Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G149201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S618
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46690.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G091785 - -
2 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
3 Sobic.006G082850 - -
4 Sobic.001G186700 expressed protein -
5 Sobic.002G106700 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
6 Sobic.K028900 - -
7 Sobic.009G047066 - -
8 Sobic.001G135650 - -
9 Sobic.007G125200 cell division cycle protein 48, putative, expressed K13525: VCP, transitional endoplasmic reticulum ATPase
10 Sobic.006G230000 - -
11 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
12 Sobic.001G144150 - -
13 Sobic.008G164000 OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G078000 - -
15 Sobic.003G406060 - -
16 Sobic.001G415800 synaptonemal complex protein 2, putative, expressed -
17 Sobic.010G014850 - -
18 Sobic.001G140950 - -
19 Sobic.005G199800 expressed protein K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
20 Sobic.005G041450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G149201 Sobic001G149201 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic001G149201--Sobic008G091785 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic001G149201--Sobic007G007400 Sobic006G082850 Sobic006G082850 Sobic001G149201--Sobic006G082850 Sobic001G186700 Sobic001G186700 Sobic001G149201--Sobic001G186700 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic001G149201--Sobic002G106700 SobicK028900 SobicK028900 Sobic001G149201--SobicK028900 Sobic009G047066 Sobic009G047066 Sobic001G149201--Sobic009G047066 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic001G149201--Sobic001G135650 Sobic007G125200 Sobic007G125200 Sobic001G149201--Sobic007G125200 Sobic008G091785--Sobic007G007400 Sobic008G091785--Sobic002G106700 Sobic008G091785--Sobic001G135650 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic008G091785--Sobic009G253600 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic008G091785--Sobic010G138600 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic008G091785--Sobic003G078000 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic008G091785--Sobic004G150901 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic008G091785--Sobic006G230000 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic008G091785--Sobic008G164000 Sobic007G007400--Sobic008G091785 Sobic007G007400--Sobic002G106700 Sobic007G007400--Sobic001G135650 Sobic007G007400--Sobic009G253600 Sobic007G007400--Sobic010G138600 Sobic007G007400--Sobic003G078000 Sobic007G007400--Sobic004G150901 Sobic007G007400--Sobic006G230000 Sobic007G007400--Sobic008G164000 Sobic006G082850--Sobic001G149201 Sobic001G359000 Sobic001G359000 Sobic006G082850--Sobic001G359000 Sobic003G384200 Sobic003G384200 Sobic006G082850--Sobic003G384200 Sobic004G149500 Sobic004G149500 Sobic006G082850--Sobic004G149500 Sobic002G158401 Sobic002G158401 Sobic006G082850--Sobic002G158401 Sobic006G082850--Sobic007G125200 Sobic001G415800 Sobic001G415800 Sobic006G082850--Sobic001G415800 Sobic006G082850--Sobic001G186700 Sobic004G324200 Sobic004G324200 Sobic006G082850--Sobic004G324200 Sobic001G144150 Sobic001G144150 Sobic001G186700--Sobic001G144150 Sobic003G145250 Sobic003G145250 Sobic001G186700--Sobic003G145250 Sobic009G030001 Sobic009G030001 Sobic001G186700--Sobic009G030001 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic001G186700--Sobic005G191200 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic001G186700--Sobic005G199800 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic001G186700--Sobic003G075300 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic001G186700--Sobic003G191300 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic001G186700--Sobic010G012700 Sobic005G041450 Sobic005G041450 Sobic001G186700--Sobic005G041450 Sobic002G106700--Sobic008G091785 Sobic002G106700--Sobic007G007400 Sobic002G106700--Sobic001G135650 Sobic002G106700--Sobic006G230000 Sobic002G106700--Sobic008G164000 Sobic002G106700--Sobic003G078000 Sobic002G106700--Sobic009G253600 Sobic002G106700--Sobic010G138600 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic002G106700--Sobic003G406060 Sobic010G014850 Sobic010G014850 SobicK028900--Sobic010G014850 Sobic010G158050 Sobic010G158050 SobicK028900--Sobic010G158050 SobicK028900--Sobic005G191200 Sobic004G057000 Sobic004G057000 SobicK028900--Sobic004G057000 SobicK028900--Sobic005G199800 Sobic010G157900 Sobic010G157900 SobicK028900--Sobic010G157900 SobicK028900--Sobic003G075300 SobicK028900--Sobic001G144150 SobicK028900--Sobic003G406060 Sobic009G047066--Sobic007G125200 Sobic009G047066--Sobic001G186700 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic009G047066--Sobic001G034200 Sobic009G047066--Sobic010G012700 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic009G047066--Sobic001G332100 Sobic009G047066--Sobic001G144150 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic009G047066--Sobic002G014300 Sobic009G047066--Sobic005G191200 Sobic009G047066--Sobic001G149201 Sobic001G135650--Sobic008G091785 Sobic001G135650--Sobic002G106700 Sobic001G135650--Sobic007G007400 Sobic001G135650--Sobic009G253600 Sobic001G135650--Sobic010G138600 Sobic001G135650--Sobic004G150901 Sobic001G135650--Sobic003G078000 Sobic001G135650--Sobic008G164000 Sobic001G135650--Sobic006G230000 Sobic007G125200--Sobic003G406060 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic007G125200--Sobic005G198600 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic007G125200--Sobic005G200100 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic007G125200--Sobic009G170900 Sobic007G125200--Sobic005G191200 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic007G125200--Sobic001G251000 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic007G125200--Sobic003G302532 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic007G125200--Sobic006G189600 Sobic007G125200--Sobic001G186700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.