Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G220250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6U1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G218200 expressed protein -
2 Sobic.003G384100 ZIP4/SPO22, putative, expressed -
3 Sobic.003G063500 expressed protein -
4 Sobic.002G390700 serine/threonine-protein kinase Haspin, putative, expressed K16315: serine/threonine-protein kinase haspin
5 Sobic.002G358100 expressed protein -
6 Sobic.003G158000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@PHS1, putative, expressed K14165: atypical dual specificity phosphatase
7 Sobic.010G078400 expressed protein -
8 Sobic.003G089900 seven in absentia protein family protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G074500 shugoshin-1, putative, expressed -
10 Sobic.008G188800 ankyrin repeat domain-containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G024900 CAMK_CAMK_like_Aur_like.2 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K08850: aurora kinase, other
12 Sobic.010G009100 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G219801 - -
14 Sobic.002G326900 expressed protein K16584: HAUS augmin-like complex subunit 1
15 Sobic.010G237200 DUF292 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G221601 - -
17 Sobic.001G540200 PAIR1, putative, expressed -
18 Sobic.007G146200 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
19 Sobic.009G158900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G239800 expressed protein K19307: 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic001G220250 Sobic001G220250 Sobic006G218200 Sobic006G218200 Sobic001G220250--Sobic006G218200 Sobic003G384100 Sobic003G384100 Sobic001G220250--Sobic003G384100 Sobic003G063500 Sobic003G063500 Sobic001G220250--Sobic003G063500 Sobic002G390700 Sobic002G390700 Sobic001G220250--Sobic002G390700 Sobic002G358100 Sobic002G358100 Sobic001G220250--Sobic002G358100 Sobic003G158000 Sobic003G158000 Sobic001G220250--Sobic003G158000 Sobic010G078400 Sobic010G078400 Sobic001G220250--Sobic010G078400 Sobic003G089900 Sobic003G089900 Sobic001G220250--Sobic003G089900 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic001G220250--Sobic002G074500 Sobic009G037700 Sobic009G037700 Sobic006G218200--Sobic009G037700 Sobic008G188800 Sobic008G188800 Sobic006G218200--Sobic008G188800 Sobic008G070600 Sobic008G070600 Sobic006G218200--Sobic008G070600 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic006G218200--Sobic001G457500 Sobic006G219801 Sobic006G219801 Sobic006G218200--Sobic006G219801 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic006G218200--Sobic007G144100 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic006G218200--Sobic010G058300 Sobic009G047066 Sobic009G047066 Sobic006G218200--Sobic009G047066 Sobic003G072700 Sobic003G072700 Sobic006G218200--Sobic003G072700 Sobic003G384100--Sobic002G074500 Sobic010G237200 Sobic010G237200 Sobic003G384100--Sobic010G237200 Sobic003G384100--Sobic003G063500 Sobic007G143900 Sobic007G143900 Sobic003G384100--Sobic007G143900 Sobic002G239800 Sobic002G239800 Sobic003G384100--Sobic002G239800 Sobic002G095800 Sobic002G095800 Sobic003G384100--Sobic002G095800 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic003G384100--Sobic007G172900 Sobic004G041000 Sobic004G041000 Sobic003G384100--Sobic004G041000 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic003G384100--Sobic010G046200 Sobic003G063500--Sobic003G384100 Sobic007G125200 Sobic007G125200 Sobic003G063500--Sobic007G125200 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic003G063500--Sobic009G170900 Sobic010G252550 Sobic010G252550 Sobic003G063500--Sobic010G252550 Sobic003G063500--Sobic001G220250 Sobic003G386350 Sobic003G386350 Sobic003G063500--Sobic003G386350 Sobic006G082850 Sobic006G082850 Sobic003G063500--Sobic006G082850 Sobic001G001066 Sobic001G001066 Sobic003G063500--Sobic001G001066 Sobic001G149201 Sobic001G149201 Sobic003G063500--Sobic001G149201 Sobic002G390700--Sobic010G078400 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic002G390700--Sobic001G303300 Sobic001G221601 Sobic001G221601 Sobic002G390700--Sobic001G221601 Sobic002G390700--Sobic002G074500 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic002G390700--Sobic003G106800 Sobic003G092000 Sobic003G092000 Sobic002G390700--Sobic003G092000 Sobic009G166650 Sobic009G166650 Sobic002G390700--Sobic009G166650 Sobic009G014500 Sobic009G014500 Sobic002G390700--Sobic009G014500 Sobic002G390700--Sobic002G239800 Sobic002G270900 Sobic002G270900 Sobic002G358100--Sobic002G270900 Sobic007G144000 Sobic007G144000 Sobic002G358100--Sobic007G144000 Sobic004G102200 Sobic004G102200 Sobic002G358100--Sobic004G102200 Sobic009G070500 Sobic009G070500 Sobic002G358100--Sobic009G070500 Sobic007G165800 Sobic007G165800 Sobic002G358100--Sobic007G165800 Sobic009G185900 Sobic009G185900 Sobic002G358100--Sobic009G185900 Sobic003G298700 Sobic003G298700 Sobic002G358100--Sobic003G298700 Sobic001G434100 Sobic001G434100 Sobic002G358100--Sobic001G434100 Sobic001G540200 Sobic001G540200 Sobic002G358100--Sobic001G540200 Sobic003G158000--Sobic009G037700 Sobic003G158000--Sobic006G218200 Sobic001G186700 Sobic001G186700 Sobic003G158000--Sobic001G186700 Sobic003G158000--Sobic007G125200 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic003G158000--Sobic009G138401 Sobic010G086100 Sobic010G086100 Sobic003G158000--Sobic010G086100 Sobic002G402100 Sobic002G402100 Sobic003G158000--Sobic002G402100 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic003G158000--Sobic002G027901 Sobic010G037500 Sobic010G037500 Sobic003G158000--Sobic010G037500 Sobic010G078400--Sobic002G390700 Sobic010G078400--Sobic003G092000 Sobic006G137300 Sobic006G137300 Sobic010G078400--Sobic006G137300 Sobic001G001700 Sobic001G001700 Sobic010G078400--Sobic001G001700 Sobic010G078400--Sobic002G239800 Sobic005G164900 Sobic005G164900 Sobic010G078400--Sobic005G164900 Sobic001G088000 Sobic001G088000 Sobic010G078400--Sobic001G088000 Sobic002G038500 Sobic002G038500 Sobic010G078400--Sobic002G038500 Sobic010G078400--Sobic002G074500 Sobic003G089900--Sobic003G386350 Sobic007G220066 Sobic007G220066 Sobic003G089900--Sobic007G220066 Sobic004G056100 Sobic004G056100 Sobic003G089900--Sobic004G056100 Sobic002G105501 Sobic002G105501 Sobic003G089900--Sobic002G105501 Sobic003G089900--Sobic010G046200 Sobic003G089900--Sobic001G001066 Sobic009G066000 Sobic009G066000 Sobic003G089900--Sobic009G066000 Sobic003G331550 Sobic003G331550 Sobic003G089900--Sobic003G331550 Sobic003G089900--Sobic007G172900 Sobic002G074500--Sobic003G384100 Sobic002G074500--Sobic002G239800 Sobic002G074500--Sobic009G014500 Sobic002G074500--Sobic002G390700 Sobic001G497800 Sobic001G497800 Sobic002G074500--Sobic001G497800 Sobic006G087800 Sobic006G087800 Sobic002G074500--Sobic006G087800 Sobic001G538275 Sobic001G538275 Sobic002G074500--Sobic001G538275 Sobic002G074500--Sobic002G095800 Sobic002G074500--Sobic001G001700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.