Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G027700.1
Synonym Sb01g002620
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WU28
Pfam -
Panther DB PTHR36316
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20430 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g11060.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK19018
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G443700 MYB family transcription factor, putative, expressed -
2 Sobic.002G136200 beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
3 Sobic.010G181701 - -
4 Sobic.008G095766 - -
5 Sobic.003G302600 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.1 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K07198: PRKAA, 5'-AMP-activated protein kinase, catalytic alpha subunit
6 Sobic.001G337200 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
7 Sobic.006G218200 expressed protein -
8 Sobic.008G191900 CHX28, putative, expressed -
9 Sobic.010G005100 ethylene-responsive element-binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G188600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@fringe-related protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G082300 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
12 Sobic.004G288000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G359100 expressed protein -
14 Sobic.003G061600 RALFL11 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, putative -
15 Sobic.004G345001 - -
16 Sobic.002G381800 - -
17 Sobic.003G307500 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G408001 - -
19 Sobic.001G153500 glutaredoxin, putative, expressed -
20 Sobic.004G186400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G027700 Sobic001G027700 Sobic001G443700 Sobic001G443700 Sobic001G027700--Sobic001G443700 Sobic002G136200 Sobic002G136200 Sobic001G027700--Sobic002G136200 Sobic010G181701 Sobic010G181701 Sobic001G027700--Sobic010G181701 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic001G027700--Sobic008G095766 Sobic003G302600 Sobic003G302600 Sobic001G027700--Sobic003G302600 Sobic001G337200 Sobic001G337200 Sobic001G027700--Sobic001G337200 Sobic006G218200 Sobic006G218200 Sobic001G027700--Sobic006G218200 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic001G027700--Sobic008G191900 Sobic010G005100 Sobic010G005100 Sobic001G027700--Sobic010G005100 Sobic001G443700--Sobic001G337200 Sobic001G443700--Sobic001G027700 Sobic001G443700--Sobic002G136200 Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic001G443700--Sobic008G154600 Sobic004G251701 Sobic004G251701 Sobic001G443700--Sobic004G251701 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic001G443700--Sobic001G005400 Sobic001G443700--Sobic008G095766 Sobic001G124900 Sobic001G124900 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Octagon: transcription factors


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