Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G140100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YJ51
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G278100 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
2 Sobic.001G479700 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G127800 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G114900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G234400 DUF617 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G080800 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
7 Sobic.006G173400 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
8 Sobic.006G270800 EF hand family protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G114800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G147700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G222700 - -
12 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
13 Sobic.008G102850 - -
14 Sobic.004G091000 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
15 Sobic.007G134260 - -
16 Sobic.003G232100 - -
17 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
18 Sobic.003G197500 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G427500 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
20 Sobic.005G065300 methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G140100 Sobic010G140100 Sobic001G278100 Sobic001G278100 Sobic010G140100--Sobic001G278100 Sobic001G479700 Sobic001G479700 Sobic010G140100--Sobic001G479700 Sobic006G127800 Sobic006G127800 Sobic010G140100--Sobic006G127800 Sobic003G114900 Sobic003G114900 Sobic010G140100--Sobic003G114900 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic010G140100--Sobic006G234400 Sobic004G080800 Sobic004G080800 Sobic010G140100--Sobic004G080800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic010G140100--Sobic006G173400 Sobic006G270800 Sobic006G270800 Sobic010G140100--Sobic006G270800 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic010G140100--Sobic003G114800 Sobic006G136700 Sobic006G136700 Sobic001G278100--Sobic006G136700 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic001G278100--Sobic009G116100 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic001G278100--Sobic001G024300 Sobic001G278100--Sobic001G479700 Sobic001G278100--Sobic003G114900 Sobic001G278100--Sobic006G127800 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic001G278100--Sobic002G157900 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic001G278100--Sobic001G332200 Sobic003G009600 Sobic003G009600 Sobic001G278100--Sobic003G009600 Sobic001G479700--Sobic001G278100 Sobic001G479700--Sobic003G114900 Sobic005G031700 Sobic005G031700 Sobic001G479700--Sobic005G031700 Sobic001G479700--Sobic006G127800 Sobic001G479700--Sobic009G116100 Sobic001G479700--Sobic003G009600 Sobic001G511100 Sobic001G511100 Sobic001G479700--Sobic001G511100 Sobic001G479700--Sobic001G024300 Sobic010G230200 Sobic010G230200 Sobic001G479700--Sobic010G230200 Sobic002G427500 Sobic002G427500 Sobic006G127800--Sobic002G427500 Sobic006G127800--Sobic006G270800 Sobic006G127800--Sobic003G114900 Sobic006G127800--Sobic003G009600 Sobic009G089000 Sobic009G089000 Sobic006G127800--Sobic009G089000 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic006G127800--Sobic003G147700 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic006G127800--Sobic005G122100 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic006G127800--Sobic003G232100 Sobic006G127800--Sobic001G024300 Sobic003G114900--Sobic006G127800 Sobic003G114900--Sobic002G427500 Sobic003G197500 Sobic003G197500 Sobic003G114900--Sobic003G197500 Sobic003G114900--Sobic006G270800 Sobic003G114900--Sobic003G009600 Sobic008G043400 Sobic008G043400 Sobic003G114900--Sobic008G043400 Sobic003G114900--Sobic009G089000 Sobic003G114900--Sobic001G511100 Sobic003G114900--Sobic009G116100 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic006G234400--Sobic007G061800 Sobic001G400400 Sobic001G400400 Sobic006G234400--Sobic001G400400 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic006G234400--Sobic001G222800 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic006G234400--Sobic010G034200 Sobic006G234400--Sobic003G197500 Sobic009G253700 Sobic009G253700 Sobic006G234400--Sobic009G253700 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic006G234400--Sobic009G227500 Sobic006G234400--Sobic006G173400 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic006G234400--Sobic010G177600 Sobic004G080800--Sobic010G140100 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic004G080800--Sobic010G271600 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic004G080800--Sobic009G098400 Sobic004G080800--Sobic006G173400 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic004G080800--Sobic004G187400 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic004G080800--Sobic010G190500 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic004G080800--Sobic010G257800 Sobic002G061300 Sobic002G061300 Sobic004G080800--Sobic002G061300 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic004G080800--Sobic005G214700 Sobic006G173400--Sobic003G114800 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic006G173400--Sobic004G091000 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic006G173400--Sobic005G000200 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic006G173400--Sobic002G128700 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic006G173400--Sobic008G102850 Sobic008G079200 Sobic008G079200 Sobic006G173400--Sobic008G079200 Sobic006G173400--Sobic003G147700 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic006G173400--Sobic007G103000 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic006G173400--Sobic005G065300 Sobic006G270800--Sobic002G427500 Sobic006G270800--Sobic006G127800 Sobic006G270800--Sobic003G147700 Sobic006G270800--Sobic003G232100 Sobic006G270800--Sobic003G009600 Sobic006G270800--Sobic005G122100 Sobic006G270800--Sobic009G089000 Sobic006G270800--Sobic003G114800 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic006G270800--Sobic009G090400 Sobic003G114800--Sobic004G091000 Sobic003G114800--Sobic003G147700 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic003G114800--Sobic007G134260 Sobic003G114800--Sobic005G000200 Sobic003G114800--Sobic007G103000 Sobic003G114800--Sobic003G232100 Sobic003G114800--Sobic006G270800 Sobic003G114800--Sobic008G079200 Sobic003G114800--Sobic005G122100
Octagon: transcription factors


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