Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G015700.1,Sobic.002G015700.2
Synonym Sb02g001580
Functional annotation OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0W1W3 , A0A1W0W1V0
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF61
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G03220 : Protein with RNI-like/FBD-like domains
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02760.1 : OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016046
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1B02G101200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
2 Sobic.003G211800 expressed protein -
3 Sobic.002G097200 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G168900 elongation factor Tu family protein, putative, expressed K14536: ribosome assembly protein 1
5 Sobic.009G048700 expressed protein -
6 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
7 Sobic.001G504800 expressed protein -
8 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
9 Sobic.009G145000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
10 Sobic.002G316100 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
11 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
12 Sobic.002G158300 ankyrin, putative, expressed -
13 Sobic.005G220250 - -
14 Sobic.006G254400 expressed protein -
15 Sobic.004G038400 fruit bromelain precursor, putative, expressed -
16 Sobic.009G002100 expressed protein -
17 Sobic.008G155700 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
18 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
19 Sobic.010G061600 - -
20 Sobic.004G045632 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G015700 Sobic002G015700 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic002G015700--Sobic002G243400 Sobic003G211800 Sobic003G211800 Sobic002G015700--Sobic003G211800 Sobic002G097200 Sobic002G097200 Sobic002G015700--Sobic002G097200 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic002G015700--Sobic004G168900 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic002G015700--Sobic009G048700 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic002G015700--Sobic006G199500 Sobic001G504800 Sobic001G504800 Sobic002G015700--Sobic001G504800 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic002G015700--Sobic004G064800 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic002G015700--Sobic009G145000 Sobic002G243400--Sobic009G145000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic002G243400--Sobic001G417700 Sobic002G243400--Sobic009G048700 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic002G243400--Sobic002G189500 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic002G243400--Sobic010G061600 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic002G243400--Sobic009G008000 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic002G243400--Sobic009G002100 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic002G243400--Sobic002G418300 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic002G243400--Sobic004G190400 Sobic003G211800--Sobic002G418300 Sobic003G211800--Sobic001G417700 Sobic003G211800--Sobic009G048700 Sobic003G211800--Sobic009G145000 Sobic003G211800--Sobic009G008000 Sobic003G211800--Sobic002G243400 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic003G211800--Sobic008G056600 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic003G211800--Sobic001G136000 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic003G211800--Sobic002G099700 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic002G097200--Sobic002G060101 Sobic005G037600 Sobic005G037600 Sobic002G097200--Sobic005G037600 Sobic002G097200--Sobic006G199500 Sobic002G097200--Sobic009G048700 Sobic002G097200--Sobic001G504800 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic002G097200--Sobic010G038300 Sobic002G097200--Sobic004G168900 Sobic002G097200--Sobic009G145000 Sobic003G005700 Sobic003G005700 Sobic002G097200--Sobic003G005700 Sobic004G168900--Sobic009G048700 Sobic004G168900--Sobic008G056600 Sobic004G168900--Sobic010G038300 Sobic004G168900--Sobic002G097200 Sobic004G168900--Sobic001G417700 Sobic004G168900--Sobic003G211800 Sobic004G168900--Sobic009G145000 Sobic004G168900--Sobic002G243400 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic004G168900--Sobic006G266400 Sobic009G048700--Sobic009G008000 Sobic009G048700--Sobic001G417700 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic009G145000 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic009G048700--Sobic007G094700 Sobic009G048700--Sobic006G199500 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic002G418300 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic009G048700--Sobic007G219601 Sobic006G199500--Sobic009G048700 Sobic006G199500--Sobic009G008000 Sobic006G199500--Sobic002G097200 Sobic006G199500--Sobic001G417700 Sobic006G199500--Sobic009G145000 Sobic006G199500--Sobic002G243400 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic006G199500--Sobic004G020200 Sobic006G199500--Sobic001G136000 Sobic006G199500--Sobic008G155700 Sobic001G504800--Sobic005G037600 Sobic001G504800--Sobic002G060101 Sobic001G504800--Sobic002G097200 Sobic005G220250 Sobic005G220250 Sobic001G504800--Sobic005G220250 Sobic001G504800--Sobic009G048700 Sobic007G041100 Sobic007G041100 Sobic001G504800--Sobic007G041100 Sobic001G504800--Sobic006G199500 Sobic001G504800--Sobic010G061600 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic001G504800--Sobic007G109301 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic004G064800--Sobic008G007800 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic004G064800--Sobic002G304500 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic004G064800--Sobic005G201200 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic004G064800--Sobic010G255400 Sobic004G064800--Sobic006G199500 Sobic004G064800--Sobic009G048700 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic004G064800--Sobic008G007700 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic004G064800--Sobic002G016000 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic004G064800--Sobic009G006700 Sobic009G145000--Sobic002G189500 Sobic009G145000--Sobic001G417700 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic009G145000--Sobic004G328200 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic009G145000--Sobic001G029300 Sobic009G145000--Sobic006G266400 Sobic009G145000--Sobic004G190400 Sobic009G145000--Sobic009G008000 Sobic009G145000--Sobic004G203150 Sobic009G145000--Sobic007G094700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.