Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G063500.1
Synonym Sb03g005420
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XP92
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g06440.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023367
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G384100 ZIP4/SPO22, putative, expressed -
2 Sobic.007G125200 cell division cycle protein 48, putative, expressed K13525: VCP, transitional endoplasmic reticulum ATPase
3 Sobic.009G170900 ATCHX15, putative, expressed -
4 Sobic.010G252550 - -
5 Sobic.001G220250 - -
6 Sobic.003G386350 - -
7 Sobic.006G082850 - -
8 Sobic.001G001066 - -
9 Sobic.001G149201 - -
10 Sobic.002G239800 expressed protein K19307: 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase
11 Sobic.007G136000 - -
12 Sobic.005G160801 - -
13 Sobic.002G390700 serine/threonine-protein kinase Haspin, putative, expressed K16315: serine/threonine-protein kinase haspin
14 Sobic.009G212900 myosin head family protein, expressed K10357: myosin V
15 Sobic.003G106800 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
16 Sobic.009G047066 - -
17 Sobic.008G070600 leafbladeless1, putative, expressed -
18 Sobic.002G074500 shugoshin-1, putative, expressed -
19 Sobic.010G237200 DUF292 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G415800 synaptonemal complex protein 2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G063500 Sobic003G063500 Sobic003G384100 Sobic003G384100 Sobic003G063500--Sobic003G384100 Sobic007G125200 Sobic007G125200 Sobic003G063500--Sobic007G125200 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic003G063500--Sobic009G170900 Sobic010G252550 Sobic010G252550 Sobic003G063500--Sobic010G252550 Sobic001G220250 Sobic001G220250 Sobic003G063500--Sobic001G220250 Sobic003G386350 Sobic003G386350 Sobic003G063500--Sobic003G386350 Sobic006G082850 Sobic006G082850 Sobic003G063500--Sobic006G082850 Sobic001G001066 Sobic001G001066 Sobic003G063500--Sobic001G001066 Sobic001G149201 Sobic001G149201 Sobic003G063500--Sobic001G149201 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic003G384100--Sobic002G074500 Sobic010G237200 Sobic010G237200 Sobic003G384100--Sobic010G237200 Sobic003G384100--Sobic003G063500 Sobic007G143900 Sobic007G143900 Sobic003G384100--Sobic007G143900 Sobic002G239800 Sobic002G239800 Sobic003G384100--Sobic002G239800 Sobic002G095800 Sobic002G095800 Sobic003G384100--Sobic002G095800 Sobic007G172900 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Octagon: transcription factors


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