Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G124600.1
Synonym Sb08g017680
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PDB1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g36680.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025496
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G256100 transporter-related, putative, expressed -
2 Sobic.007G193600 - -
3 Sobic.001G474100 pumilio-family RNA binding repeat domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G018000 expressed protein -
5 Sobic.001G103600 gp176, putative, expressed -
6 Sobic.009G047900 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
7 Sobic.001G518900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G144701 - -
9 Sobic.001G241700 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.003G102100 expressed protein -
11 Sobic.004G002700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G202400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.002G013550 - K08770: ubiquitin C
14 Sobic.008G095500 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
15 Sobic.009G149100 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
16 Sobic.005G041500 OsProCP5 - Putative Lysosomal Pro-x Carboxypeptidase homologue, expressed K01285: lysosomal Pro-X carboxypeptidase
17 Sobic.005G058000 expressed protein -
18 Sobic.002G096600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G335400 expressed protein -
20 Sobic.002G298600 LTPL63 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic004G256100 Sobic004G256100 Sobic008G124600--Sobic004G256100 Sobic007G193600 Sobic007G193600 Sobic008G124600--Sobic007G193600 Sobic001G474100 Sobic001G474100 Sobic008G124600--Sobic001G474100 Sobic003G018000 Sobic003G018000 Sobic008G124600--Sobic003G018000 Sobic001G103600 Sobic001G103600 Sobic008G124600--Sobic001G103600 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic008G124600--Sobic009G047900 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic008G124600--Sobic001G518900 Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic008G124600--Sobic008G144701 Sobic001G241700 Sobic001G241700 Sobic008G124600--Sobic001G241700 Sobic004G256100--Sobic001G474100 Sobic004G256100--Sobic007G193600 Sobic004G256100--Sobic009G047900 Sobic004G256100--Sobic001G103600 Sobic004G256100--Sobic008G144701 Sobic004G256100--Sobic001G518900 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic004G256100--Sobic010G196700 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic004G256100--Sobic008G095500 Sobic004G002700 Sobic004G002700 Sobic004G256100--Sobic004G002700 Sobic007G193600--Sobic001G474100 Sobic007G193600--Sobic009G047900 Sobic007G193600--Sobic004G256100 Sobic007G193600--Sobic001G518900 Sobic007G193600--Sobic008G144701 Sobic007G193600--Sobic010G196700 Sobic007G193600--Sobic001G103600 Sobic010G202400 Sobic010G202400 Sobic007G193600--Sobic010G202400 Sobic008G155000 Sobic008G155000 Sobic007G193600--Sobic008G155000 Sobic001G474100--Sobic009G047900 Sobic001G474100--Sobic007G193600 Sobic001G474100--Sobic004G256100 Sobic001G474100--Sobic008G144701 Sobic001G474100--Sobic010G196700 Sobic001G474100--Sobic001G518900 Sobic001G474100--Sobic001G103600 Sobic001G474100--Sobic008G095500 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic001G474100--Sobic005G058200 Sobic002G013550 Sobic002G013550 Sobic003G018000--Sobic002G013550 Sobic003G018000--Sobic001G518900 Sobic003G018000--Sobic001G103600 Sobic009G149100 Sobic009G149100 Sobic003G018000--Sobic009G149100 Sobic003G018000--Sobic008G095500 Sobic004G335400 Sobic004G335400 Sobic003G018000--Sobic004G335400 Sobic003G018000--Sobic004G002700 Sobic005G041500 Sobic005G041500 Sobic003G018000--Sobic005G041500 Sobic006G276600 Sobic006G276600 Sobic003G018000--Sobic006G276600 Sobic001G103600--Sobic009G149100 Sobic001G103600--Sobic004G335400 Sobic001G103600--Sobic005G041500 Sobic002G298600 Sobic002G298600 Sobic001G103600--Sobic002G298600 Sobic002G019300 Sobic002G019300 Sobic001G103600--Sobic002G019300 Sobic001G103600--Sobic006G276600 Sobic001G103600--Sobic004G002700 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic001G103600--Sobic001G021200 Sobic001G103600--Sobic008G095500 Sobic009G047900--Sobic010G196700 Sobic009G047900--Sobic005G058200 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic009G047900--Sobic005G007200 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic009G047900--Sobic001G364300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic009G047900--Sobic008G088500 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic009G047900--Sobic007G082300 Sobic009G047900--Sobic001G518900 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic009G047900--Sobic004G086900 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic009G047900--Sobic008G168500 Sobic001G518900--Sobic008G095500 Sobic001G518900--Sobic008G088500 Sobic001G518900--Sobic008G168500 Sobic001G518900--Sobic009G047900 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic001G518900--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic001G518900--Sobic005G058000 Sobic001G518900--Sobic010G196700 Sobic001G518900--Sobic001G364300 Sobic001G518900--Sobic005G058200 Sobic008G144701--Sobic009G047900 Sobic008G144701--Sobic010G196700 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic008G144701--Sobic002G307400 Sobic008G144701--Sobic004G086900 Sobic008G144701--Sobic007G082300 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic008G144701--Sobic007G110800 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic008G144701--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic008G144701--Sobic007G167950 Sobic001G253750 Sobic001G253750 Sobic008G144701--Sobic001G253750 Sobic001G241700--Sobic005G041500 Sobic001G241700--Sobic010G202400 Sobic001G241700--Sobic006G276600 Sobic001G241700--Sobic004G335400 Sobic001G241700--Sobic009G149100 Sobic001G241700--Sobic002G298600 Sobic001G241700--Sobic002G019300 Sobic001G241700--Sobic005G058000 Sobic001G241700--Sobic002G096600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.