Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G168150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R3Q8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044113 , Zm00025a034228 , Zm00025a005672 , Zm00025a038585 , Zm00025a030557 , Zm00025a010459 , Zm00025a005609
Brachypodium KQK23163 , KQK23162
Barley HORVU4Hr1G071480.8 , HORVU4Hr1G071480.6 , HORVU4Hr1G071480.7 , HORVU4Hr1G071480.4 , HORVU4Hr1G071480.5 , HORVU4Hr1G071480.2 , HORVU4Hr1G071480.3 , HORVU4Hr1G071480.1
Wheat TraesCS4B02G265800 , TraesCS4D02G265700 , TraesCS4A02G044600 , TraesCS4B02G265700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G144100 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, putative, expressed K03252: translation initiation factor 3 subunit C
2 Sobic.003G018000 expressed protein -
3 Sobic.008G124600 expressed protein -
4 Sobic.003G217800 ras-related protein, putative, expressed K07936: GTP-binding nuclear protein Ran
5 Sobic.007G063800 - -
6 Sobic.010G157200 MBTB14 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
7 Sobic.003G258100 dynamin family protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G013550 - K08770: ubiquitin C
9 Sobic.002G299500 expressed protein -
10 Sobic.010G266600 calcium-dependent protein kinase CPK1 adapter protein 2, putative, expressed -
11 Sobic.003G352900 OsFtsH3 FtsH protease, homologue of AtFtsH3/10, expressed K08956: AFG3 family protein
12 Sobic.010G048966 - -
13 Sobic.002G226800 protein phosphotase protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G145701 - K02978: RP-S27e, small subunit ribosomal protein S27e
15 Sobic.008G007600 - -
16 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
17 Sobic.009G220700 - -
18 Sobic.004G256100 transporter-related, putative, expressed -
19 Sobic.008G054700 growth regulator related protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G002700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G168150 Sobic009G168150 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic009G168150--Sobic007G144100 Sobic003G018000 Sobic003G018000 Sobic009G168150--Sobic003G018000 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic009G168150--Sobic008G124600 Sobic003G217800 Sobic003G217800 Sobic009G168150--Sobic003G217800 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic009G168150--Sobic007G063800 Sobic010G157200 Sobic010G157200 Sobic009G168150--Sobic010G157200 Sobic003G258100 Sobic003G258100 Sobic009G168150--Sobic003G258100 Sobic002G013550 Sobic002G013550 Sobic009G168150--Sobic002G013550 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic009G168150--Sobic002G299500 Sobic007G144100--Sobic003G258100 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic007G144100--Sobic003G352900 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic007G144100--Sobic001G076600 Sobic007G144100--Sobic003G217800 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic007G144100--Sobic010G058300 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic007G144100--Sobic001G506400 Sobic007G144100--Sobic002G299500 Sobic004G045632 Sobic004G045632 Sobic007G144100--Sobic004G045632 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic007G144100--Sobic004G038400 Sobic003G018000--Sobic002G013550 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic003G018000--Sobic001G518900 Sobic001G103600 Sobic001G103600 Sobic003G018000--Sobic001G103600 Sobic009G149100 Sobic009G149100 Sobic003G018000--Sobic009G149100 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic003G018000--Sobic008G095500 Sobic004G335400 Sobic004G335400 Sobic003G018000--Sobic004G335400 Sobic004G002700 Sobic004G002700 Sobic003G018000--Sobic004G002700 Sobic005G041500 Sobic005G041500 Sobic003G018000--Sobic005G041500 Sobic006G276600 Sobic006G276600 Sobic003G018000--Sobic006G276600 Sobic004G256100 Sobic004G256100 Sobic008G124600--Sobic004G256100 Sobic007G193600 Sobic007G193600 Sobic008G124600--Sobic007G193600 Sobic001G474100 Sobic001G474100 Sobic008G124600--Sobic001G474100 Sobic008G124600--Sobic003G018000 Sobic008G124600--Sobic001G103600 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic008G124600--Sobic009G047900 Sobic008G124600--Sobic001G518900 Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic008G124600--Sobic008G144701 Sobic001G241700 Sobic001G241700 Sobic008G124600--Sobic001G241700 Sobic003G217800--Sobic007G144100 Sobic003G217800--Sobic003G258100 Sobic003G217800--Sobic003G352900 Sobic003G217800--Sobic002G299500 Sobic003G217800--Sobic003G018000 Sobic001G485700 Sobic001G485700 Sobic003G217800--Sobic001G485700 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic003G217800--Sobic009G220700 Sobic004G062600 Sobic004G062600 Sobic003G217800--Sobic004G062600 Sobic010G263400 Sobic010G263400 Sobic003G217800--Sobic010G263400 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic007G063800--Sobic010G038300 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic007G063800--Sobic005G202901 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic007G063800--Sobic010G266600 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic007G063800--Sobic006G204500 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic007G063800--Sobic004G014200 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic007G063800--Sobic006G070032 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic007G063800--Sobic002G364700 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic007G063800--Sobic008G007600 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic007G063800--Sobic008G029800 Sobic001G218600 Sobic001G218600 Sobic010G157200--Sobic001G218600 Sobic010G157200--Sobic010G263400 Sobic010G157200--Sobic009G168150 Sobic007G060100 Sobic007G060100 Sobic010G157200--Sobic007G060100 Sobic010G157200--Sobic001G506400 Sobic010G157200--Sobic007G144100 Sobic010G157200--Sobic004G038400 Sobic010G157200--Sobic003G258100 Sobic010G157200--Sobic010G058300 Sobic003G258100--Sobic007G144100 Sobic003G258100--Sobic003G217800 Sobic003G258100--Sobic010G263400 Sobic003G258100--Sobic001G076600 Sobic003G258100--Sobic003G352900 Sobic003G258100--Sobic001G506400 Sobic003G258100--Sobic007G060100 Sobic003G258100--Sobic002G299500 Sobic003G258100--Sobic003G018000 Sobic002G013550--Sobic009G149100 Sobic004G254700 Sobic004G254700 Sobic002G013550--Sobic004G254700 Sobic008G071700 Sobic008G071700 Sobic002G013550--Sobic008G071700 Sobic002G019300 Sobic002G019300 Sobic002G013550--Sobic002G019300 Sobic002G013550--Sobic006G276600 Sobic002G013550--Sobic004G335400 Sobic005G006900 Sobic005G006900 Sobic002G013550--Sobic005G006900 Sobic002G298600 Sobic002G298600 Sobic002G013550--Sobic002G298600 Sobic002G013550--Sobic005G041500 Sobic008G171900 Sobic008G171900 Sobic002G299500--Sobic008G171900 Sobic003G376900 Sobic003G376900 Sobic002G299500--Sobic003G376900 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic002G299500--Sobic009G163100 Sobic005G020600 Sobic005G020600 Sobic002G299500--Sobic005G020600 Sobic002G299500--Sobic008G007600 Sobic002G299500--Sobic003G352900 Sobic004G250800 Sobic004G250800 Sobic002G299500--Sobic004G250800 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic002G299500--Sobic009G202000 Sobic001G072000 Sobic001G072000 Sobic002G299500--Sobic001G072000
Octagon: transcription factors


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