Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G111100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QAI2
Pfam -
Panther DB PTHR33673 PTHR33673:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G03630 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g20270.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045689
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G106800 DUF221 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G030300 - -
3 Sobic.002G372000 - -
4 Sobic.001G254000 sucrose transporters(PubMedID : 23805151)@Sucrose transporter genes(PubMedID : 24456189)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@sucrose transporter, putativ, expressed K15378: solute carrier family 45, member 1/2/4
5 Sobic.002G384500 expressed protein -
6 Sobic.008G056700 - -
7 Sobic.010G124900 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family, putative, expressed K10251: HSD17B12, KAR, 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase
8 Sobic.003G243300 expressed protein -
9 Sobic.002G295800 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 5 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G438500 THION25 - Plant thionin family protein precursor, expressed -
11 Sobic.007G222400 - -
12 Sobic.001G228000 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G106800 expressed protein -
14 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G061700 - -
16 Sobic.002G351500 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
17 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
18 Sobic.005G010000 expressed protein -
19 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -
20 Sobic.003G178000 pectinesterase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G111100 Sobic002G111100 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic002G111100--Sobic001G106800 Sobic002G030300 Sobic002G030300 Sobic002G111100--Sobic002G030300 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic002G111100--Sobic002G372000 Sobic001G254000 Sobic001G254000 Sobic002G111100--Sobic001G254000 Sobic002G384500 Sobic002G384500 Sobic002G111100--Sobic002G384500 Sobic008G056700 Sobic008G056700 Sobic002G111100--Sobic008G056700 Sobic010G124900 Sobic010G124900 Sobic002G111100--Sobic010G124900 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic002G111100--Sobic003G243300 Sobic002G295800 Sobic002G295800 Sobic002G111100--Sobic002G295800 Sobic001G106800--Sobic002G030300 Sobic001G106800--Sobic002G111100 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic001G106800--Sobic002G011300 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic001G106800--Sobic009G060000 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic001G106800--Sobic003G290500 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic001G106800--Sobic001G409000 Sobic007G001800 Sobic007G001800 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Octagon: transcription factors


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