Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G014032.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5X7Y6
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02910.1 : OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G075201 - -
2 Sobic.009G119100 hexokinase, putative, expressed K00844: hexokinase
3 Sobic.009G056900 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
4 Sobic.001G392700 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
5 Sobic.002G147400 homeodomain-related, putative, expressed -
6 Sobic.008G154600 pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G016000 OsFBL32 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
8 Sobic.008G041300 - K14777: DDX47, ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
9 Sobic.005G201200 - -
10 Sobic.002G066700 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
11 Sobic.006G062600 TUDOR protein with multiple SNc domains, putative, expressed K15979: staphylococcal nuclease domain-containing protein 1
12 Sobic.001G075200 - -
13 Sobic.006G038700 - -
14 Sobic.004G027200 dnaJ domain containing protein, expressed K09510: DnaJ homolog subfamily B member 4
15 Sobic.008G105600 - -
16 Sobic.008G013200 expressed protein -
17 Sobic.005G070301 - K03007: RPB10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
18 Sobic.010G198400 expressed protein -
19 Sobic.010G143633 - -
20 Sobic.002G304500 mutS family domain IV containing protein, expressed K08740: DNA mismatch repair protein MSH4


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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