Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G018000.1,Sobic.003G018000.2
Synonym Sb03g001990
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q0W1
Pfam -
Panther DB PTHR33388 PTHR33388:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g11430.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022924 , Zm00025a035892
Brachypodium KQK03280 , KQK03281 , PNT70153 , PNT70152 , PNT70154
Barley HORVU3Hr1G094470.1 , HORVU6Hr1G066440.1 , HORVU2Hr1G016430.1
Wheat TraesCS3A02G131700 , TraesCS3A02G131700 , TraesCS3A02G131700 , TraesCS3D02G147900 , TraesCS3D02G147900 , TraesCS3B02G165300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G013550 - K08770: ubiquitin C
2 Sobic.001G518900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic003G018000 Sobic003G018000 Sobic002G013550 Sobic002G013550 Sobic003G018000--Sobic002G013550 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic003G018000--Sobic001G518900 Sobic001G103600 Sobic001G103600 Sobic003G018000--Sobic001G103600 Sobic009G149100 Sobic009G149100 Sobic003G018000--Sobic009G149100 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic003G018000--Sobic008G095500 Sobic004G335400 Sobic004G335400 Sobic003G018000--Sobic004G335400 Sobic004G002700 Sobic004G002700 Sobic003G018000--Sobic004G002700 Sobic005G041500 Sobic005G041500 Sobic003G018000--Sobic005G041500 Sobic006G276600 Sobic006G276600 Sobic003G018000--Sobic006G276600 Sobic002G013550--Sobic009G149100 Sobic004G254700 Sobic004G254700 Sobic002G013550--Sobic004G254700 Sobic008G071700 Sobic008G071700 Sobic002G013550--Sobic008G071700 Sobic002G019300 Sobic002G019300 Sobic002G013550--Sobic002G019300 Sobic002G013550--Sobic006G276600 Sobic002G013550--Sobic004G335400 Sobic005G006900 Sobic005G006900 Sobic002G013550--Sobic005G006900 Sobic002G298600 Sobic002G298600 Sobic002G013550--Sobic002G298600 Sobic002G013550--Sobic005G041500 Sobic001G518900--Sobic008G095500 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic001G518900--Sobic008G088500 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic001G518900--Sobic008G168500 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic001G518900--Sobic009G047900 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic001G518900--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic001G518900--Sobic005G058000 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic001G518900--Sobic010G196700 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic001G518900--Sobic001G364300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic001G518900--Sobic005G058200 Sobic001G103600--Sobic009G149100 Sobic001G103600--Sobic004G335400 Sobic001G103600--Sobic005G041500 Sobic001G103600--Sobic002G298600 Sobic001G103600--Sobic002G019300 Sobic001G103600--Sobic006G276600 Sobic001G103600--Sobic004G002700 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic001G103600--Sobic001G021200 Sobic001G103600--Sobic008G095500 Sobic009G149100--Sobic006G276600 Sobic009G149100--Sobic002G019300 Sobic009G149100--Sobic004G335400 Sobic009G149100--Sobic005G041500 Sobic009G149100--Sobic004G254700 Sobic009G149100--Sobic002G298600 Sobic001G241700 Sobic001G241700 Sobic009G149100--Sobic001G241700 Sobic009G149100--Sobic008G071700 Sobic009G149100--Sobic001G103600 Sobic008G095500--Sobic008G088500 Sobic008G095500--Sobic008G168500 Sobic008G095500--Sobic002G096600 Sobic008G095500--Sobic005G058000 Sobic008G095500--Sobic001G364300 Sobic008G095500--Sobic005G058200 Sobic008G095500--Sobic001G021200 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic008G095500--Sobic005G007200 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic008G095500--Sobic008G177001 Sobic004G335400--Sobic002G019300 Sobic004G335400--Sobic005G041500 Sobic004G335400--Sobic006G276600 Sobic004G335400--Sobic002G298600 Sobic004G335400--Sobic009G149100 Sobic004G335400--Sobic004G254700 Sobic004G335400--Sobic001G241700 Sobic004G335400--Sobic001G021200 Sobic010G202400 Sobic010G202400 Sobic004G335400--Sobic010G202400 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic004G002700--Sobic004G003300 Sobic004G002700--Sobic010G202400 Sobic004G002700--Sobic001G021200 Sobic004G002700--Sobic001G241700 Sobic004G002700--Sobic005G058000 Sobic004G002700--Sobic002G096600 Sobic004G002700--Sobic008G095500 Sobic004G002700--Sobic008G088500 Sobic004G002700--Sobic009G149100 Sobic005G041500--Sobic004G335400 Sobic005G041500--Sobic006G276600 Sobic005G041500--Sobic002G019300 Sobic005G041500--Sobic002G298600 Sobic005G041500--Sobic009G149100 Sobic005G041500--Sobic004G254700 Sobic005G041500--Sobic001G241700 Sobic005G041500--Sobic010G202400 Sobic005G041500--Sobic001G021200 Sobic006G276600--Sobic002G019300 Sobic006G276600--Sobic005G041500 Sobic006G276600--Sobic004G335400 Sobic006G276600--Sobic009G149100 Sobic006G276600--Sobic004G254700 Sobic006G276600--Sobic002G298600 Sobic006G276600--Sobic001G241700 Sobic006G276600--Sobic008G071700 Sobic006G276600--Sobic010G202400
Octagon: transcription factors


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