Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G154600.1
Synonym Sb08g020380
Functional annotation pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YRC0
Pfam PF04043
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g40750.1 : pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G119100 hexokinase, putative, expressed K00844: hexokinase
2 Sobic.001G075201 - -
3 Sobic.001G392700 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
4 Sobic.001G305200 expressed protein -
5 Sobic.002G147400 homeodomain-related, putative, expressed -
6 Sobic.009G056900 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
7 Sobic.001G075200 - -
8 Sobic.004G186400 - -
9 Sobic.001G313150 - -
10 Sobic.001G337200 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
11 Sobic.004G155700 LSM domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G014032 - -
13 Sobic.005G201200 - -
14 Sobic.006G038700 - -
15 Sobic.010G038000 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G198400 expressed protein -
17 Sobic.002G066700 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
18 Sobic.002G136200 beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
19 Sobic.002G016000 OsFBL32 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
20 Sobic.004G041300 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic009G119100 Sobic009G119100 Sobic008G154600--Sobic009G119100 Sobic001G075201 Sobic001G075201 Sobic008G154600--Sobic001G075201 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic008G154600--Sobic001G392700 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic008G154600--Sobic001G305200 Sobic002G147400 Sobic002G147400 Sobic008G154600--Sobic002G147400 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic008G154600--Sobic009G056900 Sobic001G075200 Sobic001G075200 Sobic008G154600--Sobic001G075200 Sobic004G186400 Sobic004G186400 Sobic008G154600--Sobic004G186400 Sobic001G313150 Sobic001G313150 Sobic008G154600--Sobic001G313150 Sobic009G119100--Sobic001G075201 Sobic009G119100--Sobic008G154600 Sobic002G014032 Sobic002G014032 Sobic009G119100--Sobic002G014032 Sobic009G119100--Sobic009G056900 Sobic009G119100--Sobic001G392700 Sobic009G119100--Sobic001G075200 Sobic009G119100--Sobic002G147400 Sobic004G041300 Sobic004G041300 Sobic009G119100--Sobic004G041300 Sobic009G119100--Sobic004G186400 Sobic001G075201--Sobic009G119100 Sobic001G075201--Sobic001G392700 Sobic001G075201--Sobic009G056900 Sobic001G075201--Sobic002G147400 Sobic001G075201--Sobic001G075200 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic001G075201--Sobic005G201200 Sobic001G075201--Sobic008G154600 Sobic001G075201--Sobic002G014032 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic001G075201--Sobic006G038700 Sobic001G392700--Sobic009G056900 Sobic001G392700--Sobic002G147400 Sobic001G392700--Sobic001G075201 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic001G392700--Sobic002G066700 Sobic001G392700--Sobic001G075200 Sobic001G392700--Sobic005G201200 Sobic001G392700--Sobic008G154600 Sobic006G062600 Sobic006G062600 Sobic001G392700--Sobic006G062600 Sobic002G266600 Sobic002G266600 Sobic001G392700--Sobic002G266600 Sobic005G052400 Sobic005G052400 Sobic001G305200--Sobic005G052400 Sobic010G276500 Sobic010G276500 Sobic001G305200--Sobic010G276500 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic001G305200--Sobic002G243400 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic001G305200--Sobic010G038000 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic001G305200--Sobic010G198400 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic001G305200--Sobic007G109301 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic001G305200--Sobic002G193200 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic001G305200--Sobic009G048700 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic001G305200--Sobic010G061600 Sobic002G147400--Sobic009G056900 Sobic002G147400--Sobic002G066700 Sobic002G147400--Sobic001G392700 Sobic002G147400--Sobic001G075201 Sobic002G147400--Sobic005G201200 Sobic002G147400--Sobic001G075200 Sobic002G147400--Sobic006G038700 Sobic001G194500 Sobic001G194500 Sobic002G147400--Sobic001G194500 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic002G147400--Sobic002G016000 Sobic009G056900--Sobic002G066700 Sobic009G056900--Sobic001G392700 Sobic009G056900--Sobic002G147400 Sobic009G056900--Sobic001G075201 Sobic009G056900--Sobic005G201200 Sobic009G056900--Sobic006G038700 Sobic009G056900--Sobic002G016000 Sobic009G056900--Sobic002G266600 Sobic003G167200 Sobic003G167200 Sobic009G056900--Sobic003G167200 Sobic001G075200--Sobic001G392700 Sobic001G075200--Sobic002G147400 Sobic001G075200--Sobic001G075201 Sobic001G075200--Sobic006G062600 Sobic001G075200--Sobic009G056900 Sobic001G075200--Sobic009G119100 Sobic001G075200--Sobic008G154600 Sobic001G075200--Sobic005G201200 Sobic007G068200 Sobic007G068200 Sobic001G075200--Sobic007G068200 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic004G186400--Sobic008G095766 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic004G186400--Sobic003G079532 Sobic002G316100 Sobic002G316100 Sobic004G186400--Sobic002G316100 Sobic004G186400--Sobic002G193200 Sobic004G186400--Sobic001G305200 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic004G186400--Sobic003G211233 Sobic004G186400--Sobic004G041300 Sobic004G186400--Sobic008G154600 Sobic004G186400--Sobic002G243400 Sobic008G105600 Sobic008G105600 Sobic001G313150--Sobic008G105600 Sobic001G313150--Sobic003G167200 Sobic001G313150--Sobic006G038700 Sobic004G155700 Sobic004G155700 Sobic001G313150--Sobic004G155700 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic001G313150--Sobic010G143633 Sobic001G313150--Sobic009G056900 Sobic001G313150--Sobic001G392700 Sobic001G313150--Sobic008G154600 Sobic001G313150--Sobic002G066700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.