Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G326900.2,Sobic.002G326900.1
Synonym Sb02g035380
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XAR4 , A0A1B6QEQ3
Pfam -
Panther DB PTHR31570
NCBI CDD -
KEGG Orthology K16584; HAUS augmin-like complex subunit 1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G41350 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14220.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030918
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G060640.1 , HORVU7Hr1G060640.3 , HORVU7Hr1G060640.4
Wheat TraesCS7A02G286800 , TraesCS7D02G287800 , TraesCS7B02G197500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G326900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G151300 MIF4G domain containing protein, putative, expressed -
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11 Sobic.001G497800 DUF623 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G220250 - -
13 Sobic.009G227300 "BG3(Ortholog in rice:Xiao et al., 2018)"(PubMedID : 31659926)@purine permease, putative, expressed -
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16 Sobic.007G088700 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.001G129500 - -
18 Sobic.002G239800 expressed protein K19307: 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase
19 Sobic.006G084701 - -
20 Sobic.003G089900 seven in absentia protein family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G326900 Sobic002G326900 Sobic006G151300 Sobic006G151300 Sobic002G326900--Sobic006G151300 Sobic010G058400 Sobic010G058400 Sobic002G326900--Sobic010G058400 Sobic001G043700 Sobic001G043700 Sobic002G326900--Sobic001G043700 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic002G326900--Sobic002G074500 Sobic001G127600 Sobic001G127600 Sobic002G326900--Sobic001G127600 Sobic003G203900 Sobic003G203900 Sobic002G326900--Sobic003G203900 Sobic004G330300 Sobic004G330300 Sobic002G326900--Sobic004G330300 Sobic003G384100 Sobic003G384100 Sobic002G326900--Sobic003G384100 Sobic004G041100 Sobic004G041100 Sobic002G326900--Sobic004G041100 Sobic006G151300--Sobic001G127600 Sobic006G151300--Sobic002G326900 Sobic006G151300--Sobic003G203900 Sobic009G227300 Sobic009G227300 Sobic006G151300--Sobic009G227300 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic006G151300--Sobic005G102600 Sobic003G049000 Sobic003G049000 Sobic006G151300--Sobic003G049000 Sobic001G122700 Sobic001G122700 Sobic006G151300--Sobic001G122700 Sobic006G151300--Sobic010G058400 Sobic006G151300--Sobic002G074500 Sobic001G497800 Sobic001G497800 Sobic010G058400--Sobic001G497800 Sobic006G234500 Sobic006G234500 Sobic010G058400--Sobic006G234500 Sobic010G058400--Sobic003G049000 Sobic004G041000 Sobic004G041000 Sobic010G058400--Sobic004G041000 Sobic010G248100 Sobic010G248100 Sobic010G058400--Sobic010G248100 Sobic010G058400--Sobic002G074500 Sobic010G058400--Sobic002G326900 Sobic004G205700 Sobic004G205700 Sobic010G058400--Sobic004G205700 Sobic007G157400 Sobic007G157400 Sobic010G058400--Sobic007G157400 Sobic002G253900 Sobic002G253900 Sobic001G043700--Sobic002G253900 Sobic004G014100 Sobic004G014100 Sobic001G043700--Sobic004G014100 Sobic001G043700--Sobic004G041100 Sobic005G033700 Sobic005G033700 Sobic001G043700--Sobic005G033700 Sobic009G148000 Sobic009G148000 Sobic001G043700--Sobic009G148000 Sobic008G045800 Sobic008G045800 Sobic001G043700--Sobic008G045800 Sobic001G534400 Sobic001G534400 Sobic001G043700--Sobic001G534400 Sobic009G254000 Sobic009G254000 Sobic001G043700--Sobic009G254000 Sobic005G160200 Sobic005G160200 Sobic001G043700--Sobic005G160200 Sobic002G074500--Sobic003G384100 Sobic002G239800 Sobic002G239800 Sobic002G074500--Sobic002G239800 Sobic009G014500 Sobic009G014500 Sobic002G074500--Sobic009G014500 Sobic002G390700 Sobic002G390700 Sobic002G074500--Sobic002G390700 Sobic002G074500--Sobic001G497800 Sobic006G087800 Sobic006G087800 Sobic002G074500--Sobic006G087800 Sobic001G538275 Sobic001G538275 Sobic002G074500--Sobic001G538275 Sobic002G095800 Sobic002G095800 Sobic002G074500--Sobic002G095800 Sobic001G001700 Sobic001G001700 Sobic002G074500--Sobic001G001700 Sobic001G127600--Sobic001G122700 Sobic001G127600--Sobic005G102600 Sobic002G089300 Sobic002G089300 Sobic001G127600--Sobic002G089300 Sobic004G196900 Sobic004G196900 Sobic001G127600--Sobic004G196900 Sobic006G229400 Sobic006G229400 Sobic001G127600--Sobic006G229400 Sobic009G185000 Sobic009G185000 Sobic001G127600--Sobic009G185000 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic001G127600--Sobic009G244450 Sobic002G341400 Sobic002G341400 Sobic001G127600--Sobic002G341400 Sobic005G029300 Sobic005G029300 Sobic001G127600--Sobic005G029300 Sobic003G203900--Sobic005G102600 Sobic002G320300 Sobic002G320300 Sobic003G203900--Sobic002G320300 Sobic001G197700 Sobic001G197700 Sobic003G203900--Sobic001G197700 Sobic003G203900--Sobic001G122700 Sobic003G203900--Sobic003G049000 Sobic010G069700 Sobic010G069700 Sobic003G203900--Sobic010G069700 Sobic009G064700 Sobic009G064700 Sobic003G203900--Sobic009G064700 Sobic003G203900--Sobic006G151300 Sobic004G172000 Sobic004G172000 Sobic003G203900--Sobic004G172000 Sobic002G319400 Sobic002G319400 Sobic004G330300--Sobic002G319400 Sobic002G368000 Sobic002G368000 Sobic004G330300--Sobic002G368000 Sobic004G330300--Sobic010G058400 Sobic004G330300--Sobic005G033700 Sobic004G330300--Sobic003G049000 Sobic004G330300--Sobic001G497800 Sobic003G029900 Sobic003G029900 Sobic004G330300--Sobic003G029900 Sobic001G171100 Sobic001G171100 Sobic004G330300--Sobic001G171100 Sobic004G330300--Sobic002G326900 Sobic003G384100--Sobic002G074500 Sobic010G237200 Sobic010G237200 Sobic003G384100--Sobic010G237200 Sobic003G063500 Sobic003G063500 Sobic003G384100--Sobic003G063500 Sobic007G143900 Sobic007G143900 Sobic003G384100--Sobic007G143900 Sobic003G384100--Sobic002G239800 Sobic003G384100--Sobic002G095800 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic003G384100--Sobic007G172900 Sobic003G384100--Sobic004G041000 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic003G384100--Sobic010G046200 Sobic001G425200 Sobic001G425200 Sobic004G041100--Sobic001G425200 Sobic003G411700 Sobic003G411700 Sobic004G041100--Sobic003G411700 Sobic007G197100 Sobic007G197100 Sobic004G041100--Sobic007G197100 Sobic003G298900 Sobic003G298900 Sobic004G041100--Sobic003G298900 Sobic009G005700 Sobic009G005700 Sobic004G041100--Sobic009G005700 Sobic004G041100--Sobic001G043700 Sobic001G212600 Sobic001G212600 Sobic004G041100--Sobic001G212600 Sobic004G041100--Sobic009G254000 Sobic001G540700 Sobic001G540700 Sobic004G041100--Sobic001G540700
Octagon: transcription factors


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