Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G055200.1
Synonym Sb08g004680
Functional annotation dirigent, putative, expressed
UniProt C5YSR5
Pfam PF03018
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF75
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G58170 : Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07580.1 : dirigent, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054056 , Zm00025a054055
Brachypodium KQJ92032
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G176700 methyltransferase, putative, expressed -
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20 Sobic.001G089300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase


Gene co-expression network
sample Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic008G055200--Sobic005G176700 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic008G055200--Sobic005G148000 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic008G055200--Sobic005G040100 Sobic001G192300 Sobic001G192300 Sobic008G055200--Sobic001G192300 Sobic004G094400 Sobic004G094400 Sobic008G055200--Sobic004G094400 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic008G055200--Sobic001G143700 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic008G055200--Sobic002G006200 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic008G055200--Sobic002G097300 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic008G055200--Sobic008G138400 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic005G176700--Sobic010G121700 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic005G176700--Sobic008G020800 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic005G176700--Sobic008G024200 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic005G176700--Sobic005G189100 Sobic009G234900 Sobic009G234900 Sobic005G176700--Sobic009G234900 Sobic005G176700--Sobic002G006200 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic005G176700--Sobic001G089300 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic005G176700--Sobic001G167300 Sobic005G176700--Sobic001G143700 Sobic005G148000--Sobic001G143700 Sobic005G148000--Sobic005G040100 Sobic005G148000--Sobic002G006200 Sobic005G148000--Sobic002G097300 Sobic005G148000--Sobic005G189100 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic005G148000--Sobic007G134501 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic005G148000--Sobic007G122600 Sobic005G148000--Sobic008G138400 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic005G148000--Sobic002G194201 Sobic005G040100--Sobic005G148000 Sobic005G040100--Sobic007G134501 Sobic005G040100--Sobic002G194201 Sobic005G040100--Sobic007G122600 Sobic005G040100--Sobic001G143700 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic005G040100--Sobic003G007650 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic005G040100--Sobic005G006100 Sobic005G040100--Sobic002G006200 Sobic003G245300 Sobic003G245300 Sobic005G040100--Sobic003G245300 Sobic001G192300--Sobic007G122600 Sobic001G192300--Sobic005G006100 Sobic001G192300--Sobic002G194201 Sobic001G192300--Sobic007G134501 Sobic001G192300--Sobic005G040100 Sobic001G192300--Sobic003G007650 Sobic001G192300--Sobic003G245300 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic001G192300--Sobic005G006400 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic001G192300--Sobic007G035200 Sobic004G094400--Sobic007G035200 Sobic004G094400--Sobic005G006400 Sobic004G094400--Sobic003G007650 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic004G094400--Sobic006G020400 Sobic004G094400--Sobic007G134501 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic004G094400--Sobic008G086500 Sobic004G094400--Sobic002G194201 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic004G094400--Sobic010G240300 Sobic004G094400--Sobic005G006100 Sobic001G143700--Sobic005G148000 Sobic001G143700--Sobic002G006200 Sobic001G143700--Sobic005G189100 Sobic001G143700--Sobic002G097300 Sobic001G143700--Sobic005G040100 Sobic001G143700--Sobic008G138400 Sobic001G143700--Sobic001G089300 Sobic001G143700--Sobic009G234900 Sobic001G143700--Sobic007G122600 Sobic002G006200--Sobic005G189100 Sobic002G006200--Sobic001G143700 Sobic002G006200--Sobic002G097300 Sobic002G006200--Sobic008G138400 Sobic002G006200--Sobic001G089300 Sobic002G006200--Sobic005G148000 Sobic002G006200--Sobic009G234900 Sobic002G006200--Sobic008G024200 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic002G006200--Sobic009G047100 Sobic002G097300--Sobic008G138400 Sobic002G097300--Sobic002G006200 Sobic002G097300--Sobic001G143700 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic002G097300--Sobic005G140900 Sobic002G097300--Sobic005G189100 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic002G097300--Sobic002G156400 Sobic002G097300--Sobic005G148000 Sobic002G097300--Sobic001G089300 Sobic008G036100 Sobic008G036100 Sobic002G097300--Sobic008G036100 Sobic008G138400--Sobic002G097300 Sobic008G138400--Sobic002G156400 Sobic008G138400--Sobic005G140900 Sobic008G138400--Sobic005G189100 Sobic008G138400--Sobic002G006200 Sobic008G138400--Sobic001G089300 Sobic008G138400--Sobic001G143700 Sobic008G138400--Sobic009G234900 Sobic008G138400--Sobic005G148000
Octagon: transcription factors


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