Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G457500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QPN0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038737 , Zm00025a028145
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G506400 expressed protein -
2 Sobic.008G166100 glycosyl transferase family 17 protein, putative, expressed K00737: beta-1,4-mannosyl-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
3 Sobic.008G007600 - -
4 Sobic.004G045632 - -
5 Sobic.003G407700 dnaJ domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G168900 elongation factor Tu family protein, putative, expressed K14536: ribosome assembly protein 1
7 Sobic.003G175350 - -
8 Sobic.003G024100 MRH1, putative, expressed -
9 Sobic.003G005700 AGC_PVPK_like_kin82y.4 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
10 Sobic.004G140400 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
11 Sobic.010G064200 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
12 Sobic.003G048400 - -
13 Sobic.003G352900 OsFtsH3 FtsH protease, homologue of AtFtsH3/10, expressed K08956: AFG3 family protein
14 Sobic.005G041450 - -
15 Sobic.010G058300 expressed protein -
16 Sobic.007G039200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
17 Sobic.009G061500 - -
18 Sobic.007G144100 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, putative, expressed K03252: translation initiation factor 3 subunit C
19 Sobic.010G073900 expressed protein -
20 Sobic.001G340800 exocyst complex component 6, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic001G457500--Sobic001G506400 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic001G457500--Sobic008G166100 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic001G457500--Sobic008G007600 Sobic004G045632 Sobic004G045632 Sobic001G457500--Sobic004G045632 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic001G457500--Sobic003G407700 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic001G457500--Sobic004G168900 Sobic003G175350 Sobic003G175350 Sobic001G457500--Sobic003G175350 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic001G457500--Sobic003G024100 Sobic003G005700 Sobic003G005700 Sobic001G457500--Sobic003G005700 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic001G506400--Sobic007G144100 Sobic003G258100 Sobic003G258100 Sobic001G506400--Sobic003G258100 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic001G506400--Sobic001G034200 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic001G506400--Sobic004G038400 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic001G506400--Sobic001G076600 Sobic007G048900 Sobic007G048900 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Sobic007G109301 Sobic003G005700--Sobic007G109301 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic003G005700--Sobic002G060101 Sobic007G212500 Sobic007G212500 Sobic003G005700--Sobic007G212500 Sobic003G005700--Sobic002G364700
Octagon: transcription factors


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