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Transcriptome id Sobic.005G057900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQD2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G050800 - -
2 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
3 Sobic.004G203000 cytochrome P450, putative, expressed K15402: fatty acid omega-hydroxylase
4 Sobic.001G504800 expressed protein -
5 Sobic.007G040050 - -
6 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
7 Sobic.005G220250 - -
8 Sobic.002G304500 mutS family domain IV containing protein, expressed K08740: DNA mismatch repair protein MSH4
9 Sobic.010G255400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@histone acetyltransferase HAC1, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
10 Sobic.008G007800 - -
11 Sobic.002G097200 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G015700 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G041100 OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G201200 - -
15 Sobic.010G061600 - -
16 Sobic.009G048700 expressed protein -
17 Sobic.009G017600 cupin domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
19 Sobic.005G037600 - -
20 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G057900 Sobic005G057900 Sobic009G050800 Sobic009G050800 Sobic005G057900--Sobic009G050800 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic005G057900--Sobic004G064800 Sobic004G203000 Sobic004G203000 Sobic005G057900--Sobic004G203000 Sobic001G504800 Sobic001G504800 Sobic005G057900--Sobic001G504800 Sobic007G040050 Sobic007G040050 Sobic005G057900--Sobic007G040050 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic005G057900--Sobic006G199500 Sobic005G220250 Sobic005G220250 Sobic005G057900--Sobic005G220250 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic005G057900--Sobic002G304500 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic005G057900--Sobic010G255400 Sobic009G050800--Sobic005G057900 Sobic009G050800--Sobic004G064800 Sobic009G050800--Sobic007G040050 Sobic009G050800--Sobic005G220250 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic009G050800--Sobic008G007800 Sobic009G050800--Sobic010G255400 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic009G050800--Sobic005G201200 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic009G050800--Sobic010G061600 Sobic009G050800--Sobic001G504800 Sobic004G064800--Sobic008G007800 Sobic004G064800--Sobic002G304500 Sobic004G064800--Sobic005G201200 Sobic004G064800--Sobic010G255400 Sobic004G064800--Sobic006G199500 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic004G064800--Sobic009G048700 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic004G064800--Sobic008G007700 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic004G064800--Sobic002G016000 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic004G064800--Sobic009G006700 Sobic002G097200 Sobic002G097200 Sobic004G203000--Sobic002G097200 Sobic001G242200 Sobic001G242200 Sobic004G203000--Sobic001G242200 Sobic004G203000--Sobic006G199500 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic004G203000--Sobic010G038300 Sobic009G240500 Sobic009G240500 Sobic004G203000--Sobic009G240500 Sobic007G041100 Sobic007G041100 Sobic004G203000--Sobic007G041100 Sobic004G203000--Sobic001G504800 Sobic004G002700 Sobic004G002700 Sobic004G203000--Sobic004G002700 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic004G203000--Sobic004G168900 Sobic005G037600 Sobic005G037600 Sobic001G504800--Sobic005G037600 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic001G504800--Sobic002G060101 Sobic001G504800--Sobic002G097200 Sobic001G504800--Sobic005G220250 Sobic001G504800--Sobic009G048700 Sobic001G504800--Sobic007G041100 Sobic001G504800--Sobic006G199500 Sobic001G504800--Sobic010G061600 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic001G504800--Sobic007G109301 Sobic007G040050--Sobic010G061600 Sobic007G040050--Sobic005G220250 Sobic007G040050--Sobic009G050800 Sobic007G040050--Sobic004G064800 Sobic007G040050--Sobic007G109301 Sobic003G234701 Sobic003G234701 Sobic007G040050--Sobic003G234701 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic007G040050--Sobic001G305200 Sobic007G040050--Sobic008G007800 Sobic007G040050--Sobic005G057900 Sobic006G199500--Sobic009G048700 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic006G199500--Sobic009G008000 Sobic006G199500--Sobic002G097200 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic006G199500--Sobic001G417700 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic006G199500--Sobic009G145000 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic006G199500--Sobic002G243400 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic006G199500--Sobic004G020200 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic006G199500--Sobic001G136000 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic006G199500--Sobic008G155700 Sobic005G220250--Sobic007G109301 Sobic005G220250--Sobic010G061600 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic005G220250--Sobic004G190400 Sobic002G035733 Sobic002G035733 Sobic005G220250--Sobic002G035733 Sobic005G220250--Sobic009G145000 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic005G220250--Sobic002G189500 Sobic005G220250--Sobic005G037600 Sobic005G220250--Sobic009G008000 Sobic001G133400 Sobic001G133400 Sobic005G220250--Sobic001G133400 Sobic002G304500--Sobic004G064800 Sobic002G304500--Sobic005G201200 Sobic002G304500--Sobic008G007800 Sobic002G304500--Sobic010G255400 Sobic002G304500--Sobic002G016000 Sobic002G304500--Sobic006G199500 Sobic004G328100 Sobic004G328100 Sobic002G304500--Sobic004G328100 Sobic002G304500--Sobic008G007700 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic002G304500--Sobic004G038400 Sobic010G255400--Sobic008G007800 Sobic010G255400--Sobic004G064800 Sobic010G255400--Sobic005G201200 Sobic010G255400--Sobic002G016000 Sobic008G041300 Sobic008G041300 Sobic010G255400--Sobic008G041300 Sobic010G255400--Sobic002G304500 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic010G255400--Sobic001G076600 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic010G255400--Sobic002G158300 Sobic010G255400--Sobic006G199500
Octagon: transcription factors


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