Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G368000.3,Sobic.002G368000.2,Sobic.002G368000.1
Synonym Sb02g038710, PGL1
Functional annotation 6-phosphogluconolactonase, putative, expressed
UniProt C5XDV9
Pfam PF01182
Panther DB PTHR11054 PTHR11054:SF5
NCBI CDD KOG3147; 6-phosphogluconolactonase - like protein
KEGG Orthology K01057; PGLS, pgl, 6-phosphogluconolactonase
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13700 : 6-phosphogluconolactonase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g41280.3 : 6-phosphogluconolactonase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048694
Brachypodium KQK15344
Barley HORVU2Hr1G032970.1 , HORVU2Hr1G032970.3 , HORVU2Hr1G032970.2 , HORVU2Hr1G032970.5 , HORVU2Hr1G032970.4 , HORVU2Hr1G032970.7 , HORVU2Hr1G032970.6 , HORVU2Hr1G032970.8
Wheat TraesCS2B02G201700 , TraesCS2B02G201700 , TraesCS2A02G175400 , TraesCS2D02G182700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G368000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G072050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G368000 Sobic002G368000 Sobic010G248100 Sobic010G248100 Sobic002G368000--Sobic010G248100 Sobic004G041000 Sobic004G041000 Sobic002G368000--Sobic004G041000 Sobic003G049000 Sobic003G049000 Sobic002G368000--Sobic003G049000 Sobic010G058400 Sobic010G058400 Sobic002G368000--Sobic010G058400 Sobic004G330300 Sobic004G330300 Sobic002G368000--Sobic004G330300 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic002G368000--Sobic007G172900 Sobic003G303000 Sobic003G303000 Sobic002G368000--Sobic003G303000 Sobic002G018250 Sobic002G018250 Sobic002G368000--Sobic002G018250 Sobic005G024600 Sobic005G024600 Sobic002G368000--Sobic005G024600 Sobic010G248100--Sobic002G368000 Sobic010G248100--Sobic004G041000 Sobic010G248100--Sobic003G049000 Sobic010G248100--Sobic003G303000 Sobic005G008700 Sobic005G008700 Sobic010G248100--Sobic005G008700 Sobic010G248100--Sobic010G058400 Sobic004G196900 Sobic004G196900 Sobic010G248100--Sobic004G196900 Sobic002G141050 Sobic002G141050 Sobic010G248100--Sobic002G141050 Sobic002G089300 Sobic002G089300 Sobic010G248100--Sobic002G089300 Sobic004G041000--Sobic003G049000 Sobic004G041000--Sobic003G303000 Sobic006G234500 Sobic006G234500 Sobic004G041000--Sobic006G234500 Sobic003G063600 Sobic003G063600 Sobic004G041000--Sobic003G063600 Sobic002G348200 Sobic002G348200 Sobic004G041000--Sobic002G348200 Sobic004G041000--Sobic005G008700 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic004G041000--Sobic003G049100 Sobic003G429101 Sobic003G429101 Sobic004G041000--Sobic003G429101 Sobic004G041000--Sobic007G172900 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic003G049000--Sobic005G102600 Sobic003G049000--Sobic004G041000 Sobic005G050700 Sobic005G050700 Sobic003G049000--Sobic005G050700 Sobic001G122700 Sobic001G122700 Sobic003G049000--Sobic001G122700 Sobic005G149650 Sobic005G149650 Sobic003G049000--Sobic005G149650 Sobic003G049000--Sobic002G018250 Sobic003G049000--Sobic010G058400 Sobic002G018000 Sobic002G018000 Sobic003G049000--Sobic002G018000 Sobic001G127600 Sobic001G127600 Sobic003G049000--Sobic001G127600 Sobic001G497800 Sobic001G497800 Sobic010G058400--Sobic001G497800 Sobic010G058400--Sobic006G234500 Sobic010G058400--Sobic003G049000 Sobic010G058400--Sobic004G041000 Sobic010G058400--Sobic010G248100 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic010G058400--Sobic002G074500 Sobic002G326900 Sobic002G326900 Sobic010G058400--Sobic002G326900 Sobic004G205700 Sobic004G205700 Sobic010G058400--Sobic004G205700 Sobic007G157400 Sobic007G157400 Sobic010G058400--Sobic007G157400 Sobic002G319400 Sobic002G319400 Sobic004G330300--Sobic002G319400 Sobic004G330300--Sobic002G368000 Sobic004G330300--Sobic010G058400 Sobic005G033700 Sobic005G033700 Sobic004G330300--Sobic005G033700 Sobic004G330300--Sobic003G049000 Sobic004G330300--Sobic001G497800 Sobic003G029900 Sobic003G029900 Sobic004G330300--Sobic003G029900 Sobic001G171100 Sobic001G171100 Sobic004G330300--Sobic001G171100 Sobic004G330300--Sobic002G326900 Sobic004G056100 Sobic004G056100 Sobic007G172900--Sobic004G056100 Sobic006G115400 Sobic006G115400 Sobic007G172900--Sobic006G115400 Sobic009G066000 Sobic009G066000 Sobic007G172900--Sobic009G066000 Sobic007G139950 Sobic007G139950 Sobic007G172900--Sobic007G139950 Sobic007G172900--Sobic005G008700 Sobic003G331550 Sobic003G331550 Sobic007G172900--Sobic003G331550 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic007G172900--Sobic010G046200 Sobic003G162200 Sobic003G162200 Sobic007G172900--Sobic003G162200 Sobic007G220066 Sobic007G220066 Sobic007G172900--Sobic007G220066 Sobic003G303000--Sobic003G429101 Sobic005G163450 Sobic005G163450 Sobic003G303000--Sobic005G163450 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic003G303000--Sobic006G261000 Sobic001G388100 Sobic001G388100 Sobic003G303000--Sobic001G388100 Sobic003G241400 Sobic003G241400 Sobic003G303000--Sobic003G241400 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic003G303000--Sobic005G156800 Sobic002G380750 Sobic002G380750 Sobic003G303000--Sobic002G380750 Sobic003G303000--Sobic004G041000 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic003G303000--Sobic009G214700 Sobic010G207450 Sobic010G207450 Sobic002G018250--Sobic010G207450 Sobic010G200100 Sobic010G200100 Sobic002G018250--Sobic010G200100 Sobic001G220600 Sobic001G220600 Sobic002G018250--Sobic001G220600 Sobic002G018250--Sobic005G102600 Sobic002G018250--Sobic002G141050 Sobic006G080200 Sobic006G080200 Sobic002G018250--Sobic006G080200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic002G018250--Sobic002G059100 Sobic010G069700 Sobic010G069700 Sobic002G018250--Sobic010G069700 Sobic002G018250--Sobic002G018000 Sobic009G205000 Sobic009G205000 Sobic005G024600--Sobic009G205000 Sobic005G024600--Sobic003G303000 Sobic008G072050 Sobic008G072050 Sobic005G024600--Sobic008G072050 Sobic005G110550 Sobic005G110550 Sobic005G024600--Sobic005G110550 Sobic007G202000 Sobic007G202000 Sobic005G024600--Sobic007G202000 Sobic005G024600--Sobic004G041000 Sobic003G399900 Sobic003G399900 Sobic005G024600--Sobic003G399900 Sobic010G202900 Sobic010G202900 Sobic005G024600--Sobic010G202900 Sobic005G024600--Sobic007G172900
Octagon: transcription factors


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