Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G380000.1
Synonym Sb01g036060
Functional annotation THION28 - Plant thionin family protein precursor, expressed
UniProt C5X0S5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g21880.1 : THION28 - Plant thionin family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G233800 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
2 Sobic.001G513400 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
3 Sobic.010G187800 expressed protein -
4 Sobic.003G054800 expressed protein -
5 Sobic.004G289900 expressed protein K15193: SPTY2D1, protein SPT2
6 Sobic.001G036200 - -
7 Sobic.002G405300 START domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G176200 OsSub43 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
9 Sobic.007G080100 DNA binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G139300 exostosin family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.007G222700 - -
12 Sobic.010G257800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
13 Sobic.004G185000 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.003G405800 CBS domain containing membrane protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G173400 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
16 Sobic.008G011901 - K00889: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
17 Sobic.007G096900 Rad21 / Rec8 like protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G128700 expressed protein -
19 Sobic.010G254100 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -
20 Sobic.007G061800 transporter family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic003G233800 Sobic003G233800 Sobic001G380000--Sobic003G233800 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic001G380000--Sobic001G513400 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic001G380000--Sobic010G187800 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic001G380000--Sobic003G054800 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic001G380000--Sobic004G289900 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic001G380000--Sobic001G036200 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic001G380000--Sobic002G405300 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic001G380000--Sobic006G176200 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic001G380000--Sobic007G080100 Sobic003G233800--Sobic001G380000 Sobic003G233800--Sobic006G176200 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic003G233800--Sobic007G222700 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic003G233800--Sobic007G061800 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic003G233800--Sobic009G227500 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic003G233800--Sobic004G091000 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic003G233800--Sobic006G173400 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic003G233800--Sobic006G234400 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic003G233800--Sobic010G177600 Sobic001G513400--Sobic004G289900 Sobic001G513400--Sobic002G405300 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic001G513400--Sobic006G044800 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic001G513400--Sobic005G185750 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic001G513400--Sobic008G168932 Sobic001G513400--Sobic001G036200 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic001G513400--Sobic010G257800 Sobic001G513400--Sobic001G380000 Sobic004G334900 Sobic004G334900 Sobic001G513400--Sobic004G334900 Sobic004G185000 Sobic004G185000 Sobic010G187800--Sobic004G185000 Sobic010G187800--Sobic001G513400 Sobic010G187800--Sobic001G380000 Sobic010G187800--Sobic002G405300 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic010G187800--Sobic009G176200 Sobic004G123100 Sobic004G123100 Sobic010G187800--Sobic004G123100 Sobic010G187800--Sobic003G233800 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic010G187800--Sobic009G249400 Sobic010G187800--Sobic001G036200 Sobic003G054800--Sobic001G380000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic003G054800--Sobic006G018701 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic003G054800--Sobic007G161100 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic003G054800--Sobic002G406801 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic003G054800--Sobic006G066050 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic003G054800--Sobic009G021000 Sobic003G054800--Sobic003G233800 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic003G054800--Sobic004G059200 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic003G054800--Sobic009G158300 Sobic004G289900--Sobic008G168932 Sobic004G289900--Sobic001G513400 Sobic004G289900--Sobic005G185750 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic004G289900--Sobic005G068500 Sobic004G289900--Sobic001G036200 Sobic008G099000 Sobic008G099000 Sobic004G289900--Sobic008G099000 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic004G289900--Sobic004G024800 Sobic004G289900--Sobic006G044800 Sobic004G289900--Sobic010G257800 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic001G036200--Sobic010G254100 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic001G036200--Sobic009G091000 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic001G036200--Sobic009G252000 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic001G036200--Sobic007G221932 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic001G036200--Sobic010G034300 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic001G036200--Sobic008G097800 Sobic001G466100 Sobic001G466100 Sobic001G036200--Sobic001G466100 Sobic001G351600 Sobic001G351600 Sobic001G036200--Sobic001G351600 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic001G036200--Sobic004G336401 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic002G405300--Sobic004G331500 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic002G405300--Sobic004G287200 Sobic002G405300--Sobic001G036200 Sobic002G405300--Sobic010G254100 Sobic002G405300--Sobic004G336401 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic002G405300--Sobic009G166000 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic002G405300--Sobic009G165900 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic002G405300--Sobic008G075800 Sobic002G405300--Sobic010G034300 Sobic003G405800 Sobic003G405800 Sobic006G176200--Sobic003G405800 Sobic009G087200 Sobic009G087200 Sobic006G176200--Sobic009G087200 Sobic001G511100 Sobic001G511100 Sobic006G176200--Sobic001G511100 Sobic004G318300 Sobic004G318300 Sobic006G176200--Sobic004G318300 Sobic003G027300 Sobic003G027300 Sobic006G176200--Sobic003G027300 Sobic010G230200 Sobic010G230200 Sobic006G176200--Sobic010G230200 Sobic008G043400 Sobic008G043400 Sobic006G176200--Sobic008G043400 Sobic005G031700 Sobic005G031700 Sobic006G176200--Sobic005G031700 Sobic001G473700 Sobic001G473700 Sobic006G176200--Sobic001G473700 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic007G080100--Sobic008G011901 Sobic007G080100--Sobic004G024800 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic007G080100--Sobic005G035200 Sobic007G080100--Sobic007G221932 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic007G080100--Sobic001G539880 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic007G080100--Sobic002G145400 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic007G080100--Sobic003G195400 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic007G080100--Sobic005G035250 Sobic007G080100--Sobic008G097800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.