Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G078400.3,Sobic.010G078400.2
Synonym Sb10g006810
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z6D5
Pfam PF08879
Panther DB PTHR31602 PTHR31602:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006351; transcription, DNA-templated GO:0005634nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G42040 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g10570.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049611 , Zm00025a033051
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G078990.3 , HORVU6Hr1G078990.2 , HORVU6Hr1G078990.4
Wheat TraesCS6D02G303100 , TraesCS7D02G168400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G390700 serine/threonine-protein kinase Haspin, putative, expressed K16315: serine/threonine-protein kinase haspin
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4 Sobic.001G001700 - -
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6 Sobic.005G164900 expressed protein -
7 Sobic.001G088000 expressed protein -
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20 Sobic.002G095200 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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