Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G218200.1
Synonym Sb06g028790
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YG43
Pfam PF12274
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35330 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g21144.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK03938 , KQK03937 , KQK10735
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G037700 signal recognition particle receptor, putative, expressed K13431: signal recognition particle receptor subunit alpha
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4 Sobic.001G457500 - -
5 Sobic.006G219801 - -
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8 Sobic.009G047066 - -
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14 Sobic.001G506400 expressed protein -
15 Sobic.009G168150 - -
16 Sobic.010G181701 - -
17 Sobic.010G157200 MBTB14 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
18 Sobic.007G102300 formin, putative, expressed -
19 Sobic.003G352900 OsFtsH3 FtsH protease, homologue of AtFtsH3/10, expressed K08956: AFG3 family protein
20 Sobic.010G048966 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G218200 Sobic006G218200 Sobic009G037700 Sobic009G037700 Sobic006G218200--Sobic009G037700 Sobic008G188800 Sobic008G188800 Sobic006G218200--Sobic008G188800 Sobic008G070600 Sobic008G070600 Sobic006G218200--Sobic008G070600 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic006G218200--Sobic001G457500 Sobic006G219801 Sobic006G219801 Sobic006G218200--Sobic006G219801 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic006G218200--Sobic007G144100 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic006G218200--Sobic010G058300 Sobic009G047066 Sobic009G047066 Sobic006G218200--Sobic009G047066 Sobic003G072700 Sobic003G072700 Sobic006G218200--Sobic003G072700 Sobic009G037700--Sobic006G218200 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic009G037700--Sobic009G138401 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic009G037700--Sobic003G066300 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic009G037700--Sobic004G288000 Sobic001G332400 Sobic001G332400 Sobic009G037700--Sobic001G332400 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic009G037700--Sobic008G095766 Sobic001G003400 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Octagon: transcription factors


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