Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G046800.1
Synonym Sb04g004000
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XVC6
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g08650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G055200 dirigent, putative, expressed -
2 Sobic.001G194800 TATA-binding protein, putative, expressed K03120: TBP, transcription initiation factor TFIID TATA-box-binding protein
3 Sobic.001G106800 DUF221 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G192800 - -
5 Sobic.008G120920 - -
6 Sobic.008G029800 expressed protein -
7 Sobic.010G124900 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family, putative, expressed K10251: HSD17B12, KAR, 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase
8 Sobic.001G117100 - -
9 Sobic.008G030501 - -
10 Sobic.003G244400 OsFBK1 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed -
11 Sobic.006G017700 expressed protein -
12 Sobic.005G156300 - -
13 Sobic.002G111100 expressed protein -
14 Sobic.005G140900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G017900 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.002G156400 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA, BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@MDR-like ABC transporter, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
17 Sobic.002G097300 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G138400 expressed protein -
19 Sobic.001G211700 MBTB33 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.002G384900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic004G046800--Sobic008G055200 Sobic001G194800 Sobic001G194800 Sobic004G046800--Sobic001G194800 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic004G046800--Sobic001G106800 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic004G046800--Sobic002G192800 Sobic008G120920 Sobic008G120920 Sobic004G046800--Sobic008G120920 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic004G046800--Sobic008G029800 Sobic010G124900 Sobic010G124900 Sobic004G046800--Sobic010G124900 Sobic001G117100 Sobic001G117100 Sobic004G046800--Sobic001G117100 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic004G046800--Sobic008G030501 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic008G055200--Sobic005G176700 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic008G055200--Sobic005G148000 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic008G055200--Sobic005G040100 Sobic001G192300 Sobic001G192300 Sobic008G055200--Sobic001G192300 Sobic004G094400 Sobic004G094400 Sobic008G055200--Sobic004G094400 Sobic001G143700 Sobic001G143700 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Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic008G030501--Sobic005G058200 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic008G030501--Sobic004G086900 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic008G030501--Sobic007G110800
Octagon: transcription factors


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