Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G106800.1,Sobic.001G106800.2,Sobic.001G106800.3
Synonym RXW8, Sb01g009540
Functional annotation DUF221 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S5H3 , A0A1B6QIB4
Pfam PF02714 PF13967 PF02714
Panther DB PTHR13018 PTHR13018:SF41
NCBI CDD KOG1134; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G58520 : lipases;hydrolases, acting on ester bonds
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g51620.1 : DUF221 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016896
Brachypodium KQK13438
Barley HORVU4Hr1G009550.3 , HORVU4Hr1G009550.2 , HORVU4Hr1G009550.1
Wheat TraesCS4D02G057200 , TraesCS4B02G056900 , TraesCS4A02G257600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.008G043300 - -
19 Sobic.008G053750 - -
20 Sobic.008G134600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic002G030300 Sobic002G030300 Sobic001G106800--Sobic002G030300 Sobic002G111100 Sobic002G111100 Sobic001G106800--Sobic002G111100 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic001G106800--Sobic002G011300 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic001G106800--Sobic009G060000 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic001G106800--Sobic003G290500 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic001G106800--Sobic001G409000 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic001G106800--Sobic007G001800 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic001G106800--Sobic004G217200 Sobic004G049300 Sobic004G049300 Sobic001G106800--Sobic004G049300 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic002G030300--Sobic001G228000 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic002G030300--Sobic002G197900 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic002G030300--Sobic003G164700 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic002G030300--Sobic007G057600 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic002G030300--Sobic008G119501 Sobic006G237700 Sobic006G237700 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Octagon: transcription factors


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