Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G030300.1
Synonym Sb02g002700
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q8X8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044988
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G060780.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G030300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G228000 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G197900 - -
3 Sobic.003G164700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G057600 - -
5 Sobic.008G119501 - -
6 Sobic.006G237700 expressed protein -
7 Sobic.003G335200 monocopper oxidase, putative, expressed -
8 Sobic.004G134000 - -
9 Sobic.003G073540 - -
10 Sobic.009G075400 RALFL17 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
11 Sobic.007G175800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
12 Sobic.003G317600 NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative, expressed K17871: NADH:ubiquinone reductase (non-electrogenic)
13 Sobic.002G066300 expressed protein -
14 Sobic.006G282000 cytochrome c, putative, expressed K08738: cytochrome c
15 Sobic.001G024800 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G222500 - -
17 Sobic.001G348600 patatin, putative, expressed -
18 Sobic.004G294200 ZOS2-13 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.003G400000 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed -
20 Sobic.001G097000 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G030300 Sobic002G030300 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic002G030300--Sobic001G228000 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic002G030300--Sobic002G197900 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic002G030300--Sobic003G164700 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic002G030300--Sobic007G057600 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic002G030300--Sobic008G119501 Sobic006G237700 Sobic006G237700 Sobic002G030300--Sobic006G237700 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic002G030300--Sobic003G335200 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic002G030300--Sobic004G134000 Sobic003G073540 Sobic003G073540 Sobic002G030300--Sobic003G073540 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic001G228000--Sobic001G002200 Sobic001G348600 Sobic001G348600 Sobic001G228000--Sobic001G348600 Sobic001G228000--Sobic003G164700 Sobic001G228000--Sobic002G197900 Sobic002G140500 Sobic002G140500 Sobic001G228000--Sobic002G140500 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic001G228000--Sobic008G027800 Sobic001G228000--Sobic007G057600 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic001G228000--Sobic008G028300 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic001G228000--Sobic004G024000 Sobic002G197900--Sobic003G164700 Sobic002G197900--Sobic001G228000 Sobic004G294200 Sobic004G294200 Sobic002G197900--Sobic004G294200 Sobic002G197900--Sobic007G057600 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic002G197900--Sobic007G175800 Sobic002G197900--Sobic001G002200 Sobic002G197900--Sobic006G237700 Sobic003G178000 Sobic003G178000 Sobic002G197900--Sobic003G178000 Sobic002G197900--Sobic004G024000 Sobic003G164700--Sobic001G228000 Sobic003G164700--Sobic002G197900 Sobic003G164700--Sobic004G294200 Sobic001G240900 Sobic001G240900 Sobic003G164700--Sobic001G240900 Sobic003G164700--Sobic006G237700 Sobic003G164700--Sobic008G119501 Sobic003G164700--Sobic001G002200 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic003G164700--Sobic003G317600 Sobic010G229801 Sobic010G229801 Sobic003G164700--Sobic010G229801 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic007G057600--Sobic001G528700 Sobic007G057600--Sobic001G228000 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic007G057600--Sobic007G222500 Sobic007G057600--Sobic004G024000 Sobic007G057600--Sobic002G197900 Sobic007G057600--Sobic007G175800 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic007G057600--Sobic004G166100 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic007G057600--Sobic001G252900 Sobic007G057600--Sobic001G002200 Sobic006G282000 Sobic006G282000 Sobic008G119501--Sobic006G282000 Sobic002G066300 Sobic002G066300 Sobic008G119501--Sobic002G066300 Sobic001G097000 Sobic001G097000 Sobic008G119501--Sobic001G097000 Sobic001G024800 Sobic001G024800 Sobic008G119501--Sobic001G024800 Sobic004G242600 Sobic004G242600 Sobic008G119501--Sobic004G242600 Sobic002G303500 Sobic002G303500 Sobic008G119501--Sobic002G303500 Sobic003G400000 Sobic003G400000 Sobic008G119501--Sobic003G400000 Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic008G119501--Sobic005G023700 Sobic004G029032 Sobic004G029032 Sobic008G119501--Sobic004G029032 Sobic006G237700--Sobic003G164700 Sobic006G237700--Sobic001G228000 Sobic006G237700--Sobic002G197900 Sobic006G237700--Sobic001G240900 Sobic006G237700--Sobic008G119501 Sobic006G237700--Sobic001G002200 Sobic002G150400 Sobic002G150400 Sobic006G237700--Sobic002G150400 Sobic006G237700--Sobic001G348600 Sobic006G237700--Sobic010G229801 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic003G335200--Sobic009G075400 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic003G335200--Sobic004G002800 Sobic003G335200--Sobic005G023700 Sobic005G025600 Sobic005G025600 Sobic003G335200--Sobic005G025600 Sobic006G263500 Sobic006G263500 Sobic003G335200--Sobic006G263500 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic003G335200--Sobic006G159000 Sobic003G335200--Sobic002G066300 Sobic010G006900 Sobic010G006900 Sobic003G335200--Sobic010G006900 Sobic003G335200--Sobic001G252900 Sobic004G134000--Sobic009G075400 Sobic004G134000--Sobic003G335200 Sobic004G134000--Sobic004G002800 Sobic004G134000--Sobic007G175800 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic004G134000--Sobic008G043300 Sobic009G082900 Sobic009G082900 Sobic004G134000--Sobic009G082900 Sobic004G134000--Sobic001G252900 Sobic004G134000--Sobic005G025600 Sobic004G134000--Sobic007G057600 Sobic003G073540--Sobic001G252900 Sobic003G073540--Sobic004G002800 Sobic003G073540--Sobic009G082900 Sobic003G073540--Sobic005G025600 Sobic003G073540--Sobic007G222500 Sobic003G073540--Sobic006G263500 Sobic003G073540--Sobic003G335200 Sobic003G073540--Sobic010G006900 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic003G073540--Sobic010G144700
Octagon: transcription factors


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