Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G305200.1
Synonym Sb01g029720
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WSK5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g40280.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003279
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G052400 - -
2 Sobic.010G276500 - -
3 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
4 Sobic.010G038000 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
5 Sobic.010G198400 expressed protein -
6 Sobic.007G109301 - -
7 Sobic.002G193200 - -
8 Sobic.009G048700 expressed protein -
9 Sobic.010G061600 - -
10 Sobic.008G154600 pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G007800 - -
12 Sobic.006G199500 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
13 Sobic.009G008000 transcription factor Dp, putative, expressed -
14 Sobic.004G020200 expressed protein -
15 Sobic.004G186400 - -
16 Sobic.009G145000 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
17 Sobic.009G006700 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K02155: ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
18 Sobic.002G424200 SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1, putative, expressed K07199: 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory beta subunit
19 Sobic.005G201200 - -
20 Sobic.008G155700 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic005G052400 Sobic005G052400 Sobic001G305200--Sobic005G052400 Sobic010G276500 Sobic010G276500 Sobic001G305200--Sobic010G276500 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic001G305200--Sobic002G243400 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic001G305200--Sobic010G038000 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic001G305200--Sobic010G198400 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic001G305200--Sobic007G109301 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic001G305200--Sobic002G193200 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic001G305200--Sobic009G048700 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic001G305200--Sobic010G061600 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic005G052400--Sobic010G129450 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic005G052400--Sobic007G128000 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic005G052400--Sobic009G244100 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic005G052400--Sobic001G417700 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic005G052400--Sobic001G136000 Sobic004G277900 Sobic004G277900 Sobic005G052400--Sobic004G277900 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic005G052400--Sobic009G145000 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic005G052400--Sobic006G266400 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic005G052400--Sobic002G189500 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic010G276500--Sobic003G302532 Sobic010G276500--Sobic005G052400 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic010G276500--Sobic001G251000 Sobic010G276500--Sobic001G305200 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic010G276500--Sobic004G348000 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic010G276500--Sobic006G064450 Sobic001G345500 Sobic001G345500 Sobic010G276500--Sobic001G345500 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic010G276500--Sobic005G200100 Sobic006G013600 Sobic006G013600 Sobic010G276500--Sobic006G013600 Sobic002G243400--Sobic009G145000 Sobic002G243400--Sobic001G417700 Sobic002G243400--Sobic009G048700 Sobic002G243400--Sobic002G189500 Sobic002G243400--Sobic010G061600 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic002G243400--Sobic009G008000 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic002G243400--Sobic009G002100 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic002G243400--Sobic002G418300 Sobic004G190400 Sobic004G190400 Sobic002G243400--Sobic004G190400 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic010G038000--Sobic009G006700 Sobic010G038000--Sobic009G048700 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic010G038000--Sobic007G219601 Sobic010G038000--Sobic010G198400 Sobic010G038000--Sobic001G417700 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic010G038000--Sobic004G020200 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic010G038000--Sobic007G094700 Sobic010G038000--Sobic002G243400 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic010G038000--Sobic008G155700 Sobic002G424200 Sobic002G424200 Sobic010G198400--Sobic002G424200 Sobic010G198400--Sobic010G038000 Sobic006G254400 Sobic006G254400 Sobic010G198400--Sobic006G254400 Sobic010G198400--Sobic009G006700 Sobic010G198400--Sobic009G048700 Sobic010G198400--Sobic004G020200 Sobic010G198400--Sobic002G243400 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic010G198400--Sobic006G199500 Sobic010G198400--Sobic009G008000 Sobic007G109301--Sobic010G061600 Sobic007G109301--Sobic004G190400 Sobic007G109301--Sobic002G189500 Sobic005G220250 Sobic005G220250 Sobic007G109301--Sobic005G220250 Sobic007G109301--Sobic009G145000 Sobic002G035733 Sobic002G035733 Sobic007G109301--Sobic002G035733 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic007G109301--Sobic001G029300 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic007G109301--Sobic004G203150 Sobic001G163666 Sobic001G163666 Sobic007G109301--Sobic001G163666 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic002G193200--Sobic003G211233 Sobic003G064100 Sobic003G064100 Sobic002G193200--Sobic003G064100 Sobic008G008000 Sobic008G008000 Sobic002G193200--Sobic008G008000 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic002G193200--Sobic003G066300 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic002G193200--Sobic003G079532 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic002G193200--Sobic008G095766 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic002G193200--Sobic002G359100 Sobic008G019200 Sobic008G019200 Sobic002G193200--Sobic008G019200 Sobic005G198800 Sobic005G198800 Sobic002G193200--Sobic005G198800 Sobic009G048700--Sobic009G008000 Sobic009G048700--Sobic001G417700 Sobic009G048700--Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic009G145000 Sobic009G048700--Sobic007G094700 Sobic009G048700--Sobic006G199500 Sobic009G048700--Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic002G418300 Sobic009G048700--Sobic007G219601 Sobic010G061600--Sobic007G109301 Sobic010G061600--Sobic004G190400 Sobic010G061600--Sobic002G189500 Sobic010G061600--Sobic009G145000 Sobic010G061600--Sobic005G220250 Sobic010G061600--Sobic009G008000 Sobic010G061600--Sobic009G048700 Sobic010G061600--Sobic001G417700 Sobic010G061600--Sobic002G243400
Octagon: transcription factors


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