobic009G006700--Sobic007G219601 Sobic009G006700--Sobic007G094700 Sobic009G006700--Sobic004G203150 Sobic009G006700--Sobic009G048700 Sobic009G006700--Sobic009G008000 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic009G006700--Sobic005G144500 Sobic009G006700--Sobic008G155700 Sobic009G006700--Sobic006G038700 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic009G006700--Sobic010G038000 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic009G145000--Sobic002G189500 Sobic009G145000--Sobic001G417700 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic009G145000--Sobic004G328200 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic009G145000--Sobic001G029300 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic009G145000--Sobic006G266400 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic009G145000--Sobic004G190400 Sobic009G145000--Sobic009G008000 Sobic009G145000--Sobic004G203150 Sobic009G145000--Sobic007G094700 Sobic010G255400--Sobic008G007800 Sobic010G255400--Sobic004G064800 Sobic010G255400--Sobic005G201200 Sobic010G255400--Sobic002G016000 Sobic008G041300 Sobic008G041300 Sobic010G255400--Sobic008G041300 Sobic010G255400--Sobic002G304500 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic010G255400--Sobic001G076600 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic010G255400--Sobic002G158300 Sobic010G255400--Sobic006G199500 Sobic002G243400--Sobic009G145000 Sobic002G243400--Sobic001G417700 Sobic002G243400--Sobic009G048700 Sobic002G243400--Sobic002G189500 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic002G243400--Sobic010G061600 Sobic002G243400--Sobic009G008000 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic002G243400--Sobic009G002100 Sobic002G243400--Sobic002G418300 Sobic002G243400--Sobic004G190400 Sobic009G008000--Sobic009G048700 Sobic009G008000--Sobic007G094700 Sobic009G008000--Sobic004G203150 Sobic009G008000--Sobic001G417700 Sobic009G008000--Sobic009G145000 Sobic009G008000--Sobic007G219601 Sobic009G008000--Sobic008G155700 Sobic009G008000--Sobic002G418300 Sobic009G008000--Sobic002G189500
Octagon: transcription factors


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