Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G359100.1
Synonym Sb02g037980
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QF94
Pfam PF06075
Panther DB PTHR31928 PTHR31928:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G08760 : Plant protein of unknown function (DUF936)
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g39930.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015062
Brachypodium PNT74848 , KQK15462
Barley HORVU2Hr1G035200.2 , HORVU2Hr1G035200.1
Wheat TraesCS2D02G193600 , TraesCS2A02G194300 , TraesCS2B02G212600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G191900 CHX28, putative, expressed -
2 Sobic.001G380000 THION28 - Plant thionin family protein precursor, expressed -
3 Sobic.010G140100 - -
4 Sobic.003G233800 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
5 Sobic.008G019200 - -
6 Sobic.007G220150 - -
7 Sobic.004G080800 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
8 Sobic.004G031900 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
9 Sobic.003G054800 expressed protein -
10 Sobic.009G044100 pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G513400 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
12 Sobic.007G139300 exostosin family domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G176200 OsSub43 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
14 Sobic.001G479700 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G187800 expressed protein -
16 Sobic.006G234400 DUF617 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G222700 - -
18 Sobic.006G018701 - -
19 Sobic.002G330200 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
20 Sobic.001G366700 villin protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic002G359100--Sobic008G191900 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic002G359100--Sobic001G380000 Sobic010G140100 Sobic010G140100 Sobic002G359100--Sobic010G140100 Sobic003G233800 Sobic003G233800 Sobic002G359100--Sobic003G233800 Sobic008G019200 Sobic008G019200 Sobic002G359100--Sobic008G019200 Sobic007G220150 Sobic007G220150 Sobic002G359100--Sobic007G220150 Sobic004G080800 Sobic004G080800 Sobic002G359100--Sobic004G080800 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic002G359100--Sobic004G031900 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic002G359100--Sobic003G054800 Sobic008G191900--Sobic002G359100 Sobic003G061600 Sobic003G061600 Sobic008G191900--Sobic003G061600 Sobic008G191900--Sobic004G031900 Sobic008G191900--Sobic001G380000 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic008G191900--Sobic010G187800 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic008G191900--Sobic009G176200 Sobic008G191900--Sobic003G233800 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic008G191900--Sobic001G036200 Sobic008G191900--Sobic010G140100 Sobic001G380000--Sobic003G233800 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic001G380000--Sobic001G513400 Sobic001G380000--Sobic010G187800 Sobic001G380000--Sobic003G054800 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic001G380000--Sobic004G289900 Sobic001G380000--Sobic001G036200 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic001G380000--Sobic002G405300 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic001G380000--Sobic006G176200 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic001G380000--Sobic007G080100 Sobic001G278100 Sobic001G278100 Sobic010G140100--Sobic001G278100 Sobic001G479700 Sobic001G479700 Sobic010G140100--Sobic001G479700 Sobic006G127800 Sobic006G127800 Sobic010G140100--Sobic006G127800 Sobic003G114900 Sobic003G114900 Sobic010G140100--Sobic003G114900 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic010G140100--Sobic006G234400 Sobic010G140100--Sobic004G080800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic010G140100--Sobic006G173400 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic010G140100--Sobic006G270800 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic010G140100--Sobic003G114800 Sobic003G233800--Sobic001G380000 Sobic003G233800--Sobic006G176200 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic003G233800--Sobic007G222700 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic003G233800--Sobic007G061800 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic003G233800--Sobic009G227500 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic003G233800--Sobic004G091000 Sobic003G233800--Sobic006G173400 Sobic003G233800--Sobic006G234400 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic003G233800--Sobic010G177600 Sobic003G335700 Sobic003G335700 Sobic008G019200--Sobic003G335700 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic008G019200--Sobic003G317600 Sobic003G175000 Sobic003G175000 Sobic008G019200--Sobic003G175000 Sobic003G178000 Sobic003G178000 Sobic008G019200--Sobic003G178000 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic008G019200--Sobic009G260900 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic008G019200--Sobic009G158400 Sobic010G229801 Sobic010G229801 Sobic008G019200--Sobic010G229801 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic008G019200--Sobic003G127200 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic008G019200--Sobic003G445600 Sobic007G220150--Sobic010G140100 Sobic007G220150--Sobic008G019200 Sobic007G220150--Sobic001G479700 Sobic007G220150--Sobic001G278100 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic007G220150--Sobic003G243300 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic007G220150--Sobic001G366700 Sobic001G045400 Sobic001G045400 Sobic007G220150--Sobic001G045400 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic007G220150--Sobic001G529800 Sobic007G220150--Sobic003G114900 Sobic004G080800--Sobic010G140100 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic004G080800--Sobic010G271600 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic004G080800--Sobic009G098400 Sobic004G080800--Sobic006G173400 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic004G080800--Sobic004G187400 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic004G080800--Sobic010G190500 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic004G080800--Sobic010G257800 Sobic002G061300 Sobic002G061300 Sobic004G080800--Sobic002G061300 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic004G080800--Sobic005G214700 Sobic004G031900--Sobic009G176200 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic004G031900--Sobic009G249400 Sobic004G031900--Sobic010G187800 Sobic004G031900--Sobic008G191900 Sobic004G031900--Sobic002G359100 Sobic004G031900--Sobic001G380000 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic004G031900--Sobic003G208900 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic004G031900--Sobic005G039000 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic004G031900--Sobic010G074000 Sobic003G054800--Sobic001G380000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic003G054800--Sobic006G018701 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic003G054800--Sobic007G161100 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic003G054800--Sobic002G406801 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic003G054800--Sobic006G066050 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic003G054800--Sobic009G021000 Sobic003G054800--Sobic003G233800 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic003G054800--Sobic004G059200 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic003G054800--Sobic009G158300
Octagon: transcription factors


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