Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G356800.1
Synonym Sb03g039910
Functional annotation universal stress protein domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XPT7
Pfam PF00582
Panther DB PTHR31964 PTHR31964:SF58
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006950; response to stress


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03270 : Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g63010.1 : universal stress protein domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039647 , Zm00025a026847
Brachypodium KQK10578
Barley HORVU3Hr1G085660.7 , HORVU3Hr1G085660.8 , HORVU3Hr1G085660.9 , HORVU3Hr1G085660.3 , HORVU3Hr1G085660.6 , HORVU3Hr1G085660.5
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G429100 expressed protein -
2 Sobic.003G048400 - -
3 Sobic.003G254200 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
4 Sobic.010G074000 expressed protein -
5 Sobic.009G249400 protein kinase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.007G226700 -(PubMedID : 26976818)@dicarboxylate transporter 4(PubMedID : 27016024)@citrate transporter, putative, expressed K03319: divalent anion:Na+ symporter, DASS family
7 Sobic.001G444900 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.010G026200 Sec1 family transport protein, putative, expressed K15292: STXBP1, syntaxin-binding protein 1
9 Sobic.004G048900 myosin heavy chain, putative, expressed -
10 Sobic.007G154400 emp24/gp25L/p24 family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G185801 - -
12 Sobic.007G101600 - -
13 Sobic.003G234701 - -
14 Sobic.010G187800 expressed protein -
15 Sobic.003G208900 Sad1 / UNC-like C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G238250 - -
17 Sobic.009G176200 expressed protein -
18 Sobic.008G052800 - -
19 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
20 Sobic.009G246600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G356800 Sobic003G356800 Sobic002G429100 Sobic002G429100 Sobic003G356800--Sobic002G429100 Sobic003G048400 Sobic003G048400 Sobic003G356800--Sobic003G048400 Sobic003G254200 Sobic003G254200 Sobic003G356800--Sobic003G254200 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic003G356800--Sobic010G074000 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic003G356800--Sobic009G249400 Sobic007G226700 Sobic007G226700 Sobic003G356800--Sobic007G226700 Sobic001G444900 Sobic001G444900 Sobic003G356800--Sobic001G444900 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic003G356800--Sobic010G026200 Sobic004G048900 Sobic004G048900 Sobic003G356800--Sobic004G048900 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic002G429100--Sobic001G380000 Sobic003G233800 Sobic003G233800 Sobic002G429100--Sobic003G233800 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic002G429100--Sobic010G187800 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic002G429100--Sobic001G513400 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic002G429100--Sobic005G039000 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic002G429100--Sobic002G405300 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic002G429100--Sobic004G289900 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic002G429100--Sobic009G176200 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic002G429100--Sobic001G036200 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic003G048400--Sobic003G191300 Sobic003G048400--Sobic010G026200 Sobic002G429000 Sobic002G429000 Sobic003G048400--Sobic002G429000 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic003G048400--Sobic002G402900 Sobic008G121600 Sobic008G121600 Sobic003G048400--Sobic008G121600 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic003G048400--Sobic002G223650 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic003G048400--Sobic005G192000 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic003G048400--Sobic002G210150 Sobic002G330200 Sobic002G330200 Sobic003G048400--Sobic002G330200 Sobic003G254200--Sobic010G074000 Sobic003G254200--Sobic009G249400 Sobic003G254200--Sobic004G048900 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic003G254200--Sobic007G185801 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic003G254200--Sobic008G052800 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic003G254200--Sobic003G208900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic003G254200--Sobic006G232700 Sobic003G254200--Sobic010G187800 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic003G254200--Sobic010G030500 Sobic010G074000--Sobic003G254200 Sobic010G074000--Sobic009G249400 Sobic010G074000--Sobic007G185801 Sobic010G074000--Sobic003G208900 Sobic010G074000--Sobic006G232700 Sobic010G074000--Sobic010G187800 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic010G074000--Sobic005G147900 Sobic010G074000--Sobic008G052800 Sobic010G074000--Sobic010G030500 Sobic009G249400--Sobic003G208900 Sobic009G249400--Sobic005G039000 Sobic009G249400--Sobic007G185801 Sobic009G249400--Sobic010G187800 Sobic009G249400--Sobic003G254200 Sobic009G249400--Sobic008G052800 Sobic009G249400--Sobic010G074000 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic009G249400--Sobic003G305500 Sobic009G249400--Sobic002G405300 Sobic005G148950 Sobic005G148950 Sobic007G226700--Sobic005G148950 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic007G226700--Sobic010G166600 Sobic005G031700 Sobic005G031700 Sobic007G226700--Sobic005G031700 Sobic006G136700 Sobic006G136700 Sobic007G226700--Sobic006G136700 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic007G226700--Sobic001G024300 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic007G226700--Sobic009G116100 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic007G226700--Sobic001G332200 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic007G226700--Sobic002G157900 Sobic001G511100 Sobic001G511100 Sobic007G226700--Sobic001G511100 Sobic001G121800 Sobic001G121800 Sobic001G444900--Sobic001G121800 Sobic001G405100 Sobic001G405100 Sobic001G444900--Sobic001G405100 Sobic005G209600 Sobic005G209600 Sobic001G444900--Sobic005G209600 Sobic003G236000 Sobic003G236000 Sobic001G444900--Sobic003G236000 Sobic004G336800 Sobic004G336800 Sobic001G444900--Sobic004G336800 Sobic001G024250 Sobic001G024250 Sobic001G444900--Sobic001G024250 Sobic009G096433 Sobic009G096433 Sobic001G444900--Sobic009G096433 Sobic001G444900--Sobic003G356800 Sobic007G146300 Sobic007G146300 Sobic001G444900--Sobic007G146300 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic010G026200--Sobic004G160000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic010G026200--Sobic006G018701 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic010G026200--Sobic004G327000 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic010G026200--Sobic004G059200 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic010G026200--Sobic003G343300 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic010G026200--Sobic003G343000 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic010G026200--Sobic002G406801 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic010G026200--Sobic007G195000 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic010G026200--Sobic001G392650 Sobic004G048900--Sobic009G249400 Sobic004G048900--Sobic003G254200 Sobic004G048900--Sobic010G074000 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic004G048900--Sobic004G031900 Sobic004G048900--Sobic009G176200 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic004G048900--Sobic009G072600 Sobic004G048900--Sobic003G208900 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic004G048900--Sobic010G157900 Sobic004G048900--Sobic005G192000
Octagon: transcription factors


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