Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G188800.1
Synonym Sb08g022950
Functional annotation ankyrin repeat domain-containing protein, putative, expressed
UniProt C5YT08
Pfam PF00515 PF13414 PF12796
Panther DB PTHR22904 PTHR22904:SF357
NCBI CDD KOG4412; 26S proteasome regulatory complex, subunit PSMD10
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G04710 : ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43940.1 : ankyrin repeat domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004837
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3A02G465100 , TraesCS5A02G011000 , TraesCS5A02G011000 , TraesCS1A02G048400 , TraesCS6B02G364200 , TraesCS3D02G460400 , TraesCS3D02G460400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G146200 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
2 Sobic.005G008850 - -
3 Sobic.006G152700 - -
4 Sobic.009G125800 expressed protein -
5 Sobic.008G140600 targeting protein for Xklp2 containing protein, expressed -
6 Sobic.003G377300 expressed protein K11643: CHD4, chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4
7 Sobic.002G322700 expressed protein -
8 Sobic.003G072700 expressed protein -
9 Sobic.010G009700 OsFBX182 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G136000 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
11 Sobic.005G045800 serine/threonine-protein kinase WNK4, putative, expressed K08867: WNK, WNK lysine deficient protein kinase
12 Sobic.004G062600 OsFBX154 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G117400 expressed protein -
14 Sobic.009G084700 - -
15 Sobic.006G218200 expressed protein -
16 Sobic.002G299500 expressed protein -
17 Sobic.010G038200 CDT1A - Putative DNA replication initiation protein, expressed K10727: chromatin licensing and DNA replication factor 1
18 Sobic.008G171900 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
19 Sobic.010G263400 expressed protein -
20 Sobic.007G141600 ZOS8-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G188800 Sobic008G188800 Sobic007G146200 Sobic007G146200 Sobic008G188800--Sobic007G146200 Sobic005G008850 Sobic005G008850 Sobic008G188800--Sobic005G008850 Sobic006G152700 Sobic006G152700 Sobic008G188800--Sobic006G152700 Sobic009G125800 Sobic009G125800 Sobic008G188800--Sobic009G125800 Sobic008G140600 Sobic008G140600 Sobic008G188800--Sobic008G140600 Sobic003G377300 Sobic003G377300 Sobic008G188800--Sobic003G377300 Sobic002G322700 Sobic002G322700 Sobic008G188800--Sobic002G322700 Sobic003G072700 Sobic003G072700 Sobic008G188800--Sobic003G072700 Sobic010G009700 Sobic010G009700 Sobic008G188800--Sobic010G009700 Sobic007G146200--Sobic002G322700 Sobic007G146200--Sobic008G188800 Sobic007G146200--Sobic003G072700 Sobic007G146200--Sobic010G009700 Sobic007G146200--Sobic009G125800 Sobic007G146200--Sobic006G152700 Sobic005G045800 Sobic005G045800 Sobic007G146200--Sobic005G045800 Sobic007G141600 Sobic007G141600 Sobic007G146200--Sobic007G141600 Sobic007G146200--Sobic008G140600 Sobic005G008850--Sobic008G188800 Sobic005G008850--Sobic003G377300 Sobic005G008850--Sobic009G125800 Sobic001G385300 Sobic001G385300 Sobic005G008850--Sobic001G385300 Sobic008G171900 Sobic008G171900 Sobic005G008850--Sobic008G171900 Sobic005G008850--Sobic007G146200 Sobic001G153500 Sobic001G153500 Sobic005G008850--Sobic001G153500 Sobic005G008850--Sobic007G141600 Sobic005G008850--Sobic010G009700 Sobic007G012600 Sobic007G012600 Sobic006G152700--Sobic007G012600 Sobic006G152700--Sobic003G072700 Sobic003G396500 Sobic003G396500 Sobic006G152700--Sobic003G396500 Sobic006G152700--Sobic003G377300 Sobic006G152700--Sobic008G188800 Sobic006G152700--Sobic008G140600 Sobic009G142500 Sobic009G142500 Sobic006G152700--Sobic009G142500 Sobic006G152700--Sobic007G146200 Sobic003G258100 Sobic003G258100 Sobic006G152700--Sobic003G258100 Sobic009G136000 Sobic009G136000 Sobic009G125800--Sobic009G136000 Sobic004G117400 Sobic004G117400 Sobic009G125800--Sobic004G117400 Sobic001G082800 Sobic001G082800 Sobic009G125800--Sobic001G082800 Sobic009G131200 Sobic009G131200 Sobic009G125800--Sobic009G131200 Sobic002G390800 Sobic002G390800 Sobic009G125800--Sobic002G390800 Sobic009G125800--Sobic010G009700 Sobic009G125800--Sobic007G146200 Sobic009G125800--Sobic008G188800 Sobic009G214500 Sobic009G214500 Sobic009G125800--Sobic009G214500 Sobic008G140600--Sobic003G377300 Sobic009G168100 Sobic009G168100 Sobic008G140600--Sobic009G168100 Sobic003G102100 Sobic003G102100 Sobic008G140600--Sobic003G102100 Sobic010G090000 Sobic010G090000 Sobic008G140600--Sobic010G090000 Sobic008G140600--Sobic005G045800 Sobic008G104000 Sobic008G104000 Sobic008G140600--Sobic008G104000 Sobic008G140600--Sobic007G141600 Sobic010G261800 Sobic010G261800 Sobic008G140600--Sobic010G261800 Sobic008G140600--Sobic002G322700 Sobic003G377300--Sobic008G140600 Sobic003G377300--Sobic009G142500 Sobic003G377300--Sobic010G261800 Sobic002G151500 Sobic002G151500 Sobic003G377300--Sobic002G151500 Sobic003G377300--Sobic010G090000 Sobic003G377300--Sobic007G141600 Sobic003G377300--Sobic006G152700 Sobic003G379000 Sobic003G379000 Sobic003G377300--Sobic003G379000 Sobic003G377300--Sobic009G168100 Sobic002G322700--Sobic010G009700 Sobic002G322700--Sobic005G045800 Sobic002G322700--Sobic007G146200 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic002G322700--Sobic001G131900 Sobic002G322700--Sobic008G140600 Sobic002G322700--Sobic001G385300 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic002G322700--Sobic007G105700 Sobic009G066200 Sobic009G066200 Sobic002G322700--Sobic009G066200 Sobic002G322700--Sobic008G188800 Sobic010G263400 Sobic010G263400 Sobic003G072700--Sobic010G263400 Sobic004G014500 Sobic004G014500 Sobic003G072700--Sobic004G014500 Sobic003G072700--Sobic006G152700 Sobic003G072700--Sobic003G379000 Sobic003G072700--Sobic007G141600 Sobic003G072700--Sobic003G258100 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic003G072700--Sobic002G299500 Sobic006G115900 Sobic006G115900 Sobic003G072700--Sobic006G115900 Sobic003G072700--Sobic007G146200 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic010G009700--Sobic004G298600 Sobic010G009700--Sobic001G131900 Sobic010G038200 Sobic010G038200 Sobic010G009700--Sobic010G038200 Sobic006G189000 Sobic006G189000 Sobic010G009700--Sobic006G189000 Sobic005G060100 Sobic005G060100 Sobic010G009700--Sobic005G060100 Sobic009G054400 Sobic009G054400 Sobic010G009700--Sobic009G054400 Sobic010G009700--Sobic002G322700 Sobic010G009700--Sobic002G151500 Sobic007G102300 Sobic007G102300 Sobic010G009700--Sobic007G102300
Octagon: transcription factors


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