Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G415800.2
Synonym ZYP1, Sb01g039160, ZYP1a
Functional annotation synaptonemal complex protein 2, putative, expressed
UniProt A0A1B6QQF3
Pfam PF00161
Panther DB PTHR23160 PTHR23160:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0017148; negative regulation of translation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G22275 : Myosin heavy chain-related protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g37960.1 : synaptonemal complex protein 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056186
Brachypodium KQJ82914 , KQJ82913
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G078000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G415800 Sobic001G415800 Sobic001G149201 Sobic001G149201 Sobic001G415800--Sobic001G149201 Sobic006G082850 Sobic006G082850 Sobic001G415800--Sobic006G082850 Sobic003G392425 Sobic003G392425 Sobic001G415800--Sobic003G392425 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic001G415800--Sobic008G084000 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic001G415800--Sobic008G091785 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic001G415800--Sobic007G007400 Sobic009G047066 Sobic009G047066 Sobic001G415800--Sobic009G047066 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic001G415800--Sobic004G150901 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic001G415800--Sobic010G138600 Sobic001G149201--Sobic008G091785 Sobic001G149201--Sobic007G007400 Sobic001G149201--Sobic006G082850 Sobic001G186700 Sobic001G186700 Sobic001G149201--Sobic001G186700 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic001G149201--Sobic002G106700 SobicK028900 SobicK028900 Sobic001G149201--SobicK028900 Sobic001G149201--Sobic009G047066 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic001G149201--Sobic001G135650 Sobic007G125200 Sobic007G125200 Sobic001G149201--Sobic007G125200 Sobic006G082850--Sobic001G149201 Sobic001G359000 Sobic001G359000 Sobic006G082850--Sobic001G359000 Sobic003G384200 Sobic003G384200 Sobic006G082850--Sobic003G384200 Sobic004G149500 Sobic004G149500 Sobic006G082850--Sobic004G149500 Sobic002G158401 Sobic002G158401 Sobic006G082850--Sobic002G158401 Sobic006G082850--Sobic007G125200 Sobic006G082850--Sobic001G415800 Sobic006G082850--Sobic001G186700 Sobic004G324200 Sobic004G324200 Sobic006G082850--Sobic004G324200 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic003G392425--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic003G392425--Sobic009G021050 Sobic003G392425--Sobic008G084000 Sobic003G392425--Sobic004G150901 Sobic003G392425--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic003G392425--Sobic009G253600 Sobic003G392425--Sobic008G091785 Sobic003G392425--Sobic001G135650 Sobic008G074200 Sobic008G074200 Sobic003G392425--Sobic008G074200 Sobic008G084000--Sobic004G150901 Sobic008G084000--Sobic010G138600 Sobic008G084000--Sobic009G253600 Sobic008G084000--Sobic007G139850 Sobic008G084000--Sobic009G021050 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic008G091785 Sobic008G084000--Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic001G135650 Sobic008G091785--Sobic007G007400 Sobic008G091785--Sobic002G106700 Sobic008G091785--Sobic001G135650 Sobic008G091785--Sobic009G253600 Sobic008G091785--Sobic010G138600 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic008G091785--Sobic003G078000 Sobic008G091785--Sobic004G150901 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic008G091785--Sobic006G230000 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic008G091785--Sobic008G164000 Sobic007G007400--Sobic008G091785 Sobic007G007400--Sobic002G106700 Sobic007G007400--Sobic001G135650 Sobic007G007400--Sobic009G253600 Sobic007G007400--Sobic010G138600 Sobic007G007400--Sobic003G078000 Sobic007G007400--Sobic004G150901 Sobic007G007400--Sobic006G230000 Sobic007G007400--Sobic008G164000 Sobic009G047066--Sobic007G125200 Sobic009G047066--Sobic001G186700 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic009G047066--Sobic001G034200 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic009G047066--Sobic010G012700 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic009G047066--Sobic001G332100 Sobic001G144150 Sobic001G144150 Sobic009G047066--Sobic001G144150 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic009G047066--Sobic002G014300 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic009G047066--Sobic005G191200 Sobic009G047066--Sobic001G149201 Sobic004G150901--Sobic010G138600 Sobic004G150901--Sobic009G253600 Sobic004G150901--Sobic008G084000 Sobic004G150901--Sobic007G139850 Sobic004G150901--Sobic009G021050 Sobic004G150901--Sobic008G091785 Sobic004G150901--Sobic007G007400 Sobic004G150901--Sobic001G135650 Sobic004G150901--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic009G253600 Sobic010G138600--Sobic004G150901 Sobic010G138600--Sobic008G091785 Sobic010G138600--Sobic008G084000 Sobic010G138600--Sobic007G007400 Sobic010G138600--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic007G139850 Sobic010G138600--Sobic009G021050
Octagon: transcription factors


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