Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G043700.3
Synonym Sb01g004020
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WW23
Pfam -
Panther DB PTHR36005
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G75150 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g59480.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016497 , Zm00025a008704
Brachypodium KQK12560
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G253900 growth regulator related protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G014100 sialyltransferase family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G041100 ATEXO70G1, putative, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
4 Sobic.005G033700 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G148000 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
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7 Sobic.001G534400 - -
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10 Sobic.003G013800 expressed protein -
11 Sobic.004G250600 NHL repeat-containing protein, putative, expressed -
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13 Sobic.005G143100 expressed protein -
14 Sobic.003G343200 outer membrane protein, OMP85 family protein, expressed K07277: SAM50, TOB55, outer membrane protein insertion porin family
15 Sobic.010G212700 tetraspanin family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G217500 expressed protein -
17 Sobic.002G343000 expressed protein -
18 Sobic.006G200901 - -
19 Sobic.007G036750 - -
20 Sobic.010G180200 transcription factor S-II, central domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G043700 Sobic001G043700 Sobic002G253900 Sobic002G253900 Sobic001G043700--Sobic002G253900 Sobic004G014100 Sobic004G014100 Sobic001G043700--Sobic004G014100 Sobic004G041100 Sobic004G041100 Sobic001G043700--Sobic004G041100 Sobic005G033700 Sobic005G033700 Sobic001G043700--Sobic005G033700 Sobic009G148000 Sobic009G148000 Sobic001G043700--Sobic009G148000 Sobic008G045800 Sobic008G045800 Sobic001G043700--Sobic008G045800 Sobic001G534400 Sobic001G534400 Sobic001G043700--Sobic001G534400 Sobic009G254000 Sobic009G254000 Sobic001G043700--Sobic009G254000 Sobic005G160200 Sobic005G160200 Sobic001G043700--Sobic005G160200 Sobic002G253900--Sobic009G148000 Sobic001G123100 Sobic001G123100 Sobic002G253900--Sobic001G123100 Sobic006G200901 Sobic006G200901 Sobic002G253900--Sobic006G200901 Sobic002G343000 Sobic002G343000 Sobic002G253900--Sobic002G343000 Sobic001G005800 Sobic001G005800 Sobic002G253900--Sobic001G005800 Sobic001G540700 Sobic001G540700 Sobic002G253900--Sobic001G540700 Sobic006G218900 Sobic006G218900 Sobic002G253900--Sobic006G218900 Sobic002G284100 Sobic002G284100 Sobic002G253900--Sobic002G284100 Sobic002G006100 Sobic002G006100 Sobic002G253900--Sobic002G006100 Sobic004G014100--Sobic002G343000 Sobic004G014100--Sobic006G200901 Sobic004G014100--Sobic005G160200 Sobic006G143300 Sobic006G143300 Sobic004G014100--Sobic006G143300 Sobic003G343200 Sobic003G343200 Sobic004G014100--Sobic003G343200 Sobic002G349000 Sobic002G349000 Sobic004G014100--Sobic002G349000 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic004G014100--Sobic002G230400 Sobic002G354800 Sobic002G354800 Sobic004G014100--Sobic002G354800 Sobic006G140300 Sobic006G140300 Sobic004G014100--Sobic006G140300 Sobic001G425200 Sobic001G425200 Sobic004G041100--Sobic001G425200 Sobic003G411700 Sobic003G411700 Sobic004G041100--Sobic003G411700 Sobic007G197100 Sobic007G197100 Sobic004G041100--Sobic007G197100 Sobic003G298900 Sobic003G298900 Sobic004G041100--Sobic003G298900 Sobic009G005700 Sobic009G005700 Sobic004G041100--Sobic009G005700 Sobic004G041100--Sobic001G043700 Sobic001G212600 Sobic001G212600 Sobic004G041100--Sobic001G212600 Sobic004G041100--Sobic009G254000 Sobic004G041100--Sobic001G540700 Sobic005G033700--Sobic006G143300 Sobic002G122000 Sobic002G122000 Sobic005G033700--Sobic002G122000 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic005G033700--Sobic006G186300 Sobic008G041900 Sobic008G041900 Sobic005G033700--Sobic008G041900 Sobic001G081800 Sobic001G081800 Sobic005G033700--Sobic001G081800 Sobic001G171100 Sobic001G171100 Sobic005G033700--Sobic001G171100 Sobic005G033700--Sobic006G200901 Sobic005G033700--Sobic002G343000 Sobic003G029900 Sobic003G029900 Sobic005G033700--Sobic003G029900 Sobic009G148000--Sobic002G343000 Sobic009G148000--Sobic002G253900 Sobic009G148000--Sobic006G200901 Sobic009G148000--Sobic006G186300 Sobic003G217500 Sobic003G217500 Sobic009G148000--Sobic003G217500 Sobic009G148000--Sobic001G005800 Sobic009G148000--Sobic004G014100 Sobic009G148000--Sobic008G041900 Sobic004G250600 Sobic004G250600 Sobic009G148000--Sobic004G250600 Sobic008G045800--Sobic001G005800 Sobic009G257500 Sobic009G257500 Sobic008G045800--Sobic009G257500 Sobic008G045800--Sobic004G014100 Sobic010G262900 Sobic010G262900 Sobic008G045800--Sobic010G262900 Sobic010G180200 Sobic010G180200 Sobic008G045800--Sobic010G180200 Sobic008G045800--Sobic006G200901 Sobic008G045800--Sobic002G230400 Sobic010G236200 Sobic010G236200 Sobic008G045800--Sobic010G236200 Sobic004G075700 Sobic004G075700 Sobic008G045800--Sobic004G075700 Sobic010G257500 Sobic010G257500 Sobic001G534400--Sobic010G257500 Sobic001G534400--Sobic003G343200 Sobic010G009600 Sobic010G009600 Sobic001G534400--Sobic010G009600 Sobic008G087200 Sobic008G087200 Sobic001G534400--Sobic008G087200 Sobic001G534400--Sobic004G014100 Sobic001G534400--Sobic005G160200 Sobic006G184200 Sobic006G184200 Sobic001G534400--Sobic006G184200 Sobic008G174500 Sobic008G174500 Sobic001G534400--Sobic008G174500 Sobic002G271400 Sobic002G271400 Sobic001G534400--Sobic002G271400 Sobic009G254000--Sobic006G140300 Sobic009G254000--Sobic007G197100 Sobic009G254000--Sobic003G298900 Sobic002G366000 Sobic002G366000 Sobic009G254000--Sobic002G366000 Sobic009G254000--Sobic001G540700 Sobic003G224700 Sobic003G224700 Sobic009G254000--Sobic003G224700 Sobic009G254000--Sobic002G006100 Sobic009G254000--Sobic004G250600 Sobic005G013300 Sobic005G013300 Sobic009G254000--Sobic005G013300 Sobic005G160200--Sobic004G014100 Sobic005G160200--Sobic003G411700 Sobic005G160200--Sobic003G343200 Sobic006G091850 Sobic006G091850 Sobic005G160200--Sobic006G091850 Sobic002G315100 Sobic002G315100 Sobic005G160200--Sobic002G315100 Sobic010G038900 Sobic010G038900 Sobic005G160200--Sobic010G038900 Sobic005G160200--Sobic010G257500 Sobic005G160200--Sobic001G534400 Sobic004G350200 Sobic004G350200 Sobic005G160200--Sobic004G350200
Octagon: transcription factors


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