Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G136200.2,Sobic.002G136200.3
Synonym Sb02g012320, BAM7, BMY4
Functional annotation beta-amylase, putative, expressed
UniProt A0A1W0W3Q2 , A0A1W0W3W3
Pfam PF05687 PF01373 PF01373
Panther DB PTHR31352 PTHR31352:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01177; beta-amylase
Gene Ontology GO:0016161; beta-amylase activity GO:0000272polysaccharide catabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G45880 : beta-amylase 7,beta-amylase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g39570.1 : beta-amylase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046064
Brachypodium KQJ91602 , PNT65201 , KQK02326
Barley HORVU4Hr1G000540.1 , HORVU4Hr1G000520.1 , HORVU4Hr1G000520.2
Wheat TraesCS4A02G307900 , TraesCS4D02G006100 , TraesCS4B02G009900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G136200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G136200 Sobic002G136200 Sobic004G186400 Sobic004G186400 Sobic002G136200--Sobic004G186400 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic002G136200--Sobic008G095766 Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic002G136200--Sobic008G154600 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic002G136200--Sobic001G305200 Sobic001G027700 Sobic001G027700 Sobic002G136200--Sobic001G027700 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic002G136200--Sobic004G288000 Sobic009G119100 Sobic009G119100 Sobic002G136200--Sobic009G119100 Sobic003G356800 Sobic003G356800 Sobic002G136200--Sobic003G356800 Sobic002G015700 Sobic002G015700 Sobic002G136200--Sobic002G015700 Sobic004G186400--Sobic008G095766 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic004G186400--Sobic003G079532 Sobic002G316100 Sobic002G316100 Sobic004G186400--Sobic002G316100 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic004G186400--Sobic002G193200 Sobic004G186400--Sobic001G305200 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic004G186400--Sobic003G211233 Sobic004G041300 Sobic004G041300 Sobic004G186400--Sobic004G041300 Sobic004G186400--Sobic008G154600 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic004G186400--Sobic002G243400 Sobic008G095766--Sobic002G193200 Sobic008G095766--Sobic004G186400 Sobic008G095766--Sobic003G079532 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic008G095766--Sobic008G191900 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic008G095766--Sobic002G359100 Sobic008G095766--Sobic003G211233 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic008G095766--Sobic004G031900 Sobic004G345001 Sobic004G345001 Sobic008G095766--Sobic004G345001 Sobic008G095766--Sobic004G288000 Sobic008G154600--Sobic009G119100 Sobic001G075201 Sobic001G075201 Sobic008G154600--Sobic001G075201 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic008G154600--Sobic001G392700 Sobic008G154600--Sobic001G305200 Sobic002G147400 Sobic002G147400 Sobic008G154600--Sobic002G147400 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic008G154600--Sobic009G056900 Sobic001G075200 Sobic001G075200 Sobic008G154600--Sobic001G075200 Sobic008G154600--Sobic004G186400 Sobic001G313150 Sobic001G313150 Sobic008G154600--Sobic001G313150 Sobic005G052400 Sobic005G052400 Sobic001G305200--Sobic005G052400 Sobic010G276500 Sobic010G276500 Sobic001G305200--Sobic010G276500 Sobic001G305200--Sobic002G243400 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic001G305200--Sobic010G038000 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic001G305200--Sobic010G198400 Sobic007G109301 Sobic007G109301 Sobic001G305200--Sobic007G109301 Sobic001G305200--Sobic002G193200 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic001G305200--Sobic009G048700 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic001G305200--Sobic010G061600 Sobic001G443700 Sobic001G443700 Sobic001G027700--Sobic001G443700 Sobic001G027700--Sobic002G136200 Sobic010G181701 Sobic010G181701 Sobic001G027700--Sobic010G181701 Sobic001G027700--Sobic008G095766 Sobic003G302600 Sobic003G302600 Sobic001G027700--Sobic003G302600 Sobic001G337200 Sobic001G337200 Sobic001G027700--Sobic001G337200 Sobic006G218200 Sobic006G218200 Sobic001G027700--Sobic006G218200 Sobic001G027700--Sobic008G191900 Sobic010G005100 Sobic010G005100 Sobic001G027700--Sobic010G005100 Sobic004G288000--Sobic004G031900 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G288000--Sobic004G060400 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic004G288000--Sobic009G249400 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic004G288000--Sobic010G187800 Sobic004G288000--Sobic008G191900 Sobic004G288000--Sobic002G359100 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic004G288000--Sobic009G176200 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic004G288000--Sobic003G066300 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic004G288000--Sobic010G074000 Sobic009G119100--Sobic001G075201 Sobic009G119100--Sobic008G154600 Sobic002G014032 Sobic002G014032 Sobic009G119100--Sobic002G014032 Sobic009G119100--Sobic009G056900 Sobic009G119100--Sobic001G392700 Sobic009G119100--Sobic001G075200 Sobic009G119100--Sobic002G147400 Sobic009G119100--Sobic004G041300 Sobic009G119100--Sobic004G186400 Sobic002G429100 Sobic002G429100 Sobic003G356800--Sobic002G429100 Sobic003G048400 Sobic003G048400 Sobic003G356800--Sobic003G048400 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic003G356800--Sobic003G254200 Sobic003G356800--Sobic010G074000 Sobic003G356800--Sobic009G249400 Sobic007G226700 Sobic007G226700 Sobic003G356800--Sobic007G226700 Sobic001G444900 Sobic001G444900 Sobic003G356800--Sobic001G444900 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic003G356800--Sobic010G026200 Sobic004G048900 Sobic004G048900 Sobic003G356800--Sobic004G048900 Sobic002G015700--Sobic002G243400 Sobic003G211800 Sobic003G211800 Sobic002G015700--Sobic003G211800 Sobic002G097200 Sobic002G097200 Sobic002G015700--Sobic002G097200 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic002G015700--Sobic004G168900 Sobic002G015700--Sobic009G048700 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic002G015700--Sobic006G199500 Sobic001G504800 Sobic001G504800 Sobic002G015700--Sobic001G504800 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic002G015700--Sobic004G064800 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic002G015700--Sobic009G145000
Octagon: transcription factors


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