Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G047066.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5Z059
Pfam -
Panther DB PTHR10315 PTHR10315:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007275; multicellular organism development GO:0006511ubiquitin-dependent protein catabolic process GO:0005634nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G37890 : Protein with RING/U-box and TRAF-like domains
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g06060.1 : E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G125200 cell division cycle protein 48, putative, expressed K13525: VCP, transitional endoplasmic reticulum ATPase
2 Sobic.001G186700 expressed protein -
3 Sobic.001G034200 60S ribosomal protein L36-2, putative, expressed K02920: RP-L36e, large subunit ribosomal protein L36e
4 Sobic.010G012700 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
5 Sobic.001G332100 - -
6 Sobic.001G144150 - -
7 Sobic.002G014300 OsFBX213 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
9 Sobic.001G149201 - -
10 Sobic.003G145250 - -
11 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G232300 ubiquitin family protein, expressed -
13 Sobic.003G018000 expressed protein -
14 Sobic.010G181701 - -
15 Sobic.005G198600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G070000 OsWAK92 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
17 Sobic.009G168150 - -
18 Sobic.007G041100 OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G201501 - -
20 Sobic.005G041450 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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