Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G226800.2,Sobic.002G226800.1,Sobic.002G226800.3
Synonym Sb02g026710
Functional annotation protein phosphotase protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W5K9 , A0A1W0W5J1 , C5X2C5
Pfam PF00481
Panther DB PTHR13832 PTHR13832:SF320
NCBI CDD KOG0698; Serine/threonine protein phosphatase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity GO:0006470protein dephosphorylation GO:0004722protein serine/threonine phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G47380 : Protein phosphatase 2C family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g28560.1 : protein phosphotase protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013725 , Zm00025a047263
Brachypodium PNT64726 , KQJ90524 , KQJ90525
Barley HORVU5Hr1G068610.14 , HORVU5Hr1G068610.15 , HORVU5Hr1G068610.12 , HORVU5Hr1G068610.13 , HORVU5Hr1G068610.10 , HORVU5Hr1G068610.11 , HORVU5Hr1G068610.8 , HORVU5Hr1G068610.9 , HORVU5Hr1G068610.4 , HORVU5Hr1G068610.5 , HORVU5Hr1G068610.6 , HORVU5Hr1G068610.7 , HORVU5Hr1G068610.1 , HORVU5Hr1G068610.2 , HORVU5Hr1G068610.3
Wheat TraesCS5A02G239500 , TraesCS5A02G239500 , TraesCS5D02G246700 , TraesCS5B02G238200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G226800 Sobic002G226800 Sobic004G145701 Sobic004G145701 Sobic002G226800--Sobic004G145701 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic002G226800--Sobic006G265800 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic002G226800--Sobic008G124600 Sobic005G050400 Sobic005G050400 Sobic002G226800--Sobic005G050400 Sobic008G071800 Sobic008G071800 Sobic002G226800--Sobic008G071800 Sobic001G112600 Sobic001G112600 Sobic002G226800--Sobic001G112600 Sobic003G018000 Sobic003G018000 Sobic002G226800--Sobic003G018000 Sobic003G102100 Sobic003G102100 Sobic002G226800--Sobic003G102100 Sobic004G007400 Sobic004G007400 Sobic002G226800--Sobic004G007400 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic004G145701--Sobic008G030501 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic004G145701--Sobic008G095500 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic004G145701--Sobic004G046800 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic004G145701--Sobic001G518900 Sobic004G145701--Sobic008G071800 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic004G145701--Sobic002G176000 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic004G145701--Sobic001G364300 Sobic004G145701--Sobic002G226800 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic004G145701--Sobic006G170500 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic006G265800--Sobic001G384200 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic006G265800--Sobic006G134500 Sobic001G400000 Sobic001G400000 Sobic006G265800--Sobic001G400000 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic006G265800--Sobic009G163100 Sobic009G201000 Sobic009G201000 Sobic006G265800--Sobic009G201000 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic006G265800--Sobic003G024100 Sobic008G156600 Sobic008G156600 Sobic006G265800--Sobic008G156600 Sobic003G244400 Sobic003G244400 Sobic006G265800--Sobic003G244400 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic006G265800--Sobic008G007600 Sobic004G256100 Sobic004G256100 Sobic008G124600--Sobic004G256100 Sobic007G193600 Sobic007G193600 Sobic008G124600--Sobic007G193600 Sobic001G474100 Sobic001G474100 Sobic008G124600--Sobic001G474100 Sobic008G124600--Sobic003G018000 Sobic001G103600 Sobic001G103600 Sobic008G124600--Sobic001G103600 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic008G124600--Sobic009G047900 Sobic008G124600--Sobic001G518900 Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic008G124600--Sobic008G144701 Sobic001G241700 Sobic001G241700 Sobic008G124600--Sobic001G241700 Sobic005G050400--Sobic001G112600 Sobic001G072000 Sobic001G072000 Sobic005G050400--Sobic001G072000 Sobic005G050400--Sobic008G156600 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic005G050400--Sobic009G242200 Sobic002G170100 Sobic002G170100 Sobic005G050400--Sobic002G170100 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic005G050400--Sobic003G441000 Sobic005G050400--Sobic004G007400 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic005G050400--Sobic005G144000 Sobic005G050400--Sobic009G163100 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic008G071800--Sobic004G168200 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic008G071800--Sobic007G081800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic008G071800--Sobic004G046700 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic008G071800--Sobic005G058300 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic008G071800--Sobic010G123800 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic008G071800--Sobic007G082100 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic008G071800--Sobic002G307400 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic008G071800--Sobic001G211700 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic008G071800--Sobic002G384900 Sobic001G112600--Sobic005G050400 Sobic001G112600--Sobic009G242200 Sobic001G112600--Sobic003G441000 Sobic001G112600--Sobic002G170100 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic001G112600--Sobic001G414650 Sobic001G112600--Sobic003G244400 Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic001G112600--Sobic008G055200 Sobic004G358000 Sobic004G358000 Sobic001G112600--Sobic004G358000 Sobic001G112600--Sobic005G144000 Sobic002G013550 Sobic002G013550 Sobic003G018000--Sobic002G013550 Sobic003G018000--Sobic001G518900 Sobic003G018000--Sobic001G103600 Sobic009G149100 Sobic009G149100 Sobic003G018000--Sobic009G149100 Sobic003G018000--Sobic008G095500 Sobic004G335400 Sobic004G335400 Sobic003G018000--Sobic004G335400 Sobic004G002700 Sobic004G002700 Sobic003G018000--Sobic004G002700 Sobic005G041500 Sobic005G041500 Sobic003G018000--Sobic005G041500 Sobic006G276600 Sobic006G276600 Sobic003G018000--Sobic006G276600 Sobic010G090000 Sobic010G090000 Sobic003G102100--Sobic010G090000 Sobic003G102100--Sobic003G018000 Sobic003G102100--Sobic008G124600 Sobic003G102100--Sobic004G256100 Sobic003G102100--Sobic001G474100 Sobic004G158600 Sobic004G158600 Sobic003G102100--Sobic004G158600 Sobic001G502100 Sobic001G502100 Sobic003G102100--Sobic001G502100 Sobic003G102100--Sobic007G193600 Sobic003G102100--Sobic001G103600 Sobic004G007400--Sobic005G050400 Sobic004G007400--Sobic001G112600 Sobic009G087100 Sobic009G087100 Sobic004G007400--Sobic009G087100 Sobic004G007400--Sobic008G156600 Sobic004G007400--Sobic002G176000 Sobic004G007400--Sobic003G441000 Sobic004G007400--Sobic004G358000 Sobic004G007400--Sobic004G046800 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic004G007400--Sobic002G364700
Octagon: transcription factors


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