Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G145701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMZ3
Pfam PF01667
Panther DB PTHR11594 PTHR11594:SF5
NCBI CDD KOG1779; 40s ribosomal protein S27
KEGG Orthology K02978; RP-S27e, small subunit ribosomal protein S27e
Gene Ontology GO:0006412; translation GO:0005840ribosome GO:0005622intracellular GO:0003735structural constituent of ribosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G61110 : ribosomal protein S27
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g27860.1 : 40S ribosomal protein S27, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034241 , Zm00025a016818
Brachypodium PNT60941 , KQJ99489
Barley HORVU7Hr1G112740.4 , HORVU7Hr1G112740.5 , HORVU4Hr1G074270.1 , HORVU6Hr1G058350.1 , HORVU6Hr1G058350.2 , HORVU4Hr1G014130.2 , HORVU4Hr1G014130.1
Wheat TraesCS4D02G080900 , TraesCS4A02G022600 , TraesCS4B02G280800 , TraesCS7B02G408800 , TraesCS7A02G501300 , TraesCS4B02G082600 , TraesCS4A02G233300 , TraesCS7D02G488700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G030501 - -
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20 Sobic.004G086900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G145701 Sobic004G145701 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic004G145701--Sobic008G030501 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic004G145701--Sobic008G095500 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic004G145701--Sobic004G046800 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic004G145701--Sobic001G518900 Sobic008G071800 Sobic008G071800 Sobic004G145701--Sobic008G071800 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic004G145701--Sobic002G176000 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic004G145701--Sobic001G364300 Sobic002G226800 Sobic002G226800 Sobic004G145701--Sobic002G226800 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic004G145701--Sobic006G170500 Sobic008G030501--Sobic006G170500 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic008G030501--Sobic008G029800 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic008G030501--Sobic007G082300 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic008G030501--Sobic010G196700 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic008G030501--Sobic009G060100 Sobic008G030501--Sobic001G364300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic008G030501--Sobic005G058200 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic008G030501--Sobic004G086900 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic008G030501--Sobic007G110800 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic008G095500--Sobic008G088500 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic008G095500--Sobic008G168500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic008G095500--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic008G095500--Sobic005G058000 Sobic008G095500--Sobic001G364300 Sobic008G095500--Sobic005G058200 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic008G095500--Sobic001G021200 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic008G095500--Sobic005G007200 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic008G095500--Sobic008G177001 Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic004G046800--Sobic008G055200 Sobic001G194800 Sobic001G194800 Sobic004G046800--Sobic001G194800 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic004G046800--Sobic001G106800 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic004G046800--Sobic002G192800 Sobic008G120920 Sobic008G120920 Sobic004G046800--Sobic008G120920 Sobic004G046800--Sobic008G029800 Sobic010G124900 Sobic010G124900 Sobic004G046800--Sobic010G124900 Sobic001G117100 Sobic001G117100 Sobic004G046800--Sobic001G117100 Sobic004G046800--Sobic008G030501 Sobic001G518900--Sobic008G095500 Sobic001G518900--Sobic008G088500 Sobic001G518900--Sobic008G168500 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic001G518900--Sobic009G047900 Sobic001G518900--Sobic002G096600 Sobic001G518900--Sobic005G058000 Sobic001G518900--Sobic010G196700 Sobic001G518900--Sobic001G364300 Sobic001G518900--Sobic005G058200 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic008G071800--Sobic004G168200 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic008G071800--Sobic007G081800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic008G071800--Sobic004G046700 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic008G071800--Sobic005G058300 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic008G071800--Sobic010G123800 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic008G071800--Sobic007G082100 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic008G071800--Sobic002G307400 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic008G071800--Sobic001G211700 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic008G071800--Sobic002G384900 Sobic002G176000--Sobic006G170500 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic002G176000--Sobic006G224400 Sobic002G176000--Sobic007G081800 Sobic002G176000--Sobic004G046700 Sobic002G176000--Sobic010G123800 Sobic002G176000--Sobic005G058300 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic002G176000--Sobic009G182100 Sobic002G176000--Sobic007G110800 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic002G176000--Sobic006G017900 Sobic001G364300--Sobic005G058200 Sobic001G364300--Sobic008G088500 Sobic001G364300--Sobic008G168500 Sobic001G364300--Sobic005G007200 Sobic001G364300--Sobic002G096600 Sobic001G364300--Sobic005G058000 Sobic001G364300--Sobic007G082300 Sobic001G364300--Sobic004G086900 Sobic001G364300--Sobic008G177001 Sobic002G226800--Sobic004G145701 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic002G226800--Sobic006G265800 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic002G226800--Sobic008G124600 Sobic005G050400 Sobic005G050400 Sobic002G226800--Sobic005G050400 Sobic002G226800--Sobic008G071800 Sobic001G112600 Sobic001G112600 Sobic002G226800--Sobic001G112600 Sobic003G018000 Sobic003G018000 Sobic002G226800--Sobic003G018000 Sobic003G102100 Sobic003G102100 Sobic002G226800--Sobic003G102100 Sobic004G007400 Sobic004G007400 Sobic002G226800--Sobic004G007400 Sobic006G170500--Sobic007G110800 Sobic006G170500--Sobic006G224400 Sobic006G170500--Sobic004G086900 Sobic006G170500--Sobic007G082300 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic006G170500--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic006G170500--Sobic007G167950 Sobic006G170500--Sobic001G364300 Sobic006G170500--Sobic008G177001 Sobic006G170500--Sobic005G058200
Octagon: transcription factors


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