Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G254000.1
Synonym SbSUT3;SUT3;SbSUT3, Sb01g022430, SUC1, ATSUC1
Functional annotation sucrose transporters (PubMedID : 23805151)
Sucrose transporter genes (PubMedID : 24456189)
Sugar transporter (PubMedID : 27330561)
sucrose transporter, putativ, expressed
UniProt C5WM91
Pfam PF13347
Panther DB PTHR19432 PTHR19432:SF39
NCBI CDD KOG0637; Sucrose transporter and related proteins
KEGG Orthology K15378; solute carrier family 45, member 1/2/4
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71880 : sucrose-proton symporter 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g26470.1 : sucrose transporter, putativ, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007009 , Zm00025a053331 , Zm00025a000862
Brachypodium KQK23402 , PNT67335
Barley HORVU4Hr1G075200.4 , HORVU4Hr1G075200.5 , HORVU4Hr1G075200.1 , HORVU4Hr1G075200.2 , HORVU4Hr1G075200.3
Wheat TraesCS4B02G287800 , TraesCS4A02G016400 , TraesCS4D02G286500 , TraesCS1A02G134100 , TraesCS1D02G135900
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G016700 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
2 Sobic.007G222400 - -
3 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G089532 - -
5 Sobic.009G096700 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.20 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
6 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.002G106800 expressed protein -
9 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
10 Sobic.004G251900 tetraspanin family protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G093600 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
12 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
14 Sobic.002G030300 - -
15 Sobic.004G025500 - -
16 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -
17 Sobic.006G026200 gamma-thionin family domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G127200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed -
19 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
20 Sobic.008G027800 pollen allergen, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G254000 Sobic001G254000 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic001G254000--Sobic009G016700 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic001G254000--Sobic007G222400 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic001G254000--Sobic002G283000 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic001G254000--Sobic009G089532 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic001G254000--Sobic009G096700 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic001G254000--Sobic002G002600 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic001G254000--Sobic001G539700 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic001G254000--Sobic002G106800 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic001G254000--Sobic008G028100 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic009G016700--Sobic010G093600 Sobic009G016700--Sobic008G028100 Sobic009G016700--Sobic001G539700 Sobic009G016700--Sobic002G002600 Sobic009G016700--Sobic007G222400 Sobic009G016700--Sobic009G096700 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic009G016700--Sobic008G028300 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic009G016700--Sobic008G027800 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic009G016700--Sobic001G002200 Sobic007G222400--Sobic009G016700 Sobic007G222400--Sobic001G539700 Sobic007G222400--Sobic008G028100 Sobic007G222400--Sobic010G093600 Sobic007G222400--Sobic008G028300 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic007G222400--Sobic004G166100 Sobic007G222400--Sobic002G002600 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic007G222400--Sobic004G024000 Sobic007G222400--Sobic009G096700 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic002G283000--Sobic004G137200 Sobic002G283000--Sobic009G089532 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic002G283000--Sobic004G025500 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic002G283000--Sobic009G098900 Sobic002G283000--Sobic001G539700 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic002G283000--Sobic004G251900 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic002G283000--Sobic003G173800 Sobic002G283000--Sobic008G028100 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G283000--Sobic005G010000 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic009G096700--Sobic010G093600 Sobic009G096700--Sobic008G028100 Sobic009G096700--Sobic009G089532 Sobic009G096700--Sobic001G539700 Sobic009G096700--Sobic008G027800 Sobic009G096700--Sobic009G016700 Sobic009G096700--Sobic002G002600 Sobic009G096700--Sobic001G002200 Sobic009G096700--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic002G002600--Sobic003G127200 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic001G539700--Sobic007G222400 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic008G028100--Sobic001G539700 Sobic008G028100--Sobic009G089532 Sobic008G028100--Sobic002G002600 Sobic008G028100--Sobic009G016700 Sobic008G028100--Sobic010G093600 Sobic008G028100--Sobic009G096700 Sobic008G028100--Sobic008G028300 Sobic008G028100--Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic009G098900
Octagon: transcription factors


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