Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G392425.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W101
Pfam PF00161
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0017148; negative regulation of translation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g03280.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G139850 - -
2 Sobic.009G021050 - -
3 Sobic.008G084000 - -
4 Sobic.004G150901 - -
5 Sobic.010G138600 expressed protein -
6 Sobic.009G253600 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
7 Sobic.008G091785 - -
8 Sobic.001G135650 - -
9 Sobic.008G074200 "Belonging to the Sdw3 locus, Sbi_sdw3"(PubMedID : 20464438)@expressed protein -
10 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
11 Sobic.003G078000 - -
12 Sobic.K044420 - -
13 Sobic.005G152550 - -
14 Sobic.007G191000 DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G106700 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
16 Sobic.001G149201 - -
17 Sobic.006G004800 expressed protein -
18 Sobic.008G181701 - -
19 Sobic.001G246800 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.001G415800 synaptonemal complex protein 2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G392425 Sobic003G392425 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic003G392425--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic003G392425--Sobic009G021050 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic003G392425--Sobic008G084000 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic003G392425--Sobic004G150901 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic003G392425--Sobic010G138600 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic003G392425--Sobic009G253600 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic003G392425--Sobic008G091785 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic003G392425--Sobic001G135650 Sobic008G074200 Sobic008G074200 Sobic003G392425--Sobic008G074200 Sobic007G139850--Sobic009G021050 Sobic007G139850--Sobic004G150901 Sobic007G139850--Sobic008G084000 Sobic007G139850--Sobic010G138600 Sobic007G139850--Sobic009G253600 Sobic007G139850--Sobic008G074200 SobicK044420 SobicK044420 Sobic007G139850--SobicK044420 Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic007G139850--Sobic005G152550 Sobic008G181701 Sobic008G181701 Sobic007G139850--Sobic008G181701 Sobic009G021050--Sobic007G139850 Sobic009G021050--Sobic004G150901 Sobic009G021050--Sobic008G084000 Sobic009G021050--Sobic010G138600 Sobic009G021050--Sobic009G253600 Sobic009G021050--SobicK044420 Sobic009G021050--Sobic008G074200 Sobic009G021050--Sobic005G152550 Sobic009G021050--Sobic008G181701 Sobic008G084000--Sobic004G150901 Sobic008G084000--Sobic010G138600 Sobic008G084000--Sobic009G253600 Sobic008G084000--Sobic007G139850 Sobic008G084000--Sobic009G021050 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic008G091785 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic001G135650 Sobic004G150901--Sobic010G138600 Sobic004G150901--Sobic009G253600 Sobic004G150901--Sobic008G084000 Sobic004G150901--Sobic007G139850 Sobic004G150901--Sobic009G021050 Sobic004G150901--Sobic008G091785 Sobic004G150901--Sobic007G007400 Sobic004G150901--Sobic001G135650 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic004G150901--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic009G253600 Sobic010G138600--Sobic004G150901 Sobic010G138600--Sobic008G091785 Sobic010G138600--Sobic008G084000 Sobic010G138600--Sobic007G007400 Sobic010G138600--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic007G139850 Sobic010G138600--Sobic009G021050 Sobic009G253600--Sobic010G138600 Sobic009G253600--Sobic004G150901 Sobic009G253600--Sobic008G091785 Sobic009G253600--Sobic008G084000 Sobic009G253600--Sobic007G007400 Sobic009G253600--Sobic002G106700 Sobic009G253600--Sobic001G135650 Sobic009G253600--Sobic007G139850 Sobic009G253600--Sobic009G021050 Sobic008G091785--Sobic007G007400 Sobic008G091785--Sobic002G106700 Sobic008G091785--Sobic001G135650 Sobic008G091785--Sobic009G253600 Sobic008G091785--Sobic010G138600 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic008G091785--Sobic003G078000 Sobic008G091785--Sobic004G150901 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic008G091785--Sobic006G230000 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic008G091785--Sobic008G164000 Sobic001G135650--Sobic008G091785 Sobic001G135650--Sobic002G106700 Sobic001G135650--Sobic007G007400 Sobic001G135650--Sobic009G253600 Sobic001G135650--Sobic010G138600 Sobic001G135650--Sobic004G150901 Sobic001G135650--Sobic003G078000 Sobic001G135650--Sobic008G164000 Sobic001G135650--Sobic006G230000 Sobic008G074200--Sobic009G021050 Sobic008G074200--Sobic007G139850 Sobic008G074200--Sobic004G150901 Sobic008G074200--Sobic008G084000 Sobic008G074200--Sobic010G138600 Sobic008G074200--Sobic009G253600 Sobic008G074200--SobicK044420 Sobic008G074200--Sobic005G152550 Sobic008G074200--Sobic008G181701
Octagon: transcription factors


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