Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G040050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDW1 , A0A1Z5R8G9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G061600 - -
2 Sobic.005G220250 - -
3 Sobic.009G050800 - -
4 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
5 Sobic.007G109301 - -
6 Sobic.003G234701 - -
7 Sobic.001G305200 expressed protein -
8 Sobic.008G007800 - -
9 Sobic.005G057900 - -
10 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
11 Sobic.001G504800 expressed protein -
12 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
13 Sobic.004G190400 expressed protein -
14 Sobic.003G005700 AGC_PVPK_like_kin82y.4 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
15 Sobic.010G276500 - -
16 Sobic.009G048700 expressed protein -
17 Sobic.008G017850 - -
18 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
19 Sobic.005G201200 - -
20 Sobic.007G041100 OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G040050 Sobic007G040050 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic007G040050--Sobic010G061600 Sobic005G220250 Sobic005G220250 Sobic007G040050--Sobic005G220250 Sobic009G050800 Sobic009G050800 Sobic007G040050--Sobic009G050800 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic007G040050--Sobic004G064800 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic007G040050--Sobic007G109301 Sobic003G234701 Sobic003G234701 Sobic007G040050--Sobic003G234701 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic007G040050--Sobic001G305200 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic007G040050--Sobic008G007800 Sobic005G057900 Sobic005G057900 Sobic007G040050--Sobic005G057900 Sobic010G061600--Sobic007G109301 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic010G061600--Sobic004G190400 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic010G061600--Sobic002G189500 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic010G061600--Sobic009G145000 Sobic010G061600--Sobic005G220250 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic010G061600--Sobic009G008000 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic010G061600--Sobic009G048700 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic010G061600--Sobic001G417700 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic010G061600--Sobic002G243400 Sobic005G220250--Sobic007G109301 Sobic005G220250--Sobic010G061600 Sobic005G220250--Sobic004G190400 Sobic002G035733 Sobic002G035733 Sobic005G220250--Sobic002G035733 Sobic005G220250--Sobic009G145000 Sobic005G220250--Sobic002G189500 Sobic005G037600 Sobic005G037600 Sobic005G220250--Sobic005G037600 Sobic005G220250--Sobic009G008000 Sobic001G133400 Sobic001G133400 Sobic005G220250--Sobic001G133400 Sobic009G050800--Sobic005G057900 Sobic009G050800--Sobic004G064800 Sobic009G050800--Sobic007G040050 Sobic009G050800--Sobic005G220250 Sobic009G050800--Sobic008G007800 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic009G050800--Sobic010G255400 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic009G050800--Sobic005G201200 Sobic009G050800--Sobic010G061600 Sobic001G504800 Sobic001G504800 Sobic009G050800--Sobic001G504800 Sobic004G064800--Sobic008G007800 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic004G064800--Sobic002G304500 Sobic004G064800--Sobic005G201200 Sobic004G064800--Sobic010G255400 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic004G064800--Sobic006G199500 Sobic004G064800--Sobic009G048700 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic004G064800--Sobic008G007700 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic004G064800--Sobic002G016000 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic004G064800--Sobic009G006700 Sobic007G109301--Sobic010G061600 Sobic007G109301--Sobic004G190400 Sobic007G109301--Sobic002G189500 Sobic007G109301--Sobic005G220250 Sobic007G109301--Sobic009G145000 Sobic007G109301--Sobic002G035733 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic007G109301--Sobic001G029300 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic007G109301--Sobic004G203150 Sobic001G163666 Sobic001G163666 Sobic007G109301--Sobic001G163666 Sobic003G234701--Sobic010G061600 Sobic006G162500 Sobic006G162500 Sobic003G234701--Sobic006G162500 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic003G234701--Sobic002G418300 Sobic003G234701--Sobic004G190400 Sobic004G080800 Sobic004G080800 Sobic003G234701--Sobic004G080800 Sobic003G234701--Sobic002G189500 Sobic007G148600 Sobic007G148600 Sobic003G234701--Sobic007G148600 Sobic003G234701--Sobic009G145000 Sobic003G234701--Sobic002G243400 Sobic005G052400 Sobic005G052400 Sobic001G305200--Sobic005G052400 Sobic010G276500 Sobic010G276500 Sobic001G305200--Sobic010G276500 Sobic001G305200--Sobic002G243400 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic001G305200--Sobic010G038000 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic001G305200--Sobic010G198400 Sobic001G305200--Sobic007G109301 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic001G305200--Sobic002G193200 Sobic001G305200--Sobic009G048700 Sobic001G305200--Sobic010G061600 Sobic008G007800--Sobic004G064800 Sobic008G007800--Sobic005G201200 Sobic008G007800--Sobic009G048700 Sobic008G007800--Sobic006G199500 Sobic008G007800--Sobic009G006700 Sobic008G007800--Sobic009G145000 Sobic008G007800--Sobic010G255400 Sobic008G007800--Sobic002G243400 Sobic008G007800--Sobic009G008000 Sobic005G057900--Sobic009G050800 Sobic005G057900--Sobic004G064800 Sobic004G203000 Sobic004G203000 Sobic005G057900--Sobic004G203000 Sobic005G057900--Sobic001G504800 Sobic005G057900--Sobic007G040050 Sobic005G057900--Sobic006G199500 Sobic005G057900--Sobic005G220250 Sobic005G057900--Sobic002G304500 Sobic005G057900--Sobic010G255400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.