Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G050800.2,Sobic.009G050800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R104 , A0A1B6P6K9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G057900 - -
2 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
3 Sobic.007G040050 - -
4 Sobic.005G220250 - -
5 Sobic.008G007800 - -
6 Sobic.010G255400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@histone acetyltransferase HAC1, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
7 Sobic.005G201200 - -
8 Sobic.010G061600 - -
9 Sobic.001G504800 expressed protein -
10 Sobic.002G304500 mutS family domain IV containing protein, expressed K08740: DNA mismatch repair protein MSH4
11 Sobic.001G053350 - -
12 Sobic.007G109301 - -
13 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
14 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
15 Sobic.008G017850 - -
16 Sobic.002G147400 homeodomain-related, putative, expressed -
17 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
18 Sobic.009G145000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
19 Sobic.009G048700 expressed protein -
20 Sobic.002G015700 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G050800 Sobic009G050800 Sobic005G057900 Sobic005G057900 Sobic009G050800--Sobic005G057900 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic009G050800--Sobic004G064800 Sobic007G040050 Sobic007G040050 Sobic009G050800--Sobic007G040050 Sobic005G220250 Sobic005G220250 Sobic009G050800--Sobic005G220250 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic009G050800--Sobic008G007800 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic009G050800--Sobic010G255400 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic009G050800--Sobic005G201200 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic009G050800--Sobic010G061600 Sobic001G504800 Sobic001G504800 Sobic009G050800--Sobic001G504800 Sobic005G057900--Sobic009G050800 Sobic005G057900--Sobic004G064800 Sobic004G203000 Sobic004G203000 Sobic005G057900--Sobic004G203000 Sobic005G057900--Sobic001G504800 Sobic005G057900--Sobic007G040050 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic005G057900--Sobic006G199500 Sobic005G057900--Sobic005G220250 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic005G057900--Sobic002G304500 Sobic005G057900--Sobic010G255400 Sobic004G064800--Sobic008G007800 Sobic004G064800--Sobic002G304500 Sobic004G064800--Sobic005G201200 Sobic004G064800--Sobic010G255400 Sobic004G064800--Sobic006G199500 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic004G064800--Sobic009G048700 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic004G064800--Sobic008G007700 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic004G064800--Sobic002G016000 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic004G064800--Sobic009G006700 Sobic007G040050--Sobic010G061600 Sobic007G040050--Sobic005G220250 Sobic007G040050--Sobic009G050800 Sobic007G040050--Sobic004G064800 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic007G040050--Sobic007G109301 Sobic003G234701 Sobic003G234701 Sobic007G040050--Sobic003G234701 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic007G040050--Sobic001G305200 Sobic007G040050--Sobic008G007800 Sobic007G040050--Sobic005G057900 Sobic005G220250--Sobic007G109301 Sobic005G220250--Sobic010G061600 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic005G220250--Sobic004G190400 Sobic002G035733 Sobic002G035733 Sobic005G220250--Sobic002G035733 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic005G220250--Sobic009G145000 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic005G220250--Sobic002G189500 Sobic005G037600 Sobic005G037600 Sobic005G220250--Sobic005G037600 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic005G220250--Sobic009G008000 Sobic001G133400 Sobic001G133400 Sobic005G220250--Sobic001G133400 Sobic008G007800--Sobic004G064800 Sobic008G007800--Sobic005G201200 Sobic008G007800--Sobic009G048700 Sobic008G007800--Sobic006G199500 Sobic008G007800--Sobic009G006700 Sobic008G007800--Sobic009G145000 Sobic008G007800--Sobic010G255400 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic008G007800--Sobic002G243400 Sobic008G007800--Sobic009G008000 Sobic010G255400--Sobic008G007800 Sobic010G255400--Sobic004G064800 Sobic010G255400--Sobic005G201200 Sobic010G255400--Sobic002G016000 Sobic008G041300 Sobic008G041300 Sobic010G255400--Sobic008G041300 Sobic010G255400--Sobic002G304500 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic010G255400--Sobic001G076600 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic010G255400--Sobic002G158300 Sobic010G255400--Sobic006G199500 Sobic005G201200--Sobic002G016000 Sobic005G201200--Sobic008G007800 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic005G201200--Sobic006G038700 Sobic005G201200--Sobic004G064800 Sobic005G201200--Sobic009G006700 Sobic005G201200--Sobic010G255400 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic005G201200--Sobic002G066700 Sobic005G201200--Sobic002G304500 Sobic002G147400 Sobic002G147400 Sobic005G201200--Sobic002G147400 Sobic010G061600--Sobic007G109301 Sobic010G061600--Sobic004G190400 Sobic010G061600--Sobic002G189500 Sobic010G061600--Sobic009G145000 Sobic010G061600--Sobic005G220250 Sobic010G061600--Sobic009G008000 Sobic010G061600--Sobic009G048700 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic010G061600--Sobic001G417700 Sobic010G061600--Sobic002G243400 Sobic001G504800--Sobic005G037600 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic001G504800--Sobic002G060101 Sobic002G097200 Sobic002G097200 Sobic001G504800--Sobic002G097200 Sobic001G504800--Sobic005G220250 Sobic001G504800--Sobic009G048700 Sobic007G041100 Sobic007G041100 Sobic001G504800--Sobic007G041100 Sobic001G504800--Sobic006G199500 Sobic001G504800--Sobic010G061600 Sobic001G504800--Sobic007G109301
Octagon: transcription factors


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